Mat dräi méiglech Optiounen fir ze wielen ofhängeg vum gewënschtenen Grad vu Genom Vollständegkeet:
● Entworf Genomoptioun: Shorti-liest sequenting mat Illumina Novasas Pe150.
● Schreifgeld gutt Genehmegesch Optioun:
Genoment Ëmfro: Illumina Novaseq Pe150.
Genomtom Versammlung: Pacbio Revio (Hifi liest) oder Nanopore Promethion 48.
● Chromomome-Level fungal Genom:
Genoment Ëmfro: Illumina Novaseq Pe150.
Genomtom Versammlung: Pacbio Revio (Hifi liest) oder Nanopore Promethion 48.
Contig huet sech mat Hi-C Versammlung agespaart.
●Multiple Sequencing Strategien verfügbar: Fir verschidden Fuerschungsziler an Ufuerderunge vu Genomenkraaft
●Komplett biiinformatiker Aarbechtsblumm:Dëst beinhalt Genomtomobilie an der Prognose vu multiple Genomelel Elementer, funktionell Genotatioun, a Kontinuéierung.
●Extensiv Expertise: Mat iwwer 120.000 Goresregkeeten, mat engem Courage Carlesch Experienz, exzellent Inhalt, ausser exzellent Inhalt erreecht, offiziell Equipe.
●Post-Verkaf Support:Eisen Engagement verlängert iwwer Projektfall mat engem 3 Méint nom Verkafservice Period. Bei dëser Zäitpunkt musse mir eis verfollegen, passen, Spillwandelungen, an Q & setzen op d'Sessioune mat d'Resultater adresséieren.
Service | Sequencing Strategie | Qualitéitskontroll |
Entworf Genom | Illumina Pe150 100x | Q30,85% |
Fein Genom | Genomen Ëmfro: Illumina Pe150 50 x Assemblée: Pacbio Hifi 30x oder Nanopore 100x | Contig n50 ≥1MB (Pacbio Unicellular) contig n50 ≥2MB (ONICLLular) contig n50 ≥500KB (anerer) |
Chromosome Niveau Genom | Genomen Ëmfro: Illumina Pe150 50 x Assemblée: Pacbio Hifi 30x oder Nanopore 100x Salut CH Montage 100x | Contig ankend Verhältnis> 90%
|
Konzentratioun (ng / μl) | Gesamtbetrag (μg) | Volumen (μl) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
Pacbio | ≥ -0 | ≥2 | ≥ -0 | 1.7-2.2 | ≥1.6 |
Nanoopore | ≥40 | ≥2 | ≥ -0 | 1.7-2.2 | 1.03.0 |
Illumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥ -0 | - | - |
Unicellular Pilz: ≥3,5x1010 Zicken
Macro Pilz: ≥10 g
Enthält déi folgend Analyse:
Genomen Ëmfro:
Fein Genom Versammlung:
Salut-C Versammlung:
Genomen Ëmfro: K-Mer Verdeelung
Genomtom Versammlung: Gen homologen Annotatioun (nr Datebank)
Genomtom Versammlung: Funktionell Genent Annotatioun (gitt)
D'Faillite beschreiwen mat VMUkne-Genacht keng Servicer, ënnert enger begmalrifer Sammlung vun der Publikatiounsversammlungss Servicer.
HAO, J. et al. (2023) 'integréiert omitärer Profilfaart vum medizineschen Champignon inonotus Obliquus ënner Ënnerbewosstsinn',BMC Genomikiker, 24 (1), PP. 1-12. Doi: 10.1186 / S12864-023-09656-Z / Figuren / 3.
Lu, l. et al. (2023) 'Genom vun der Evolutioun vun der Evolutioun a pathogen Mechatishenmaturish vun der Weesshaarter Axtoot Phhotgen Rhizokonière.De Crop Journal, 11 (2), PP. 405-416. Doi: 10.1016 / J.CJJ.202.07.024.
Zhang, H. et al. (2023) 'Genomen Ressourcen fir véier Clariredia Spezies déi Dollar Plaz op diverser Turfraesser verursaachen',Planzressioun, 107 (3), PP. 929-934. doi: 10.1094 / PDIS-08-22-1921-a
Zhang, ss et al. (2023) 'genetesch a molekulär Beweiser vun engem Tetrapolar Scoring System an der innbare Champos Camsola Freondosa',Journal vu Fungi, 9 (10), p. 959. DOI: 10.3390 / Jof9100959 / S1.