ການສືບສວນ DNA / RNA - Nanepore Sequencer
ຄຸນລັກສະນະລາຍລະອຽດຂອງການບໍລິການ
| ຊານ | ຂະຫນາດຫ້ອງສະຫມຸດ | ຜົນຜະລິດຂໍ້ມູນດ້ານທິດສະດີ (ຕໍ່ຈຸລັງ) | ຄວາມຖືກຕ້ອງຂອງຖານດຽວ | ຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ |
| Nanepore | 8kb, 10kb, 20kb, ultraLong, CDNA-PCR | 70-90GB / CELL | 85-92% | SV ຮຽກຮ້ອງ, de Novo, ລໍາດັບຄວາມຍາວເຕັມ, iso-seq, anenation Gene, Gene, ການຊອກຄົ້ນຫາຂອງ DNA methylation |
ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ
●ປະສົບການຫຼາຍກວ່າ 5 ປີໃນເວທີຢຸດງານຂອງ Pacbio ທີ່ມີໂປແກຼມທີ່ປິດຫລາຍພັນລາຍການດ້ວຍຊະນິດພັນຕ່າງໆ.
● BMKGENE ແມ່ນຄູ່ຮ່ວມງານທີ່ເປັນທາງການຂອງ Oxford Nanepore, ມີເວທີສອງຄັ້ງ RNA / DNA ໃບຢັ້ງຢືນສອງຄັ້ງ.
●ມີຮູບແບບຕົ້ນຕໍຂອງລໍາດັບທີ່ມີອຸປະກອນຄົບຖ້ວນສົມບູນແລະມີລໍາດັບທີ່ພຽງພໍ.
●ອີງໃສ່ເວທີ Nanopore, ການຄົ້ນຄ້ວາສັດຫຼາຍກ່ວາ 10 ຄົນໄດ້ຖືກເຜີຍແຜ່ໃນວາລະສານທີ່ມີຊື່ສຽງລະດັບສາກົນ.
ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ
| ປະເພດຕົວຢ່າງ | ຈໍານວນ | ຄວາມປອດໄພ (ຄວາມປອດໄພ®) | ປະລິມານ | ອັດຊາຍະ | ອື່ນໆ |
| DNA Genomic | ຂື້ນກັບຄວາມຕ້ອງການຂອງຂໍ້ມູນ | ≥20ng / μL | ≥15μl | od260 / 280 = 1.7-2.2; od260 / 230≥1.5; Clear Peak ທີ່ 260 NM, ບໍ່ມີການປົນເປື້ອນ | ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນທີ່ຕ້ອງໄດ້ຮັບການວັດແທກໂດຍຊາວເກັດແລະເກົາຫຼີແລະ Nanopore ≤ 2 |
| ທັງຫມົດ rna | ≥1.2.2UG | ≥100μg / μL | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.5; od260 / 230 = 0.5-2.5; ບໍ່ມີການປົນເປື້ອນ | ມູນຄ່າ RIN ≥7.5 |
ຂະບວນການເຮັດວຽກ
ການກະກຽມຕົວຢ່າງ
ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ
ລໍາດັບຄວາມປອດໄພ
ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ
ການຈັດສົ່ງໂຄງການ
ການປະເມີນຄຸນນະພາບຂອງຂໍ້ມູນຂອງຕົວຢ່າງ DNA
ຕາຕະລາງ 1. ສະຖິຕິກ່ຽວກັບຂໍ້ມູນທີ່ສະອາດ.
| ຄາເຮືອນ | ຢາງພາລາ | rawsumbase | CleasSeqnum | ຄວາມສະອາດ | ທໍາຄວາມສະອາດ | ທໍາລາຍ | ທໍາລາຍປີ | ເຄື່ອງເຮັດຄວາມສະອາດ | ອະນາໄມ |
| DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
ການປະເມີນຄຸນນະພາບຂອງຂໍ້ມູນຂອງຕົວຢ່າງ RNA
ຕາຕະລາງ 1. ສະຖິຕິກ່ຽວກັບຂໍ້ມູນທີ່ສະອາດ.
| ຊື່ສຽງ | ລູກຄ້າ | ຜູ້ຢິງປັບອາກາດ | ອະທິເຫດ | n50 | ຫມາຍຄວາມວ່າ | Maxlength | ຫມາຍຄວາມວ່າ |
| rna_bmk001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
ຮູບ 1. ອ່ານການແຈກຈ່າຍຄວາມຍາວ
ຮູບທີ 2. ຄະແນນທີ່ມີຄຸນນະພາບການແຈກຢາຍຂໍ້ມູນທີ່ສະອາດ
ຮູບທີ 3. ຄວາມຍາວແລະຄະແນນຄຸນນະພາບການແຈກຢາຍຂໍ້ມູນທີ່ສະອາດ
