mRNR seka (NGS) – nauja

mRNR sekos nustatymas leidžia profiliuoti visus mRNR transkriptus ląstelėse tam tikromis sąlygomis ir yra plačiai naudojama technologija įvairiose tyrimų srityse. BMKCloud De novo mRNA-seq vamzdynas skirtas analizuoti poli-A praturtintas sekos bibliotekas, kai nėra pamatinio genomo. Dujotiekis prasideda kokybės kontrole, po kurios sekade novostenogramos surinkimas ir unigene rinkinio parinkimas. Unigeninės struktūros analizė numato kodavimo seką (CDS) ir paprastus sekos kartojimus (SSR). Vėliau diferencinės ekspresijos analizė randa skirtingai išreikštus genus (DEG) tarp išbandytų sąlygų, po to atliekama funkcinė anotacija ir DEG praturtinimas, siekiant gauti biologines įžvalgas.