Eukaryotesch mRNA Analyse (Referenzbaséiert an de novo Optiounen verfügbar)
Dës Pipeline benotzt NGS RNA-Seq Daten als Input a produzéiert Resultater vu multiple Downstream Analysen abegraff awer net limitéiert op: Sequenzéierungsdatenqualitéit Bewäertung,de neienTranskriptiouns Site Annotatioun, Variabel Splicing Analyse, Differential Ausdrock Analyse, Funktioun Annotatioun a Beräicherungsanalyse.
Laang net-kodéierend RNA Analyse
Laang net-kodéierend RNAs (lncRNA) sinn net-kodéierend Transkriptiounen mat Längt méi wéi 200 nt a bekannt Rollen an der Chromatinorganisatioun a Reguléierung ze spillen. High-Throughput Sequencing Technologien a Bioinformatik hunn eist Verständnis vun lncRNA Sequenzen a Positionéierungsinformatioun beméit fir lncRNAs mat entscheedende reglementaresche Funktiounen z'identifizéieren. Dës Pipeline liwwert lncRNA Analyse zousätzlech zu Analysen, déi an der Eukaryotic mRNA Analyse Pipeline ernimmt ginn.
16S/18S/ITS Amplicon Sequenzéierung
D'Amplicon Sequencing mikrobiell Diversitéit Analyse Pipeline gouf entwéckelt baséiert op Joeren Erfarung an der mikrobieller Diversitéitsprojet Analyse. D'Pipeline enthält standardiséierte Basisanalyse, déi den Mainstream Analyseinhalt vun der aktueller mikrobieller Fuerschung a personaliséierter Analyse ofdeckt. Den Analysebericht ass räich an ëmfaassend, mat der Optioun fir divers perséinlech Analyse auszeféieren. Zousätzlech kënnen Echantillon a Gruppen op der Flucht geännert ginn fir zousätzlech Personnalisatioun a Kontroll.
Shotgun Metagenomics Analyse
D'Shotgun Metagenomic Analyse Pipeline benotzt NGS Daten aus gemëschte genomesche Materialien aus Ëmweltproben extrahéiert. Abegraff Analysen bidden detailléiert Informatioun iwwer Arten Diversitéit an Heefegkeet, Bevëlkerungsstruktur, phylogenetesch Bezéiung, funktionell Genen, a Korrelatiounsnetzwierker mat Ëmweltfaktoren.
NGS-WGS Variant Analyse
D'NGS-WGS Variant Analyse ass eng integréiert Variant Detektioun Pipeline déi Datenqualitéitskontroll, Sequenzausrichtung, Annotatioun a Genmutatiounsanalyse ausféiert. D'Pipeline follegt GATK beschten Praktiken fir SNP an InDel Detektioun a benotzt Manta fir strukturell Variant Uruff.
Genome Wide Association Study (GWAS)
D'GWAS Pipeline ass eng Downstream Analyse déi virdru generéiert VCF Dateien an entspriechend Phänotypdaten fir eng Kohort vun Individuen als Input hëlt. Mat spezifesche statistesche Methodologien zielt GWAS d'genombreet Nukleotidvariatioune korreléiert mat phänotypeschen Differenzen z'entdecken. Et spillt eng entscheedend Roll bei der Entdeckung vun funktionnelle Genen, déi mat komplexe mënschleche Krankheeten a komplizéierten Eegeschafte bei Planzen an Déieren verbonne sinn.
Bulk Segregation Analysis (BSA)
BSA Analyse beinhalt d'Pooling vun Individuen mat extremen phänotypesche Charaktere vun enger segregéierter Bevëlkerung. Andeems d'Differentialloci tëscht de pooléierte Proben vergläicht, identifizéiert dës Approche séier enk verbonne molekulare Markéierer verbonne mat Zilgenen. Vill an der genetescher Kartéierung vu Planzen an Déieren benotzt, ass et e wäertvollt Tool fir Marker-assistéiert Zucht.
Evolutionär Genetik Analyse
Den Evolutionäre Genetik Analyse Workflow profitéiert dem BMKGENE seng extensiv Erfarung an der genetescher Evolutiounsprojeten an enthält phylogenetesch Bamkonstruktioun, Verknüpfungsdisequilibrium Analyse, genetesch Diversitéit Bewäertung, selektiv Sweep Identifikatioun, Verwandtenanalyse, Haaptkomponent Analyse, a Bevëlkerungsstruktur Charakteriséierung.
