-
Single- nuclei RNA Sequencing
D'Entwécklung vun Single-Zell Capture a Custom Bibliothéik Konstruktiounstechniken, gekoppelt mat High-Throughput Sequenzen, huet d'Genexpressiounsstudien um Zellniveau revolutionéiert. Dësen Duerchbroch erlaabt eng méi déif a méi ëmfaassend Analyse vu komplexe Zellpopulatiounen, d'Aschränkungen ze iwwerwannen, déi mam Duerchschnëttsgenausdrock iwwer all Zellen verbonne sinn an déi richteg Heterogenitéit bannent dëse Populatiounen erhalen. Wärend Single-Zell RNA Sequencing (scRNA-seq) onbestreideg Virdeeler huet, begéint et Erausfuerderunge a bestëmmte Stoffer, wou d'Schafung vun enger Eenzell-Suspension schwéier beweist a frësch Proben erfuerdert. Bei BMKGene adresséiere mir dës Hürd andeems mir Single-Nukleus RNA Sequencing (snRNA-seq) ubidden mat der moderner 10X Genomics Chromium Technologie. Dës Approche erweidert de Spektrum vu Proben, déi fir d'Transkriptomanalyse um Eenzellniveau empfindlech sinn.
D'Isolatioun vun Käre gëtt duerch den innovativen 10X Genomics Chromium Chip erreecht, mat engem aacht-Kanal Mikrofluidiksystem mat Duebele Kräizungen. Bannent dësem System gi Gelpärelen mat Barcoden, Primer, Enzymen, an engem eenzegen Kär a Nanoliter-Gréisst Uelegdrëpsen akapselt, a bilden Gel Bead-in-Emulsion (GEM). No der GEM-Bildung geschitt Zelllysis a Barcode-Verëffentlechung bannent all GEM. Duerno ënnerleien mRNA Moleküle ëmgedréint Transkriptioun an cDNAs, mat 10X Barcodes an Unique Molecular Identifiers (UMIs) integréieren. Dës cDNAs ginn dann u Standard Sequenzéierungsbibliothéikskonstruktioun ënnerworf, wat eng robust an ëmfaassend Exploratioun vun Genausdrockprofiler um Eenzellniveau erliichtert.
Plattform: 10 × Genomics Chromium an Illumina NovaSeq Plattform
-
10x Genomics Visium Spatial Transkriptom
Spatial Transcriptomics ass eng modernste Technologie déi Fuerscher erlaabt Genausdrockmuster bannent Stoffer z'ënnersichen wärend hire raimleche Kontext erhalen. Eng mächteg Plattform an dësem Domain ass 10x Genomics Visium gekoppelt mat Illumina Sequencing. De Prinzip vum 10X Visium läit op engem spezialiséierten Chip mat engem designéierte Fanggebitt wou Tissue Sektiounen plazéiert sinn. Dëst Erfassgebitt enthält barcoded Flecken, all entspriechend enger eenzegaarteger raimlecher Plaz am Tissu. Déi gefaange RNA Moleküle aus dem Tissu ginn dann mat eenzegaartege molekulare Identifizéierer (UMIs) wärend dem ëmgedréint Transkriptiounsprozess gezeechent. Dës barcoded Flecken an UMIs erméiglechen präzis raimlech Kartéierung a Quantifikatioun vum Genausdrock bei enger eenzeger Zell Opléisung. D'Kombinatioun vu raimlech barcoded Proben an UMIs garantéiert d'Genauegkeet an d'Spezifizitéit vun den generéierten Donnéeën. Andeems Dir dës Spatial Transcriptomics Technologie benotzt, kënnen d'Fuerscher e méi déif Verständnis vun der raimlecher Organisatioun vun Zellen an de komplexe molekulare Interaktioune kréien, déi an Stoffer optrieden, onschätzbar Abléck an d'Mechanismen ubidden, déi biologesch Prozesser a ville Beräicher ënnerleien, dorënner Onkologie, Neurowëssenschaften, Entwécklungsbiologie, Immunologie. , a botanesch Studien.
Plattform: 10X Genomics Visium an Illumina NovaSeq
-
Voll-Längt mRNA Sequencing-Nanopore
Wärend NGS-baséiert mRNA Sequencing e versatile Tool ass fir Genausdrock ze quantifizéieren, beschränkt seng Vertrauen op kuerz Liesungen seng Effizienz a komplexen transkriptomeschen Analysen. Op der anerer Säit benotzt Nanopore Sequencing laang gelies Technologie, wat d'Sequenzéierung vu mRNA Transkripte vu voller Längt erméiglecht. Dës Approche erliichtert eng ëmfaassend Exploratioun vun alternativen Splicing, Genfusioune, Poly-Adenylatioun, an d'Quantifikatioun vun mRNA Isoformen.
Nanopore Sequencing, eng Method déi op Nanopore Single-Molekül Echtzäit elektresch Signaler hänkt, liwwert Resultater an Echtzäit. Geleet vu Motorproteine bindt duebelstrengeg DNA un Nanopore Proteinen, déi an engem Biofilm agebonne sinn, entspanen wéi et duerch den Nanopore Kanal ënner engem Spannungsdifferenz passéiert. Déi markant elektresch Signaler generéiert vu verschiddene Basen op der DNA Strang ginn entdeckt a klasséiert an Echtzäit, erliichtert eng korrekt a kontinuéierlech Nukleotid Sequenzéierung. Dës innovativ Approche iwwerwannt kuerz Liesbeschränkungen a bitt eng dynamesch Plattform fir komplizéiert genomesch Analyse, dorënner komplexe transkriptomesche Studien, mat direkten Resultater.
Plattform: Nanopore PromethION 48
-
Volllängt mRNA Sequencing -PacBio
Wärend NGS-baséiert mRNA Sequencing e versatile Tool ass fir d'Genausdrock ze quantifizéieren, beschränkt seng Ofhängegkeet op kuerz Liesungen seng Notzung a komplexe transkriptomeschen Analysen. Op der anerer Säit benotzt PacBio Sequencing (Iso-Seq) laang gelies Technologie, wat d'Sequenzéierung vu mRNA Transkriptiounen a voller Längt erméiglecht. Dës Approche erliichtert eng ëmfaassend Exploratioun vun alternativen Splicing, Genfusioune a Poly-Adenylatioun. Wéi och ëmmer, et ginn aner Choixe fir Genausdrockquantifikatioun wéinst der héijer Quantitéit un Daten erfuerderlech. PacBio Sequenzéierungstechnologie baséiert op Single-Molekül, Echtzäit (SMRT) Sequenzéierung, déi e markanten Virdeel ubitt fir voll Längt mRNA Transkripter z'erreechen. Dës innovativ Approche involvéiert d'Benotzung vun Null-Modus Waveguides (ZMWs) a mikrofabrizéierte Wells, déi d'Echtzäit Observatioun vun der DNA Polymerase Aktivitéit während der Sequenzéierung erméiglechen. Bannent dësen ZMWs synthetiséiert PacBio's DNA Polymerase e komplementäre Strang vun DNA, generéiert laang Liesungen déi d'ganz mRNA Transkriptioun spanen. PacBio Operatioun am Circular Consensus Sequencing (CCS) Modus verbessert d'Genauegkeet andeems se déiselwecht Molekül ëmmer erëm Sequenzéieren. Déi generéiert HiFi Liesungen hunn eng Genauegkeet vergläichbar mat NGS, bäidréit weider zu enger ëmfaassender an zouverlässeg Analyse vu komplexe transkriptomesche Funktiounen.
Plattform: PacBio Sequel II; PacBio Revio
-
Eukaryotesch mRNA Sequencing-NGS
mRNA Sequencing, eng villsäiteg Technologie, erméiglecht déi ëmfaassend Profiléierung vun all mRNA Transkriptiounen bannent Zellen ënner spezifesche Konditiounen. Mat senge breet gefächerte Uwendungen enthüllt dëst opzedeelen Tool komplizéiert Genausdrockprofiler, Genstrukturen a molekulare Mechanismen verbonne mat diverse biologesche Prozesser. Breet ugeholl an der fundamentaler Fuerschung, der klinescher Diagnostik, an der Drogenentwécklung, mRNA Sequencing bitt Abléck an d'Intricacies vun der cellulärer Dynamik an der genetescher Reguléierung, a bréngt Virwëtz iwwer säi Potenzial a verschiddene Beräicher.
Plattform: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7
-
Net-Referenz baséiert mRNA Sequencing-NGS
mRNA Sequencing erméiglecht déi ëmfaassend Profiléierung vun all mRNA Transkriptiounen bannent Zellen ënner spezifesche Bedéngungen. Dës opzedeelen Technologie déngt als e mächtegt Tool, enthüllt komplizéiert Genausdrockprofiler, Genstrukturen a molekulare Mechanismen verbonne mat diverse biologesche Prozesser. Breet ugeholl an der fundamentaler Fuerschung, klinescher Diagnostik, an Drogenentwécklung, mRNA Sequencing bitt Abléck an d'Intricacies vun der cellulärer Dynamik a genetescher Reguléierung.
Plattform: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7
-
Laang Non-coding Sequencing-Illumina
Laang net-kodéierend RNAs (lncRNAs) si méi laang wéi 200 Nukleotiden déi minimal Kodéierungspotenzial besëtzen a pivotal Elementer bannent net-kodéierend RNA sinn. Fonnt am Kär an Zytoplasma, spillen dës RNAs entscheedend Rollen an der epigenetesch, transkriptionaler a post-transkriptionaler Reguléierung, ënnersträichen hir Bedeitung bei der Gestaltung vun celluläre a molekulare Prozesser. LncRNA Sequencing ass e mächtegt Tool bei Zelldifferenzéierung, Ontogenese a Mënscherkrankheeten.
Plattform: Illumina NovaSeq
-
Kleng RNA Sequencing-Illumina
Kleng RNA (sRNA) Moleküle, enthalen MikroRNAs (miRNAs), kleng interferéierend RNAs (siRNAs), a piwi-interagéierend RNAs (piRNAs). Ënnert dësen, miRNAs, ongeféier 18-25 Nukleotiden laang, si besonnesch bemierkenswäert fir hir pivotal Reguléierungsrollen a verschiddene celluläre Prozesser. Mat Otemschwieregkeeten-spezifesch a Bühn-spezifesch Ausdrock Musteren, miRNAs weisen héich Conservatioun ganze verschidden Arten.
Plattform: Illumina NovaSeq
-
CircRNA Sequencing-Illumina
Kreesfërmeg RNA Sequencing (circRNA-seq) ass fir kreesfërmeg RNAs ze profiléieren an z'analyséieren, eng Klass vun RNA Molekülen déi zougemaach Schleifen bilden wéinst net-kanonesche Splicing-Evenementer, déi dës RNA mat verstäerkter Stabilitéit ubidden. Wärend e puer circRNAs gewise goufen als MicroRNA Schwämmen ze handelen, microRNAs sequesteréieren an ze verhënneren datt se hir Zil-mRNAs reguléieren, kënnen aner circRNAs mat Proteinen interagéieren, Genausdrock moduléieren oder Rollen an celluläre Prozesser hunn. circRNA Ausdrock Analyse gëtt Abléck an de reglementaresche Rollen vun dëse Molekülle an hir Bedeitung an verschiddenen Zell Prozesser, Entwécklungsstadien, a Krankheet Konditiounen, Contributioun zu engem déiwe Versteesdemech vun der Komplexitéit vun RNA Regulatioun am Kontext vun Genausdrock.
-
Ganz Transkriptom Sequenzéierung - Illumina
Ganz Transkriptom Sequenzéierung bitt eng ëmfaassend Approche fir divers RNA Molekülle ze profiléieren, coding (mRNA) an net-kodéierend RNAs (lncRNA, circRNA, a miRNA). Dës Technik erfaasst de ganze Transkriptom vu spezifesche Zellen zu engem bestëmmte Moment, wat e ganzt Verständnis vun celluläre Prozesser erlaabt. Och bekannt als "total RNA Sequencing", et zielt fir komplizéiert Reguléierungsnetzwierker um Transkriptomniveau z'entdecken, wat eng detailléiert Analyse erméiglecht wéi kompetitiv endogen RNA (ceRNA) a gemeinsame RNA Analyse. Dëst markéiert den éischte Schrëtt a Richtung funktionell Charakteriséierung, besonnesch bei der Entféierung vun de reglementaresche Netzwierker mat circRNA-miRNA-mRNA-baséiert ceRNA Interaktiounen.
