-
Toolkits
BMKCloud ass eng féierend bioinformatesch Plattform déi One-Stop-Léisung fir genomesch Programmer ubitt, déi wäit vu Fuerscher a verschiddene Arenaen vertraut gëtt, dorënner medizinesch, landwirtschaftlech, Ëmwelt, etc. , Rechenressourcen, ëffentlech Datebank, bioinformtesch Online Coursen, asw. Annotatioun, evolutiv genetesch Tools, ncRNA, Datequalitéitskontroll, Assemblée, Ausriichtung, Datenextraktioun, Mutatiounen, Statistiken, Figurgenerator, Sequenzanalyse, asw.
-
De novo Bakteriell Genom Assemblée
Mir bidden e komplette bakterielle Genom Assemblée Service, garantéiert 0 Lücken. Dëst ass méiglech duerch d'Integratioun vu laang gelies Sequenzéierungstechnologien, wéi Nanopore a PacBio fir d'Versammlung a kuerz Liessequenzen mat Illumina fir d'Versammlungsvalidatioun a Feelerkorrektur vun ONT Liesungen. Eise Service bitt de komplette bioinformatesche Workflow vu Montage, funktioneller Annotatioun a fortgeschratt bioinformatescher Analyse, erfëllt spezifesch Fuerschungsziler. Dëse Service erméiglecht d'Entwécklung vu präzise Referenzgenome fir verschidde genetesch a genomesch Studien. Zousätzlech bildt et d'Basis fir Uwendungen wéi Belaaschtungsoptimiséierung, Gentechnik, a mikrobieller Technologieentwécklung, fir zouverlässeg a spaltfräi genomesch Donnéeën entscheedend fir wëssenschaftlech Abléck a biotechnologesch Innovatioun ze förderen.
-
kleng RNA
Kleng RNAs sinn Aart vu kuerzen net-kodéierende RNA mat duerchschnëttlech Längt vun 18-30 nt, dorënner miRNA, siRNA a piRNA. Dës kleng RNA goufe massiv gemellt fir a verschiddene biologesche Prozesser involvéiert ze sinn, wéi zB mRNA-Degradatioun, Iwwersetzungsinhibitioun, Heterochromatinbildung, asw. Sequenzéierungsanalyseplattform besteet aus Standardanalyse a fortgeschratt Datenmining. Op Basis vun RNA-seq Donnéeën, Standard Analyse kann miRNA Identifikatioun an Cepheid erreechen, miRNA Zil Gen Viraussetzung, Annotatioun an Ausdrock Analyse. Fortgeschratt Analyse erméiglecht personaliséiert miRNA Sich an Extraktioun, Venn Diagramm Generatioun, miRNA an Zilgennetzgebitt.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS ass eng ganz Genom Re-Sequencing Analyse Plattform, déi op Basis vu räicher Erfahrung a Biomarker Technologies entwéckelt gëtt. Dës einfach ze benotzen Plattform erlaabt eng séier Soumissioun vun engem integréierten Analyse Workflow andeems Dir einfach e puer Basisparameter setzt, déi passt fir DNA Sequenzéierungsdaten generéiert vu béid Illumina Plattform an BGI Sequenzéierungsplattform. Dës Plattform gëtt op High-Performance Computing-Server ofgesat, wat héich effizient Datenanalyse a ganz limitéierter Zäit erméiglecht. Personaliséierter Datemining ass verfügbar op Basis vun der Standardanalyse, inklusiv mutéiert Genquery, PCR Primer Design, etc.
-
mRNA (Referenz)
Transkriptom ass de Link tëscht genomesch genetesch Informatioun an dem Proteome vun der biologescher Funktioun. Transkriptiounsniveau Reguléierung ass dee wichtegsten an am meeschte studéierte Reguléierungsmodus vun Organismen. Transkriptom Sequenzéierung kann den Transkriptom zu all Zäitpunkt oder ënner all Bedingung sequenzéieren, mat enger Resolutioun präzis zu engem eenzegen Nukleotid. Probe spezifesch Transkriptiounen.
Am Moment ass d'Transkriptom Sequenzéierungstechnologie wäit an der Agronomie, Medizin an aner Fuerschungsberäicher benotzt, dorënner Déieren- a Planzeentwécklungsreguléierung, Ëmweltadaptatioun, Immuninteraktioun, Genlokaliséierung, Aarte genetesch Evolutioun an Tumor- a genetesch Krankheet Detektioun.
-
Metagenomics (NGS)
Dës Analyseplattform ass fir Gewier metagenomesch Datenanalyse entwéckelt op Basis vu Joeren Erfarung. Et besteet aus integréierte Workflow mat verschiddenen allgemeng gebrauchten Metagenomics Analysen abegraff Datenveraarbechtung, Aarte-Niveau Studien, Genfunktiounsniveau Studien, Metagenome Binning, etc. , Parameter Astellung, personaliséiert Figur generéieren, etc.
-
LncRNA
Laang net-kodéierend RNAs (lncRNA) sinn eng Zort Transkriptioune mat enger Längt méi wéi 200 nt, déi net fäeg sinn Proteinen ze codéieren. Akkumulativ Beweiser hindeit datt déi meescht vun lncRNAs ganz wahrscheinlech funktionell sinn. High-Throughput Sequenzéierungstechnologien a bioinformatesch Analyseinstrumenter erméiglechen eis lncRNA Sequenzen z'entdecken an Informatioun méi effizient ze positionéieren a féieren eis lncRNAs mat entscheedende Reguléierungsfunktiounen z'entdecken. BMKCloud ass houfreg eise Clienten lncRNA Sequencing Analyse Plattform ze bidden fir séier, zouverlässeg a flexibel lncRNA Analyse z'erreechen.
-
GWAS
Genome-breet Associatiounsstudie (GWAS) zielt fir genetesch Varianten (Genotyp) z'identifizéieren, déi mat spezifesche Charaktere (Phenotyp) verbonne sinn. GWA Studien ënnersicht genetesch Marker duerch ganz Genom vu grousser Zuel vun Individuen a virausgesot Genotyp-Phänotyp Associatiounen duerch statistesch Analyse op Bevëlkerungsniveau. Ganz-Genom Resequencing kann potenziell all genetesch Varianten entdecken. Kopplung mat phenotypeschen Donnéeën, GWAS ka veraarbecht ginn fir Phänotyp-verwandte SNPs, QTLs a Kandidatengenen z'identifizéieren, déi staark modern Déieren- / Planzenzucht ënnerstëtzt. SLAF ass eng selbstentwéckelt vereinfacht Genom Sequenzéierungsstrategie, déi Genom-breet verdeelt Marker entdeckt, SNP. Dës SNPs, als molekulare genetesch Marker, kënne fir Associatiounstudien mat geziilte Charaktere veraarbecht ginn. Et ass eng kosteneffektiv Strategie bei der Identifikatioun vun komplexe Spure verbonne genetesch Variatiounen.
-
Nanopore Volllängt Transkriptomik
Komplex a variabel alternativ Isoformen an Organismen si wichteg genetesch Mechanismen fir d'Reguléierung vun der Genausdrock a Proteindiversitéit. Genau Identifikatioun vun Transkriptstrukturen ass d'Basis fir eng detailléiert Studie vu Genausdrockreguléierungsmuster. Nanopore Sequenzéierungsplattform huet erfollegräich transkriptomesch Studie op Isoform-Niveau bruecht. Dës Analyseplattform ass entwéckelt fir RNA-Seq Daten ze analyséieren, generéiert op der Nanopore Plattform op Basis vum Referenzgenom, wat qualitativ a quantitativ Analysen souwuel op Genniveau wéi och op Transkriptiounsniveau erreecht.
-
circ-RNA
Kreesfërmeg RNA (circRNA) ass eng Aart vun net-kodéierender RNA, déi viru kuerzem fonnt goufen eng vital Roll a reglementaresche Netzwierker ze spillen, déi an der Entwécklung, Ëmweltresistenz involvéiert sinn, asw. D'Enn vum CirRNA gi matenee verbonne fir eng kreesfërmeg Struktur ze bilden, déi se vun der Verdauung vun der Exonuklease retten a méi stabil si wéi déi meescht linear RNA. CircRNA goufe fonnt fir verschidde Funktiounen ze hunn bei der Reguléierung vum Genausdrock. CircRNA kann als ceRNA Leeschtunge, wat miRNA kompetitiv bindt, bekannt als miRNA Schwamm. CircRNA Sequencing Analyse Plattform erméiglecht d'circRNA Struktur an Ausdrock Analyse, Zilprediktioun a gemeinsame Analyse mat aneren Aarte vu RNA Molekülen
-
BSA
Bulked Segregant Analyse Plattform besteet aus engem Schrëtt Standard Analyse a fortgeschratt Analyse mat personaliséierte Parameter Astellung. BSA ass eng Technik déi benotzt gëtt fir séier Phänotyp verbonne genetesch Marker z'identifizéieren. Main Workflow vun BSA enthält: 1. Auswiel vun zwou Gruppen vun Individuen mat extrem opposéieren phenotypes; 2. d'DNA, RNA oder SLAF-seq (Entwéckelt vum Biomarker) vun all Individuen zesummenzebréngen fir zwee Gros vun DNA ze bilden; 3. Differentialsequenzen géint Referenzgenom oder tëscht z'identifizéieren, 4. Kandidate verbonnen Regiounen duerch ED an SNP-Index Algorithmus virauszesoen; 5. Funktionell Analyse an Beräicherung op Genen an Kandidatur Regiounen, etc.. Méi fortgeschratt Biergbau an Daten dorënner genetesch markéiert Duerchmusterung an primer Design sinn och sinn.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S / 18S / ITS) Plattform ass mat Joeren Erfarung an der mikrobieller Diversitéitsprojetanalyse entwéckelt, déi standardiséierter Basisanalyse a personaliséierter Analyse enthält: Basisanalyse deckt den Mainstream Analyseinhalt vun der aktueller mikrobieller Fuerschung, den Analyseinhalt ass räich an ëmfaassend, an d'Analyseresultater ginn a Form vu Projetsberichter presentéiert; Den Inhalt vun der personaliséierter Analyse ass divers. Echantillon kënnen ausgewielt ginn a Parameteren kënne flexibel no dem Basisanalysebericht a Fuerschungszwecker festgeluecht ginn, fir personaliséiert Ufuerderungen ze realiséieren. Windows Betribssystem, einfach a séier.
-
Evolutionär Genetik
Evolutiounsgenetik ass e komplette Sequenzéierungsservice entwéckelt fir eng Asiichtvoll Interpretatioun vun der Evolutioun bannent enger grousser Grupp vun Individuen ze bidden, baséiert op genetesch Variatiounen, dorënner SNPs, InDels, SVs, an CNVs. Dëse Service ëmfaasst all wesentlech Analysen déi néideg sinn fir d'evolutiounsverschiebungen an genetesch Charakteristike vu Populatiounen z'erklären, dorënner Bewäertunge vun der Bevëlkerungsstruktur, genetescher Diversitéit a phylogenetesch Bezéiungen. Ausserdeem verdreift et Studien iwwer Genfloss, wat Schätzunge vun der effektiver Bevëlkerungsgréisst an Divergenzzäit erméiglecht. Evolutiounsgenetikstudien ginn wertvoll Abléck an d'Origine an d'Adaptatiounen vun Arten.
Bei BMKGENE bidde mir zwou Weeër fir evolutiv Genetikstudien op grouss Populatiounen auszeféieren: Ganzgenom Sequenzéierung (WGS) ze benotzen oder fir eng reduzéiert Representatioun Genom Sequenzéierungsmethod ze wielen, den intern entwéckelte Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF). Wärend WGS méi kleng Genome passt, entsteet SLAF als eng kosteneffektiv Alternativ fir méi grouss Populatiounen mat méi laangen Genomen ze studéieren, effektiv d'Sequenzéierungskäschte minimiséieren.
