Kleng RNA Sequencing-Illumina
Fonctiounen
● Bibliothéik Virbereedung ëmfaasst eng Gréisst Auswiel Schrëtt
● Bioinformatesch Analyse zentréiert sech ëm d'MiRNA-Prognose an hir Ziler
Service Virdeeler
●Iwwergräifend Bioinformatik Analyse:Aktivéiert d'Identifikatioun vu bekannten an neie miRNAs, Identifikatioun vu miRNAs Ziler, an entspriechend funktionell Annotatioun a Beräicherung mat multiple Datenbanken (KEGG, GO)
●Richteg Qualitéitskontroll: Mir implementéiere Kär Kontrollpunkten iwwer all Stadien, vu Probe a Bibliothéikpräparatioun bis Sequenzéierung a Bioinformatik. Dës virsiichteg Iwwerwaachung garantéiert d'Liwwerung vu konsequent qualitativ héichwäerteg Resultater.
●Post-Verkaf Ënnerstëtzung: Eist Engagement erstreckt sech iwwer d'Réalisatioun vum Projet mat enger 3-Mount After-Sale Service Period. Wärend dëser Zäit bidde mir de Projet Suivi, Troubleshooting Hëllef, a Q&A Sessiounen fir all Ufroen am Zesummenhang mat de Resultater unzegoen.
●Extensiv Expertise: Mat engem Track Record vun erfollegräicher Zoumaache vu multiple sRNA Projeten déi iwwer 300 Arten a verschiddene Fuerschungsberäicher ofdecken, bréngt eis Team e Räichtum un Erfahrung fir all Projet.
Prouf Ufuerderunge a Liwwerung
| Bibliothéik | Plattform | Recommandéiert Donnéeën | Daten QC |
| Gréisst ausgewielt | Illumina SE50 | 10M-20M liesen | Q30≥85% |
Sample Ufuerderunge:
Nukleotiden:
| Konzentratioun (ng/μl) | Betrag (μg) | Rengheet | Integritéit |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limitéiert oder keng Protein oder DNA Kontaminatioun op Gel gewisen. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitéiert oder keng Basislinn Héicht |
● Planzen:
Wuerzel, Stamm oder Bléieblieder: 450 mg
Blat oder Som: 300 mg
Uebst: 1,2 g
● Déier:
Häerz oder Darm: 450 mg
Viscera oder Gehir: 240 mg
Muskel: 600 mg
Schanken, Hoer oder Haut: 1,5g
● Arthropoden:
Insekten: 9g
Crustacea: 450 mg
● Ganz Blutt: 2 rohren
● Zellen: 106 Zellen
● Serum a Plasma:6ml vun
Recommandéiert Sample Liwwerung
Behälter: 2 ml Zentrifuge Röhre (Zinnfolie ass net recommandéiert)
Probe Etikettéierung: Grupp + replizéieren zB A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sendung:
1. Dréchent Äis: Echantillon mussen a Poschen gepackt ginn an an dréchen Äis begruewe ginn.
2. RNAstable Réier: RNA Echantillon kënnen an RNA Stabiliséierung Rouer gedréchent ginn (zB RNAstable®) an an Raumtemperatur geschéckt.
Service Work Flow
Experimenter Design
Echantillon Liwwerung
RNA Extraktioun
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
Bioinformatik
● Raw Daten Qualitéitskontroll
● sRNA Klassifikatioun
● Ausrichtung zu engem Referenzgenom
● Identifikatioun vun bekannten a Roman miRNA
● Differenziell miRNA Ausdrock Analyse
● Funktionell Annotatioun vun miRNA Ziler
Identifikatioun vu miRNA: Struktur an Déift
Differenziell Ausdrock vu miRNA - hierarchesch Clustering
Funktionell Annotatioun vun Zil vun differentially ausgedréckt miRNAs
Entdeckt d'Fuerschungsfortschrëtter erliichtert vum BMKGene 'sRNA Sequenzéierungsservicer duerch eng curéiert Sammlung vu Publikatiounen.
Chen, H. et al. (2023) 'Viral Infektiounen hemmen d'Saponin Biosynthese a Photosynthese am Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, S. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) "D'Planz FYVE Domain-enthale Protein FREE1 assoziéiert mat Mikroprozessor Komponenten fir d'MiRNA Biogenese z'ënnerdrécken", EMBO bericht, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'D'MicroRNA Ame-Bantam-3p kontrolléiert d'Larval Puppel Entwécklung andeems Dir de Multiple Epidermal Growth Factor-like Domains 8 Gen (megf8) an der Honeybee, Apis mellifera zielt, International Journal of Molecular Sciences, 24(6), p. . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Integréiert Analyse vu MiRNA a Genen, déi mat Fleeschqualitéit assoziéiert sinn, weist datt Gga-MiR-140-5p Intramuskulär Fettdepositioun bei Pouleten beaflosst', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), S. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
