ວິວັດທະນາການທີ່ແທ້ຈິງ
ເປັຍ
ຕົ້ນກໍາເນີດແລະປະຫວັດສາດການລ້ຽງສັດຂອງປາ (Bassassus Auratus)
Pacbio | Illumina | ແຜນທີ່ genome Bionano | ສະບາຍດີ Hi-C Genome | ແຜນທີ່ພັນທຸກໍາ | gwas | rna-seq
ຈຸດເດັ່ນ
1.goldfish genome ໄດ້ຖືກປັບປຸງດ້ວຍລຸ້ນສະພາທີ່ມີຄຸນນະພາບສູງ, ມີຂະຫນາດ 95,75% ຂອງ cseudochromosomes (scaffold n50 = 31.84 MB). ສອງສະຕິຍ່ອຍໄດ້ຖືກສູນເສຍ.
2.Genomic Signitions ຂອງການເລືອກທີ່ເລືອກໃນໄລຍະພາຍໃນປະເທດໄດ້ຖືກກໍານົດຈາກຂໍ້ມູນທາງດ້ານການຄ້າຂອງ 201 ສ່ວນບຸກຄົນ, ບໍ່ເປີດເຜີຍຕໍ່ກັບລັກສະນະພາຍໃນປະເທດ.
3.Gwas ກ່ຽວກັບການຫາຍໃຈຂອງປາໃນປາທີ່ລ້ຽງໃນປະເທດໄດ້ເປີດເຜີຍພັນທຸກໍາຂອງຜູ້ສະຫມັກ 378 ຄົນທີ່ມີຄວາມກ່ຽວຂ້ອງ. ນັກຂ່າວ KinSine-Catein-Protin ໄດ້ຖືກລະບຸວ່າເປັນຜູ້ສະຫມັກທີ່ມີສະຕິປັນຍາ Causal ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບຄວາມໂປ່ງໃສ
ພື້ນຫລັງ
Goldfish (Bassietus Auratus) ແມ່ນຫນຶ່ງໃນປາທີ່ມີກະສິກໍາທີ່ສໍາຄັນທີ່ສຸດ, ເຊິ່ງໄດ້ຖືກລ້ຽງສັດຈາກຊັ້ນເຂດຮ້ອນໃນປະເທດຈີນບູຮານ. ພວກເຂົາໄດ້ຮັບຄໍາເຫັນໂດຍ Charles Darwein ເປັນ "ຜ່ານຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງສີທີ່ເກືອບບໍ່ມີຂອບເຂດ, ພວກເຮົາພົບກັບການດັດແປງໂຄງສ້າງທີ່ພິເສດທີ່ສຸດ". ຄຸນລັກສະນະທີ່ຫຼາກຫຼາຍແລະປະຫວັດຄວາມເປັນມາຂອງການປູກຝັງແລະການປັບປຸງພັນໆເຮັດໃຫ້ເປັນຕົວ goldfish ເປັນລະບົບພັນທຸກໍາທີ່ດີເລີດສໍາລັບ physiology ແລະວິວັດທະນາການ.
ຜົນສໍາເລັດ
goldfish goldfish
Jການວິເຄາະ OININ ຂອງ PACBIO ແລະຈຸດປະສົງຂອງຄູ່ Illumina ໃຫ້ຜົນຕອບແທນການສະຫນັບສະຫນູນດ້ານຮ່າງກາຍ 1.657 G.657 G. (Contig N50 = 474 KB). ແຜນທີ່ຂອງ Bionano optano ໄດ້ຖືກຜະລິດແລະແກ້ໄຂບັນຈຸການປະຊຸມເປັນຂະຫນາດ 1,73 GB ໃນຂະຫນາດ gb (ຄາດຄະເນຂະຫນາດ Genietimated: 1.8 GB). ສະມາຊິກ HI-C ເພີ່ມເຕີມຕື່ມອີກໃນ 606 KB ເຖິງ 31,84 MB ແລະບັນລຸໄດ້ 95,75% (1.65 GB) ຮັດກຸມແລະອັດຕາການຈອດເຮືອ. GENTOME ປະກອບດ້ວຍລະຫັດ 56,251 EVEE COTS ແລະ 10,098 Transfript Long. ຍິ່ງໄປກວ່ານັ້ນ, 38 ເຂດ Centrosic ທີ່ມີທ່າແຮງ 38 ໄດ້ຖືກຄາດຄະເນອອກມາຈາກໂຄໂມໂຊມ 50 ໂຄຣໂມໂຊມ.
ຄໍາວ່າຄໍາ GOLI ຄໍາ
TWI Crawity Sets Subgenomes ໄດ້ຖືກກໍານົດໃນໂຄໂມໂຊມ 50 ໂຕທີ່ເປັນຜົນມາຈາກເຫດການປະສົມປະສານເກົ່າແກ່. ຊຸດຂອງໂຄໂມໂຊມທີ່ມີອັດຕາສ່ວນທີ່ສູງກວ່າຂອງການອ່ານທີ່ສອດຄ່ອງກັນລະຫວ່າງ goldfish ແລະ A25),
ຕົວກວາດລ້າງພາຍໃນແລະເລືອກ
Aຈໍານວນທັງຫມົດຂອງ 16 carps crucian ປະເພດທໍາມະຊາດແລະ 185 ຈໍານວນຕົວແທນຈໍານວນຫນຶ່ງທີ່ມີການປ່ຽນແປງໄດ້ຮັບການແບ່ງປັນຄວາມເລິກຂອງປະມານ 12.5x, ການຜະລິດຂໍ້ມູນ 4.3 Terabases. ການສ້າງສັນ Phylogenetic Reconstruction ແລະ PCA ໄດ້ຢືນຢັນຄວາມສໍາພັນທີ່ໃກ້ຊິດລະຫວ່າງຊັ້ນ Goldfish ແລະ Crucian Carp ທົ່ວໄປ, ເຊິ່ງສຸດທ້າຍໄດ້ແບ່ງອອກເປັນສອງເສັ້ນ.
Lການວິເຄາະທີ່ເສື່ອມໂຊມຢູ່ຂ້າງເທິງສີ່ subpopulations ໄດ້ຮັບການສະຫນັບສະຫນູນການມີຢູ່ຂອງການກໍາຈັດພັນທຸກໍາຂອງພົນລະເມືອງໃນລະຫວ່າງການເລືອກທຽມພາຍໃນແລະທີ່ເຂັ້ມແຂງໃນ Goldfish. ເພີ່ມຄວາມຫຼາກຫຼາຍທາງພັນທຸກໍາ (π) ຈາກ parbi ສາມັນຕໍ່ໄປອີກຕໍ່ໄປເພື່ອ wen goldfish ແລະ goldfish goldfish ສະແດງເຖິງການສະສົມທາງພັນທຸກໍາໃນໄລຍະການປ່ຽນແປງທາງພັນທຸກໍາໃນໄລຍະພາຍໃນປະເທດ. 50 ພັນທຸກໍາຂອງໂປຣແກຣມເສີມທີ່ເລືອກໄດ້ກວມເອົາ 25,2 MB ແລະ 946 Genes ໄດ້ຖືກກໍານົດຈາກຂໍ້ມູນຕົວແທນ (33 goldfish ແລະ 16 crucian). ການວິເຄາະການວິເຄາະໄປທີ່ 201RES, 393 ພັນທຸກໍາໄດ້ຊີ້ບອກເຖິງຕົວກວາດທີ່ເລືອກສໍາເລັດ. ພັນທຸກໍາເຫລົ່ານີ້ໄດ້ຖືກພົບເຫັນວ່າມີຄວາມຫຼາກຫຼາຍຕ່ໍາ, ເຊິ່ງມີສ່ວນຮ່ວມໃນ phenotypes ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບລັກສະນະພາຍໃນປະເທດທີ່ສໍາຄັນໃນ goldfish.
FIFF.3 ການວິເຄາະທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບທົ່ວໂລກ
Gwas ກ່ຽວກັບປາຄໍາພາຍໃນປະເທດ
Dorsal final ແມ່ນຄຸນນະສົມບັດທີ່ສໍາຄັນຈໍານວນ wen goldfish ຈາກໄຂ່ goldfish. Gwas of Dorsal Fin ໃນຈໍານວນ 96 goldfish ໄຂ່ແລະ 87 ໂຕ goldfish ໄຂ່ໄດ້ແຜ່ລາມອອກໄປທົ່ວປະເທດທີ່ເກີດຂື້ນ 1378 ຄົນແລະການແຈກຢາຍແບບບໍ່ເທົ່າກັນລະຫວ່າງບັນດາຕົວຍ່ອຍ. ການວິເຄາະທີ່ເປັນປະໂຫຍດກ່ຽວກັບຜູ້ສະຫມັກຜູ້ສະຫມັກເຫຼົ່ານີ້ໄດ້ຍົກໃຫ້ເຫັນຂະບວນການດ້ານຊີວະວິທະຍາລວມທັງ "ສັນຍານຮັບສັນຍານຊັ້ນ", "ການພັດທະນາ TranslirEal", ແລະອື່ນໆ. "
FIG.4 GWAS ຂອງ Dorsal Fin On Goldfish
IN Gwas ຂອງລັກສະນະທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບໂປ່ງໃສ, ເຊິ່ງເປັນສະມາຄົມທີ່ແຂງແຮງສູງສຸດທີ່ຖືກກວດພົບ. A Geno encoreding ຜູ້ຮັບເອົາທາດໂປຼຕີນຈາກ tyrosine-proteid ໄດ້ຖືກກໍານົດໃນຂົງເຂດຜູ້ສະຫມັກຄົນຫນຶ່ງ.
ຕົວເລກ5 Gwas ຂອງຄຸນລັກສະນະທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບໂປ່ງໃສ
ເອກະສານອ້າງອີງ
Chen d et al. ຕົ້ນກໍາເນີດແລະປະຫວັດສາດທີ່ມີຢູ່ໃນປະຫວັດສາດຂອງ Goldfish (Carassius Auratus). Pnas (2020)
ຂ່າວ ຈຸດປະສົງໃນການແບ່ງປັນຄະດີທີ່ປະສົບຜົນສໍາເລັດລ້າສຸດກັບ Tech Technologies, ການຈັບຜົນສໍາເລັດທາງວິທະຍາສາດນະວະນິຍາຍພ້ອມທັງເຕັກນິກທີ່ໂດດເດັ່ນທີ່ນໍາໃຊ້ໃນລະຫວ່າງການສຶກສາ.
ເວລາໄປສະນີ: Jan-04-2022