
CircRNA
Žiedinės RNR (cirRNR) yra nekoduojančios RNR, kurios sudaro žiedines struktūras ir atlieka daugybę reguliavimo vaidmenų, įskaitant konkuravimą su miRNR dėl tikslinių genų ir prisijungimo prie baltymų. BMKCloud circRNA vamzdynas skirtas analizuoti rRNR išeikvotas bibliotekas su gerai anotuotu ir aukštos kokybės etaloniniu genomu. Analizė prasideda skaitymo apipjaustymu ir kokybės kontrole, po to nuskaitymo suderinimas su etaloniniu genomu ir naujų cirRNR numatymas, kartu su žinomų cirRNR identifikavimu iš duomenų bazių. Vėliau nustatomi atitinkami miRNR taikiniai ir cirRNR šeimininkai. Diferencinė ekspresijos analizė atskleidžia skirtingai išreikštas cirRNR, o atitinkami šeimininkai yra funkciškai anotuoti, kad būtų galima išgauti praturtintas biologines funkcijas.
Bioinformatika
