
lncrNR
Ilgos nekoduojančios RNR (LNCRNR) yra RNR ilgesnės nei 200 nukleotidų, turinčių mažą kodavimo potencialą, tačiau turinčios kritines reguliavimo funkcijas. „BMKCloud LNCRNR“ vamzdynas yra skirtas analizuoti rRNR išeikvotas bibliotekas, turinčias aukštos kokybės, gerai anotuotą etaloninį genomą, analizuojant LNCRNR ir mRNR ekspresiją kartu. Po perskaitymo apipjaustymo ir kokybės kontrolės skaitymai yra suderinti su etaloniniu genomu, kad būtų surinkti nuorašai, o vėlesnė genų struktūros analizė atskleidžia alternatyvius sujungimo ir naujus genus. Nuorašai identifikuojami kaip mRNR arba lncRNR, o diferencinės išraiškos analizė nustato skirtingai išreikštas lncRNR, jų taikinius ir skirtingai išreikštus genus (DEG). Tiek DEG, tiek diferencijuotai išreikšti LNCRNR taikiniai yra funkciškai anotuoti, kad būtų galima rasti praturtintas funkcines kategorijas.
Bioinformatika
