Ganz Genom Bisulfit Sequencing (WGBS)
Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) steet als Gold-Standard-Methodologie fir déif Exploratioun vun der DNA-Methylatioun, speziell déi fënneft Positioun am Zytosin (5-mC), e pivotal Reguléierer vum Genausdrock an der cellulärer Aktivitéit. De Prinzip, deen WGBS ënnersträicht, beinhalt d'Bisulfitbehandlung, induzéieren d'Konversioun vun onmethyléierten Zytosinen op Uracil (C bis U), wärend methyléiert Zytosinen onverännert bleiwen. Dës Technik bitt Single-Basis Resolutioun, wat d'Fuerscher erlaabt de Methylome ëmfaassend z'ënnersichen an anormal Methylatiounsmuster ze entdecken, déi mat verschiddene Konditiounen assoziéiert, notamment Kriibs. Andeems Dir WGBS beschäftegt, kënnen d'Wëssenschaftler onparalleléiert Abléck an genombreet Methylatiounslandschaften kréien, e nuancéiert Verständnis vun den epigeneteschen Mechanismen ubidden, déi verschidde biologesch Prozesser a Krankheeten ënnersträichen.
Service Fonctiounen
● Verlaangt e Referenz Genom.
● Lambda DNA gëtt bäigefüügt fir d'Bisulfit Konvertéierungseffizienz ze iwwerwaachen.
● Sequencing op Illumina NovaSeq.
Service Virdeeler
●Gold Standard fir DNA Methylatioun Fuerschung: Dës reife Methylatiounskonversiounsveraarbechtungstechnologie huet héich Genauegkeet a gutt Reproduktioun.
●Breet Ofdeckung an Single-Base Resolutioun:Detektioun vu Methylatiounsplazen um Genombreet Niveau.
●Komplett Plattform:bitt One-Stop exzellente Service vu Probeveraarbechtung, Bibliothéikkonstruktioun, Sequenzéierung bis Bioinformatik Analyse.
●Extensiv Expertise: mat WGBS Sequenzéierungsprojeten, déi erfollegräich iwwer eng divers Palette vun Arten ofgeschloss sinn, bréngt BMKGENE iwwer e Jorzéngt Erfahrung, en héichqualifizéierten Analyseteam, ëmfaassenden Inhalt an exzellente Post-Verkafssupport.
●Méiglechkeet fir mat Transcriptomics Analyse matzemaachen: Erlaabt d'integréiert Analyse vu WGBS mat aneren Omics Daten wéi RNA-seq.
Sample Spezifikatioune
| Bibliothéik | Sequenzéierungsstrategie | Recommandéiert Datenausgang | Qualitéitskontroll |
| Bisulfit behandelt | Illumina PE150 | 30x Déift | Q30 ≥ 85% Bisulfit Konversioun > 99% |
Prouf Ufuerderunge
| Konzentratioun (ng/µL) | Gesamtbetrag (µg) | Zousätzlech Ufuerderunge | |
| Genomesch DNA | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Limitéiert Degradatioun oder Kontaminatioun |
Service Work Flow
Echantillon Liwwerung
DNA Extraktioun
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
Daten Liwwerung
Ëmfaasst déi folgend Analyse:
● Raw Sequenzéierungsqualitéitskontrolle;
● Mapping op Referenzgenom;
● Detektioun vu 5mC methyléierte Basen;
● Analyse vun der Methylatiounsverdeelung an der Annotatioun;
● Analyse vun Differential Methylated Regiounen (DMRs);
● Funktionell Annotatioun vun Genen verbonne mat DMRs.
5mC Methylatiounserkennung: Aarte vu methyléierte Siten
Methylatiounskaart. 5mC Methylatioun Genom-breet Verdeelung
Annotatioun vun héich methyléierte Regiounen
Differenziell methyléiert Regiounen: verbonne Genen
Differenziell Methyléiert Regiounen: Annotatioun vun assoziéierte Genen (Gene Ontologie)
Entdeckt d'Fuerschungsfortschrëtter erliichtert vum BMKGene säi ganze Genom Bisulfit Sequenzéierungsservicer duerch eng curéiert Sammlung vu Publikatiounen.
Fan, Y. et al. (2020) 'Analyse vun DNA Methylatiounsprofile wärend Schafe Skelettmuskelentwécklung mat Hëllef vu ganz-genom Bisulfit Sequenzéierung',BMC Genomics, 21(1), S. 1–15. doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'Novel Deoxyribonukleinsäure Methylatioun Stéierungen bei Aarbechter ausgesat op Vinylchlorid',Toxikologie an Industriell Gesondheet, 38(7), S. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Relatiounen tëscht Genom-Methylatioun, Niveauen vun net-kodéierende RNAs, mRNAs a Metaboliten an der Reife vun Tomate Fruucht',The Plant Journal, 103(3), S. 980-994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
