Eukariotų mRNR sekos nustatymas-NG
Savybės
● Poli mRNR užfiksavimas prieš paruošiant biblioteką
● Pasirenkamas kryptinio mRNR bibliotekos paruošimas, kad būtų galima gauti sruogų sekos nustatymo duomenis
● Bioinformatinė genų ekspresijos analizė ir nuorašo struktūra
Privalumai
●Didelė patirtis: Mūsų komanda apdorojo daugiau nei 600 000 mėginių Bmkgene, apimančią įvairius mėginių tipus, tokius kaip ląstelių kultūros, audiniai ir kūno skysčiai. Kiekvienam projektui mes įtraukiame didelę patirtį ir sėkmingai įgyvendinome daugiau nei 100 000 mRNR-SEQ projektų įvairiose tyrimų srityse.
●Griežta kokybės kontrolė: Mes įgyvendiname pagrindinius kontrolės taškus visuose etapuose, pradedant nuo mėginių ir bibliotekos paruošimo iki sekos nustatymo ir bioinformatikos. Šis kruopštus stebėjimas užtikrina nuolat aukštos kokybės rezultatus, užtikrinant, kad jūsų projektas yra patikimose rankose.
●Išsami anotacija: Mes naudojame kelias duomenų bazes, kad funkciškai komentuojame skirtingai išreikštus genus (DEG) ir atliekame atitinkamą praturtinimo analizę. Šis išsamus požiūris suteikia įžvalgos apie ląstelių ir molekulinius procesus, kuriais grindžiamas transkripto atsakas, užtikrinant, kad esate visiškai informuoti apie savo projekto rezultatus.
●Palaikymas po pardavimo: Mūsų įsipareigojimas apima ne tik projekto pabaigą su 3 mėnesių aptarnavimo laikotarpiu po pardavimo. Per tą laiką mes siūlome projekto tolesnius veiksmus, pagalbą trikčių šalinimui ir klausimų ir atsakymų sesijoms, kad išspręstume bet kokius su rezultatus susijusius klausimus.
Imties reikalavimai ir pristatymas
| Biblioteka | Sekos strategija | Rekomenduojami duomenys | Kokybės kontrolė |
| Poli a praturtintas | „Illumina PE150“ DNBSEQ-T7 | 6–10 GB | Q30≥85% |
Imties reikalavimai:
Nukleotidai:
| Konc. (Ng/μl) | Kiekis (μg) | Grynumas | Vientisumas | |
| Standartinė biblioteka | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7–2,5 OD260/230 = 0,5–2,5 Ribotas baltymų ar DNR užterštumas, parodytas ant gelio. | Augalams: RIN ≥ 4,0; Gyvūnams: RIN ≥4,5; 5,0≥28S/18S ≥1,0; Ribotas arba jo nėra pradiniame aukštyje |
| Kryptinė biblioteka | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7–2,5 OD260/230 = 0,5–2,5 Ribotas baltymų ar DNR užterštumas, parodytas ant gelio. | Augalams: RIN ≥ 4,0; Gyvūnams: RIN ≥4,5; 5,0≥28S/18S ≥1,0; Ribotas arba jo nėra pradiniame aukštyje |
● Augalai:
Šaknis, kamienas ar žiedlapis: 450 mg
Lapai ar sėkla: 300 mg
Vaisiai: 1,2 g
●Gyvūnas:
Širdis ar žarnynas: 300 mg
Vėžė arba smegenys: 240 mg
Raumenys: 450 mg
Kaulai, plaukai ar oda: 1G
● Narofodai:
Vabzdžiai: 6g
Crustacea: 300 mg
● Visas kraujas: 1 vamzdis
● Ląstelės: 106 ląstelės
Rekomenduojamas pavyzdžių pristatymas
Konteineris: 2 ml centrifugos vamzdis (alavo folija nerekomenduojama)
Imties ženklinimas: grupė+pakartoja EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Siunta:
1. Sausas ledas: mėginius reikia supakuoti į maišus ir palaidoti sauso ledo.
2. RNAS lentelės vamzdeliai: RNR mėginius galima džiovinti RNR stabilizavimo vamzdyje (pvz., RNASTABLE®) ir išsiunčiami kambario temperatūroje.
Aptarnavimo darbo srautas
Eksperimento dizainas
Mėginio pristatymas
RNR ekstrahavimas
Bibliotekos statyba
Sekos nustatymas
Duomenų analizė
Paslaugos po pardavimo
Bioinformatika
Eukariotas mRNR sekos analizės darbo eiga
Bioinformatika
ØNeapdorotas duomenų kokybės kontrolė
ØEtaloninis genomo suderinimas
ØNuorašo struktūros analizė
ØIšraiškos kiekybinis įvertinimas
ØDiferencinė išraiškos analizė
ØFunkcijos anotacija ir praturtinimas
Etaloninis genomo suderinimas
Duomenų prisotinimas
Imties koreliacija ir biologinių pakartojimų įvertinimas
Diferencijuotai išreikšti genai (DEG)
Funkcinis DEG anotacija
Funkcinis DEG praturtinimas
Ištirkite pažangą, kurią palengvina Bmkgene eukariotų NGS mRNR sekos nustatymo paslaugos per kurtą leidinių kolekciją.
Huang, L. et al. (2023 m.) „Triclosan ir Triclocarban susilpnina auksinės žuvelės uoslės pajėgumą, ribodami kvapiųjų atpažinimą, sutrikdydami uoslės signalo perdavimą ir nerimą keliantį uoslės informacijos apdorojimą“, Vandens tyrimai, 233, p. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ ir kt. (2023 m.) „Aspergillus fumigatus pagrobia žmogaus P11 į nukreiptą grybelinį fagosomas į nepagrįstą kelią“, ląstelių šeimininkas ir mikrobas, 31 (3), p. 373–388.E10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) „TCP transkripcijos veiksniai, susiję su Ma bambuko ūglių vystymuisi (Dendrocalamus latiflorus munro)“, Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. et al. (2022) „Chrizantemos lavandulifolium genomas ir molekulinio mechanizmas, grindžiamas įvairių kapitulų tipų“, sodininkystės tyrimai, 9. doi: 10.1093/hr/uhab022.
Zhang, Yujie ir kt. (2023 m.) „Kaskadinis nanoreaktorius, skirtas sustiprinti sonodinaminį gydymą gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu per sinergetinį ROS padidėjimą ir autofagijos užsikimšimą“, Nano šiandien, 49, p. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
