T2T Genomtomobilie, Spalt gratis Genom
1stZwee Reisgeninnen1
Tittel: Assemblée an d'Validatioun vun zwee Spap-gratis Referenzgenimer fir Xian / Indika Reiskrediten, déi an der Planz Centromentur
Doi:https://ddi.org/101101/2020.22.24.424073
Bitt Zäit: 1. Januar, 2021.
Institut: Huazhong landwirtschaftlech Universitéit, China
Material
O. Sativa Xian / IndikaRice Varieties 'Zhenshan 97 (ZS97)' an 'minghui 63 (mh63)
Sequencing Strategie
Ngs liest + hifi liest + Clr liest + Bionano + Hi-c
Artikel un
ZS97: 8.34 GB (~ 23X) Hifi liest + 48.39 GB (~ 131x) CLR liest + 25 GB (~ 6 Biono ISs + 2 Biono
Mh63: 37.88 gb (~ 103x) liest + 48,97 GB (~ 132x) Clr liest + 28 GB (~ 7 Biono) NGS + 2 Biono
Figur 1 zwee Spap-gratis Genomes vu Reis (MH63 an ZS97)
2ndBanana Genom2
Tittel: Telomerre-to-telomee Garless Chromosome vun der Bananen mat Nanooper Sequencing
Doi:https://doi.org/10,101/2021.04.16.44001717
D'Punktagen: de 17. Abrëll, 2021.
Institut: Université Paräis-Saklay, Frankräich
Material
Duebel haploidMusa acuminataSppmalacccsensis(Dh-phangang)
Sequencing Strategie an Daten:
Airq2500 P250 Mode + Minion / Promember (93GB, ~ OPTIX)
Tabell 1 Verglach vu Musa Akalatata (DH-PAHAR) Genom Versammlungen
Figur 2 Musaforomer Architektur Verglach
3rdPhaEodactylum Tricornutum Genom3
Titel: Telomerre-to-thelomere Genom Versammlung vunP
heeodactylum tricornutum
Doi:https://doi.org/10101/2021.05.04.442596
Gepost Zäit: 04, 2021
Institut: Western Universitéit, Kanada
Material
PhaEodactylum Tricornutum(Kulturversammlung vun Algen a Protozoa CCAP 1055/1)
Sequencing Strategie an Daten:
1 Oxford Nanopore Minion Flosszell + A 2 × 75 Paired-End-Ausgang Nextseq 550 Run
Figur 3 Workflow fir Telomerre-to-teammere Gorom Versammlung
4thMënschlech Chm13 Genom4
Titel: Déi komplett Sequenz vun engem mënschleche Genom
Doi:https://ddi.org/10,101/2021.05.26.44579898
Gepost Zäit: Mee 27, 2021
Institut: National Instituter vun der Gesondheet (Nih), USA
Materialien: Zell Linn Chm13
Sequencing Strategie an Daten:
30 × Pacbiia Cirseina / Arima Generusions Hi-C (Hi-C), Bionanooperen Umanpre-laange seeslech. an Strang-Seq
Dësch 2 Verglach vu gch38 an T2t-Chm13 mënschlech Genehmelung Versammlungen
Uweisungen
1.sgemyy Nurk et al. Déi komplett Sequenz vun engem mënschleche Genom. biorxiv 202.05.26.445798; doi:https://ddi.org/10,101/2021.05.26.44579898
2.Caroline Belounung et al. Telomere-to-telometere Garless Chromosome vun der Bananen mat Nanooper Sequencing. biorxiv 2021.04.16.440017; doi:https://doi.org/10,101/2021.04.16.44001717
3.Daniel J. Gigerre et al. Telomere-to-telomener Genomtom Versammlung vum Pheelodactyl Tricornutum. biorxiv 202.05.04.442596; doi:https://doi.org/10101/2021.05.04.442596
4.JIA-Ming Song et al. Montage an d'Validatioun vun zwee Spap-gratis Referenzgeninne fir Xian / Indika Reis verwéckelt Abléck an Planz Centromiture Architektur. biorxiv 2020.22.24.424073; doi:https://ddi.org/101101/2020.22.24.424073
Postzäit: Jan-06-2022