Genom Evolutioun, Pangenme
Wat ass Pan-Genom?
Akkumuléiert Beweiser weisen datt Varianz tëscht verschiddene Strahlen vun enger Spezies enorm kann. Een eenzege Genom ass wäit aus genuch fir dat ganzt Bild vun genetescher Informatioun vun enger eenzeger Aart ze gewannen. Den Zweck vun der Pan-Genome Studie ass eng méi kompetent genoresch Grafik vun enger Spezies ze kréien an d'Relatiounen tëscht den Traiten an genetesch Coden ze decoriséieren, déi et nach méi déif a méi grouss Réng erlaabt.
Trends vu Pan-Genom Etude
Figur 1 den Trends vu verëffentlecht Fuerschungspabeieren vum Pan-Genomen.
Notiz: D'Figur weist d'Resultat vun "Pan-Genome" wéi de Schlësselwuert fir d'Titele vun Artikelen déi an der Natur, Zell a Wëssenschaftsgrupper Journaler publizéiert ginn
A. Liest vu multiple Proben ginn op eng Referenz an onpolitesch a ronn Kontigs versammelt. Andeems Dir dëse Romel Conta op der Original-Referenzskleege addéiert, e Pengenme Referenz ass gebaut ginn. Versichtbar Regiounen déi bestëmmt soll op Mazing all zréck an de Pangnome gesinn.
b. De Norvo Assemblée vun de Genomen vu multiple Invitatiounen erlaabt ganz genial Avomiver Apparater fir net ignoréiert genensabel geneiglechlech Regioun ze identifizéieren.
c. Eng Pan-Genom Gala ka vu ganz genate Genehmenter oder op de Nex Magnéierversuergung iwwerdeiicht ginn, wat effitéierlech Grenzen vun den Ënnerhalt vun den onofhängege Geschäfter ofstellt.
Wéi bauen e Pan-Genomen?
Figur 2 Verglach vu Pan-Genomen Approche1
A. Liest vu multiple Proben ginn op eng Referenz an onpolitesch a ronn Kontigs versammelt. Andeems Dir dëse Romel Conta op der Original-Referenzskleege addéiert, e Pengenme Referenz ass gebaut ginn. Versichtbar Regiounen déi bestëmmt soll op Mazing all zréck an de Pangnome gesinn.
b. De Norvo Assemblée vun de Genomen vu multiple Invitatiounen erlaabt ganz genial Avomiver Apparater fir net ignoréiert genensabel geneiglechlech Regioun ze identifizéieren.
c. Eng Pan-Genom Gala ka vu ganz genate Genehmenter oder op de Nex Magnéierversuergung iwwerdeiicht ginn, wat effitéierlech Grenzen vun den Ënnerhalt vun den onofhängege Geschäfter ofstellt.
Kierzlech publizéiert Pan-Genomen
● Rape Pan-Genomes2
● Tomate Pan-Genenen 3
● Rice Pannonome4
● Sonneblummen Pan-Genom5-
● Soybean Pan-Genom 6
● Reis Pan-Genom7
● Barley Pan-Genom8
● Weess Pan-Genom9
● sorghum Pan-Genom10
● Phytoplanketon Pan-Genom11 Mee
Uweisungen
1 An. De Bayer Paklee-Clackz Aa, Schenger A, Batle Jage vum Edwards D. Caromes sinn déi nei Referenz. Nat Planzen. 2020; 6 (8): 914-920. doi: 10.1038 / S41477-020-0733-0
2. Song Jm, Guan z, hu j, et al. Aacht héichqualitativ Genomen weisen Pan-Genom Architektur an ÖkoType Differenzéierung vu Brassica Napus. Nat Planzen. 2020; 6 (1): 34-45. doi: 10.10338 / S41477-019-0577-7
3. Gao l, Gonda ech, Sonn h, et al. Den Tomate Pan-Genomendiker entscheet nei Genen an e rare Allele reguléierend Uebstroma. Nat Gent. 2019; 51 (6): 1044-1051. doi: 10.1038 / S41588-019-0410-2
4. Zhao Q, Feng Q, lu, et al. Pan-Genom Analyse Highlight Highlight 2018 Aug; 50 (8): 1196]. Nat Gent. 2018; 50 (2): 278-284. doi: 10.1038 / S41588-018-0041-z
5. Hürbner s, Bercavich n, todesco m, et al. Sonneblummen Pan-Genom Analyse weist datt Hybridisaliséierungsinternoted Gen Inhalt a Krankheet Resistenz uginn. Nat Planzen. 2019; 5 (1): 54-62. doi: 10.1038 / S41477-018-0329-0
6. Liau y, Du h, li p, et al. Pan-Genom vu wild a kultivéiert Soja. Cell. 2020; 182 (1): 162-176.e13. doi: 10.1016 / J.CELL.2020,05,023
7. QIN P, lu, Du h, et al. Panyyy et Analyse vun 33.3 genetesch Sext Relecurity Advocensions verstoppt heatesch Variatiounen ze verstoppen [Online Viraus, 2021 221. Cell. 2021; S0092-8674 (21) 00581-x. doi: 10.1016 / J.CELL.2021.04.0446
8. Jayakodi m, padmarasu s, haberei g, et al. De Gerstey Panomer huet sech déi verstoppte Legacy vu Mutatiounstroum verréid. Natur. 2020; 588 (7837): 284-289. doi: 10.1038 / S41586-020-2947-8
9. Walkowiak s, Gao l, monat c, et al. Multiple Wheat Genomes verroden Global Variatioun an der moderner Zucht. Natur. 2020; 588 (7837): 277-283. doi: 10.1038 / S41586-020-2961-x
10. Tao y, luo h, xu j, et al. [121 fro V5anéieren am Pan Gëft vum kultivéiert a filphum [publizéiert Online-Comité Nat Planzen. 2021; 10.1038 / S41477-021-0095-x. doi: 10.1038 / S41477-021-00925-x
11. Fan x, qiu h, han w, et al. Phytoplankton Pangenome verréid extensiv iwwerkaryotesch horizontal Generadstransfer vun den Divers Funktiounen. Sci adv. 2020; 6 (18): eaba0111. Verëffentlecht 2020 Auer 29. DOI: 10.1126 / Sciadv.aba01111
Post Zäit: Jan-04-2022