Pacbio Volllängt Transkriptom

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, erméiglecht präzis Identifikatioun vun Transkriptisoformen, léisst d'Liicht op alternativ Polyadenylatioun a Splicing, a féiert zu méi genee Genausdrock Analyse. D'BMKCloud PacBio Full-Length Transcriptome Pipeline ass entwéckelt fir cDNA Bibliothéiken ze analyséieren, déi am Circular Consensus Sequencing (CCS) Modus sequenzéiert sinn an identifizéiert Full-Length Non-Chimeric (FLNC) Sequenzen, déi dann an net-redundante Transkripte geclustert ginn. Eng spéider BUSCO Analyse bewäert d'Vollständegkeet vun der Transkriptomversammlung. Aus dem versammelten Transkriptom gi verschidde Analysen duerchgefouert: Alternativ Splicing, Einfach Sequenzwidderhuelung (SSR), Prognose vun lncRNA an entspriechend Zilgenen, Prognose vun neie Genen, Genfamillanalyse, Transkriptiounsfaktor Analyse a funktionell Annotatioun vun Transkriptiounen.