DNBSEQ iš anksto sukurtos bibliotekos
Savybės
●Platforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Sekos režimai:PE150
●Illumina bibliotekų perkėlimas įMGI:leidžia mažomis sąnaudomis nustatyti didelius duomenų kiekius.
●Bibliotekų kokybės kontrolė prieš sekos nustatymą.
●Sekos duomenų QC ir pristatymas:QC ataskaitos ir neapdorotų duomenų pristatymas fastq formatu po demultipleksavimo ir filtravimo Q30 skaitymai.
Privalumai
●Sekvenavimo paslaugų universalumas:klientas gali pasirinkti sekti pagal juostą arba duomenų kiekį.
●Didelė duomenų išvestis:1500 Gb / juosta
●Sekos kokybės kontrolės ataskaitos pristatymas:su kokybės metrika, duomenų tikslumu ir bendru sekos projekto našumu.
●Brandaus sekos sudarymo procesas:su trumpu apsisukimo laiku.
●Griežta kokybės kontrolė: įgyvendiname griežtus kokybės kontrolės reikalavimus, kad garantuotume nuolat kokybiškų rezultatų pristatymą.
Pavyzdiniai reikalavimai
| Duomenų kiekis (X) | Koncentracija (qPCR/nM) | Apimtis | |
| Dalinė juosta
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Viena juosta | Per Lane | ≥ 1,5 nM / bibliotekos telkinys | ≥ 25 μl / bibliotekos baseinas |
Be koncentracijos ir bendro kiekio, taip pat reikalingas tinkamas piko modelis.
Pastaba: Mažos įvairovės bibliotekų juostų sekos nustatymui reikalingas PhiX spike-in, kad būtų užtikrintas tvirtas bazinis iškvietimas.
Rekomenduojame pateikti iš anksto sukauptas bibliotekas kaip pavyzdžius. Jei jums reikia, kad BMKGENE atliktų bibliotekos kaupimą, žr
bibliotekos reikalavimai daliniam juostų sekvenavimui.
Bibliotekos dydis (viršūnių žemėlapis)
Pagrindinė smailė turėtų būti 300–450 bp.
Bibliotekos turi turėti vieną pagrindinę smailę, be adapterio užteršimo ir jokių pradmenų dimerų.
Paslaugos darbo eiga
Bibliotekos kokybės kontrolės ataskaita
Bibliotekos kokybės ataskaita pateikiama prieš nustatant seką, įvertinant bibliotekos kiekį ir fragmentiškumą.
Sekos kokybės kontrolės ataskaita
1 lentelė. Sekvenavimo duomenų statistika.
| Pavyzdžio ID | BMKID | Neapdoroti skaitiniai | Neapdoroti duomenys (bp) | Švarus skaitymas (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 val |
1 pav. Kokybės pasiskirstymas pagal rodmenis kiekviename pavyzdyje
2 pav. Bazinio turinio paskirstymas
3 pav. Skaitomo turinio pasiskirstymas sekos duomenyse
