Evolutionär Genetik
Service Virdeeler
Takagi et al.,D'Planz Journal, 2013
●Iwwergräifend bioinformatesch Analyse:Erlaabt d'Schätzung vun der genetescher Diversitéit, déi d'evolutiounspotenzial vun Arten reflektéiert, an eng zouverlässeg phylogenetesch Relatioun tëscht Arten mat miniméierten Afloss vun der konvergenter Evolutioun a paralleler Evolutioun ze weisen.
●Optional personaliséiert Analyse: sou wéi d'Schätzung vun der Divergenzzäit a Geschwindegkeet baséiert op Variatiounen um Nukleotid- an Aminosaierniveau.
●Extensiv Expertise a Verëffentlechungsrecords: BMKGene huet massiv Erfarung a Bevëlkerungs- an evolutiver Genetikprojeten gesammelt fir iwwer 15 Joer, Dausende vun Arten, asw.
● Héichqualifizéiert Bioinformatik Team a kuerzen Analysezyklus: mat grousser Erfahrung an fortgeschratt Genomik Analyse, BMKGene d'Team liwwert ëmfaassend Analysë mat enger séier Wendung Zäit.
● Post-Verkaf Ënnerstëtzung:Eist Engagement erstreckt sech iwwer d'Réalisatioun vum Projet mat enger 3-Mount After-Sale Service Period. Wärend dëser Zäit bidde mir de Projet Suivi, Troubleshooting Hëllef, a Q&A Sessiounen fir all Ufroen am Zesummenhang mat de Resultater unzegoen.
Service Spezifikatioune an Ufuerderunge
| Aart vun der Sequenzéierung | Recommandéiert Populatioun Skala | Sequenzéierungsstrategie | Nukleotid Ufuerderunge |
| Ganz Genom Sequencing | ≥ 30 Individuen, mat ≥ 10 Individuen aus all Ënnergrupp
| 10x vun | Konzentratioun: ≥ 1 ng/µL Gesamtbetrag ≥ 30ng Limitéiert oder keng Degradatioun oder Kontaminatioun |
| Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) | Tag Déift: 10x vun Zuel vun Tags: <400 Mb: WGS gëtt recommandéiert <1Gb: 100K Tags 1gb vun >2Gb: 300K Tags Max 500k Tags | Konzentratioun ≥ 5 ng/µL Gesamtbetrag ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1,6-2,5 Agarosegel: keng oder limitéiert Degradatioun oder Kontaminatioun
|
Service Work Flow
Experimenter Design
Echantillon Liwwerung
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
Service enthält Analyse vun der Bevëlkerungsstruktur (phylogenetesch Bam, PCA, Bevëlkerungsstratifikatiounsdiagramm), Bevëlkerungsdiversitéit a Bevëlkerungsauswiel (Verknëppungsdisequilibrium, selektiv Sweep-Selektioun vu avantagéis Siten). De Service kann och personaliséiert Analyse enthalen (zB Divergenzzäit, Genfloss).
*Demo Resultater hei gewisen sinn all aus Genome publizéiert mat BMKGENE
1.Evolution Analyse enthält Konstruktioun vun phylogenetic Bam, Populatioun Struktur an PCA baséiert op genetesch Variatiounen.
Phylogenetesche Bam representéiert taxonomesch an evolutiv Bezéiungen tëscht Arten mat gemeinsame Virfahren.
PCA zielt d'Proximitéit tëscht Ënnerpopulatiounen ze visualiséieren.
Bevëlkerungsstruktur weist d'Präsenz vun genetesch ënnerscheeden Ënnerbevëlkerung a punkto Allele Frequenzen.
Chen, et al. al.,PNAS, 2020
2.Selektiv Schwäif
Selektiv Sweep bezitt sech op e Prozess, duerch deen e avantagéise Site ausgewielt gëtt an d'Frequenze vu verlinkte neutrale Site erhéicht ginn an déi vun net verknäppte Siten erofgaange sinn, wat zu enger Reduktioun vun der regionaler resultéiert.
Genom-breet Detektioun op selektiven Schweessregiounen gëtt veraarbecht andeems d'Bevëlkerungsgenetesch Index (π，Fst, Tajima's D) vun all SNPs bannent enger Schieberfenster (100 Kb) a bestëmmte Schrëtt (10 Kb) berechnen.
Nukleotid Diversitéit (π)
Tajima D
Fixatiounsindex (Fst)
Wu, et al. al.,Molekulare Planz, 2018
3.Gene Flow
Wu, et al. al.,Molekulare Planz, 2018
4.Demographesch Geschicht
Zhang, et al. al.,Natur Ökologie & Evolutioun, 2021
5.Divergenz Zäit
Zhang, et al. al.,Natur Ökologie & Evolutioun, 2021
Entdeckt d'Fortschrëtter erliichtert vum BMKGene seng evolutiv Genetik Servicer duerch eng curéiert Sammlung vu Publikatiounen:
Hassanyar, AK et al. (2023) 'Entdeckung vu SNP Molekulare Marker a Kandidat Genen verbonne mat Sacbrood Virus Resistenz an Apis cerana cerana Larven duerch Whole-Genome Resequencing',International Journal of Molecular SciencesEng., 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) 'Entdeckung vun enger wilde, genetesch pure chinesesche Ris Salamander schaaft nei Conservatiounsméiglechkeeten',Zoologesch Fuerschung, 2022, Vol. 43, Heft 3, Säiten: 469-480, 43(3), S. 469-480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
Han, M. et al. (2022) 'Phylogeographical Pattern and Population Evolution History of Indigenous Elymus sibiricus L. on Qinghai-Tibetan Plateau',Frontiers in Plant Science, 13, p. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
Wang, J. et al. (2022) 'Genomesch Abléck an d'Longan Evolutioun vun enger Chromosom-Niveau Genom Assemblée a Bevëlkerungsgenomik vu Longan Bäitrëtter',Horticulture Fuerschung, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
