16s / 18s / sequencing amplicon ຂອງຕົນ-pacbio
ຄຸນນະສົມບັດການບໍລິການ
●ແພລະຕະຟອມລໍາດັບ: Pacbio Revio
mode ແບບລໍາດັບ: CCS (HIFI ອ່ານ)
●ຂະຫຍາຍຕົວຂອງເຂດເປົ້າຫມາຍໄດ້ຕິດຕາມໂດຍການເຊື່ອມຕໍ່ amplicons ກ່ອນການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ hifi smart
ຂໍ້ໄດ້ປຽບການບໍລິການ
●ຄວາມລະອຽດຂອງພາສີທີ່ສູງກວ່າ: than sequencing ສັ້ນ ampliccing,ເຮັດໃຫ້ອັດຕາການຈັດປະເພດ OTU ສູງຂື້ນໃນລະດັບສັດ.
●ການໂທຫາທີ່ຖືກຕ້ອງສູງ: ຮູບແບບ Pacbio CCS CCS Sequencing (HIFI ອ່ານ).
●ການໂດດດ່ຽວໂດຍບໍ່ເສຍຄ່າ: ການກໍານົດສ່ວນປະກອບຂອງຈຸລິນຊີຢ່າງໄວວາໃນຕົວຢ່າງສິ່ງແວດລ້ອມ.
●ສາມາດໃຊ້ໄດ້ຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ການສຶກສາຊຸມຊົນດ້ານຈຸລິນຊີທີ່ຫລາກຫລາຍ.
●ການວິເຄາະ biominformatic ທີ່ສົມບູນແບບ: ຊຸດ qiime2 ຫຼ້າສຸດ (ມີຄວາມເຂົ້າໃຈດ້ານປະລິມານກ່ຽວກັບລະບົບນິເວດວິທະຍາ) ດ້ວຍການວິເຄາະທີ່ຫຼາກຫຼາຍໃນແງ່ຂອງຖານຂໍ້ມູນ, attuotation, otu / asv.
●ຄວາມຊ່ຽວຊານຢ່າງກວ້າງຂວາງ: ດ້ວຍຫລາຍພັນໂຄງການທີ່ມີປະສິດຕິຜົນສູງຂອງ amplicon ປະຈໍາປີ, BMKGENE ເອົາປະສົບການໃນທົດສະວັດ, ທີມງານວິເຄາະທີ່ມີຄວາມຊໍານິຊໍານານ, ແລະການສະຫນັບສະຫນູນດ້ານຫຼັງທີ່ສົມບູນແບບ.
ຂໍ້ສະເພາະຂອງການບໍລິການ
| ຫໍສະຫມຸດ | ຍຸດທະສາດການລຽງລໍາດັບ | ຂໍ້ມູນແນະນໍາ |
| amplicon | PACBIO REVIO | 10/30/50 k tags (CCS) |
ຄວາມຕ້ອງການຕົວຢ່າງ
| ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນ (NG / μL) | ຈໍານວນທັງຫມົດ (μg) | ປະລິມານ (μL) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງທີ່ແນະນໍາ
ປ່ອຍຕົວຢ່າງໃນ nitrogen ແຫຼວສໍາລັບ 3-4 ຊົ່ວໂມງແລະເກັບຮັກສາໃນ Nitrogen ຂອງແຫຼວຫຼື -80 ໃນໄລຍະເວລາໃນໄລຍະຍາວ. ການຂົນສົ່ງແບບຢ່າງທີ່ມີກ້ອນແຫ້ງແມ່ນຕ້ອງມີ.
ກະແສການເຮັດວຽກບໍລິການ
ການຈັດສົ່ງຕົວຢ່າງ
ການກໍ່ສ້າງຫໍສະຫມຸດ
ລໍາດັບຄວາມປອດໄພ
ການວິເຄາະຂໍ້ມູນ
ບໍລິການຫລັງການຂາຍ
ປະກອບມີການວິເຄາະຕໍ່ໄປນີ້:
●ຄວບຄຸມຄຸນນະພາບຂອງຂໍ້ມູນດິບ
●ກຸ່ມບ້ານ OTU / de-detising (ASV)
ant attu attiveen
●ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງ Alpha: ຫລາຍດັດສະນີ, ລວມທັງ Shannon, Simpson ແລະ Ace.
●ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງ Beta
●ການວິເຄາະລະຫວ່າງກຸ່ມ
●ການວິເຄາະການເຊື່ອມໂຍງ: ລະຫວ່າງປັດໃຈດ້ານສິ່ງແວດລ້ອມແລະການປະກອບແລະຄວາມຫຼາກຫຼາຍ
● 16s ການຄາດຄະເນການເຮັດວຽກທີ່ເປັນປະໂຫຍດ
histogram ຂອງການແຈກຢາຍພາສີ
ການແຈກຢາຍຕົ້ນໄມ້ phylogenetic ຊຸມຊົນ
ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງ Alpha: ນ້ອຍດຽວ
ສາລະບານ
ການວິເຄາະຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງ Beta: Pcoa
ການວິເຄາະການກວດສອບ Intergroup: Anova
ສໍາຫຼວດຄວາມກ້າວຫນ້າທີ່ອໍານວຍຄວາມສະດວກດ້ານການບໍລິການຂອງ ampliccing ຂອງ ampliccing ຂອງ ampliccing ກັບ Pacbio ໂດຍຜ່ານການເກັບກໍາຂໍ້ມູນທີ່ເກັບກ່ຽວ.
GAO, X. ແລະ Wang, H. (2023) 'ການປັບປຸງອາການຂອງ Alpine Merino ໃນໄລຍະທີ່ແຕກຕ່າງກັນໃນການປູກຕົ້ນໄມ້ alpine', 9 ( 1), p. 16. DOI: 10.3390 / Ferementation9010016 / S1.
Li, S. et al. (2023) 'ຈັບເອົາບັນຫາທີ່ມືດມົນໃນດິນແດນຂອງທະເລໂດຍໃຊ້ meticenomics Desert ໂດຍໃຊ້ meticenomics ທີ່ໃຊ້ໃນການໃຊ້ງານ micolumicics ແລະ micofilms ແລະ microfioms 523 9: 1, 1), PP. 1-14. DOI: 10.1038 / S41522-023-00439-8.
MU, L. et al. (2022) 'ຜົນກະທົບຂອງເກືອອາຊິດໄຂມັນໃນຄຸນລັກສະນະການຫມັກ, ຄວາມຫຼາກຫຼາຍຂອງເຊື້ອແບັກທີເຣຍທີ່ກຽມພ້ອມດ້ວຍ alfalfa, ເຟືອງ, 1487. DOI: 10.1002 / JSFA.1482.
Yang, J. et al. (2023) 'ການພົວພັນລະຫວ່າງລະຫວ່າງການ oxidative biomarkers oxidative ແລະ gut microbiota ໃນຜົນກະທົບຕໍ່ຕ້ານອະນຸມູນອິດສະລະຈາກການສະກັດເອົາ sonchus brachyotus dc. ໃນຄວາມກົດດັນຜຸພັງທີ່ເກີດຈາກ oxazolone ໃນຜູ້ໃຫຍ່ zebrafish ', ສານຕ້ານອະນຸມູນອິດສະຫລະ 2023, Vol. 12, ຫນ້າ 192, 12 (1), p. 192. DOI: 10.3390 / antiox12010192.
