mRNA-seq (NGS) – De novo

mRNA Sequencing erlaabt Profiléiere vun all mRNA Transkriptiounen an Zellen ënner spezifesche Bedéngungen an ass eng wäit benotzt Technologie a verschiddene Fuerschungsberäicher. D'BMKCloud De novo mRNA-seq Pipeline ass entwéckelt fir Poly-A beräichert Sequenzéierungsbibliothéiken ze analyséieren wann kee Referenzgenom verfügbar ass. D'Pipeline fänkt mat Qualitéitskontroll un, gefollegt vunde neienTranskriptversammlung an Unigene Set Auswiel. D'unigene Strukturanalyse virausgesot Kodéierungssequenz (CDS) an einfach Sequenz Wiederholungen (SSR). Duerno, fënnt d'Differential Ausdrock Analyse differentiell ausgedréckt Genen (DEGs) ënnert de getest Konditiounen, gefollegt vun funktionell Annotatioun an Beräicherung vun DEGs biologesch Abléck ze Extrait.