CircrNR sekos iliusnacija
Savybės
● RRNR išeikvojimas, po kurio seka kryptinis bibliotekos paruošimas, įgalinant sruogų sekos nustatymo duomenis.
● Bioinformatinė darbo eiga įgalina circrNR numatymą ir išraiškos kiekybinį įvertinimą
Aptarnavimo pranašumai
●Išsamesnės RNR bibliotekos:Mes naudojame rRNR išeikvojimą, o ne linijinį RNR išeikvojimą, atlikdami ikimokyklinį preparatą, užtikrindami, kad sekos nustatymo duomenys apima ne tik circRNR, bet ir mRNR bei lncRNR, leidžiančią bendrai analizuoti šiuos duomenų rinkinius analizę.
●Pasirenkama konkurencinių endogeninių RNR (CERNA) tinklų analizė: Suteikia gilesnes įžvalgas apie ląstelių reguliavimo mechanizmus
●Didelė patirtis: „Bmkgene“ apdorojant daugiau nei 20 000 pavyzdžių, apimančių įvairius mėginių tipus ir LNCRNR projektus, mūsų komanda suteikia daug patirties kiekvienam projektui.
●Griežta kokybės kontrolė: Mes įgyvendiname pagrindinius kontrolės taškus visuose etapuose, pradedant nuo mėginių ir bibliotekos paruošimo iki sekos nustatymo ir bioinformatikos. Šis kruopštus stebėjimas užtikrina nuolat aukštos kokybės rezultatus.
● Palaikymas po pardavimo: Mūsų įsipareigojimas apima ne tik projekto pabaigą su 3 mėnesių aptarnavimo laikotarpiu po pardavimo. Per tą laiką mes siūlome projekto tolesnius veiksmus, pagalbą trikčių šalinimui ir klausimų ir atsakymų sesijoms, kad išspręstume bet kokius su rezultatus susijusius klausimus.
Imties reikalavimai ir pristatymas
| Biblioteka | Platforma | Rekomenduojami duomenys | Duomenys QC |
| rRNR išeikvojama kryptinė biblioteka | „Illumina PE150“ | 16-20 GB | Q30≥85% |
Imties reikalavimai:
Nukleotidai:
| Konc. (Ng/μl) | Kiekis (μg) | Grynumas | Vientisumas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7–2,5 OD260/230 = 0,5–2,5 Ribotas baltymų ar DNR užterštumas, parodytas ant gelio. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S ≥1,0; Ribotas arba jo nėra pradiniame aukštyje |
● Augalai:
Šaknis, kamienas ar žiedlapis: 450 mg
Lapai ar sėkla: 300 mg
Vaisiai: 1,2 g
● Gyvūnas:
Širdis ar žarnynas: 450 mg
Vėžė arba smegenys: 240 mg
Raumenys: 600 mg
Kaulai, plaukai ar oda: 1,5 g
● Narofodai:
Vabzdžiai: 9g
Crustacea: 450 mg
● Visas kraujas:2 vamzdžiai
● Ląstelės: 106 ląstelės
● Serumas ir plazma: 6 ml
Rekomenduojamas pavyzdžių pristatymas
Konteineris: 2 ml centrifugos vamzdis (alavo folija nerekomenduojama)
Imties ženklinimas: grupė+pakartoja EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Siunta:
1. Sausas ledas: mėginius reikia supakuoti į maišus ir palaidoti sauso ledo.
2. RNASTATS vamzdeliai: RNR mėginius galima džiovinti RNR stabilizavimo vamzdyje (pvz., RNastable®) ir išsiųsti kambario temperatūroje.
Aptarnavimo darbo srautas
Eksperimento dizainas
Mėginio pristatymas
RNR ekstrahavimas
Bibliotekos statyba
Sekos nustatymas
Duomenų analizė
Paslaugos po pardavimo
Bioinformatika
CircrNR prognozė: chromosomų pasiskirstymas
Diferencijuotai išreikštos circrNR - ugnikalnio grafikas
Diferencijuotai išreikštos circrNR - hierarchinis klasterizavimas
Funkcinis circrNR šeimininkų genų praturtinimas
Ištirkite tyrimų pažangą, kurią palengvino „Bmkgene“ circrNR sekos nustatymo paslaugos per kuruojamą leidinių kolekciją.
Wang, X. et al. (2021) „CPSF4 reguliuoja circrNR formavimąsi ir mikroRNR tarpininkaujant genų nutildymui kepenų ląstelių karcinomoje“, Oncogene 2021 40:25, 40 (25), p. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'X oo reaguojantis transkriptomas atskleidžia apskrito RNR133 vaidmenį atsparumui ligai, reguliuodamas osarabo ekspresiją ryžiuose', Fitopatologijos tyrimai, 5 (1), p. 1–14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/paveikslai/6.
Y, H. ir kt. (2023) „CPSF3 moduliuoja žiedinių ir linijinių nuorašų pusiausvyrą kepenų ląstelių karcinomoje“. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) „Išsamus circrNR įvertinimas cirozinės kardiomiopatijos metu prieš ir po kepenų transplantacijos“, Tarptautinė imunofarmakologija, 114, p. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
