
Nanopore volllängt Transkriptome
Nanopore Transkriptome Sequencing ass eng mächteg Method fir d'Vizenzen Volllängt CDNAs, korrekt identifizéierend a méi héije Transkript ze transifizéieren. D'BMKCLCLUD Nanooper voll-Längt Transkripte Pipeline ass entworf fir RNA-SNA-seq Daten generéiert ginn géint en héije Praktoratorstattform, an der Katotorativ a quantitativ Analyse souwuel vum BMKCCLUDID Nolooper. Nom Qualitéitskontrolle, volllängt net-chimeresch (Flnc) Sequenzen ginn kritt an Konsenser Sequenzen ginn op de Referenz Genkripter. Aus dësem Transkript Set, den Ausdrock gëtt quantifizéiert an ënnerschiddlech ausgefouert Genen an Transkriptioune ginn a funktionelléiert ginn. D'Pipeline enthält och alternativen Polyadenylation (APA) Analyse Faktorganisatioun, Prognosen vun der Romantosinten, Iwwerdroung vun der Romerioten vun der LSCRNS a funktionell Annotatioun vun Transkripter.
Bionformatik
