Eukaryotesch MRNA SEQUenscing-ngs
FONTassementer
● Opfäll vu Polyrna virun der Bibliothéikberäich
● Optional Richtung Mrna Bibliothéikberäich fir z'aktivéieren d'Stand-spezifesch Sequenzing Daten ze kréien
● biiinformatesch Analyse vum Gen Ausdrock an Transkript Struktur
Virdeeler
●Extensiv Expertise: Eis Equipe huet déi éischt Proben a ville Wierklech a ville Probleemer verschwonnen. Mir bréngen ee Richtungsfahrung fir all Projet an engem 100.000 méi ewéi alen Här-Proze lerenzen Domain-Projeten.
●Rigoréis Qualitéitskontroll: Mir implementéieren Kreide Kontrollpunkten iwwer all Etappen, vu Proben a Bibliothéikberäich fir sequenting an biiinformatiken. Dës metesch Iwwerwaachung entstoe d'Liwwerung vu konsequente Resultater, fir datt Äre Projet an zouverléissege Hänn ass.
●Ëmfaassend Annotatioun: Mir benotze verschidde Datebanks fir anscheinend an déi aner ausgedréckt Genen (Degs (Degs) a Performréierungsregelen ze maachen an ausféieren. Des iwwerfär Approche bitt een Uert, an d'Tialu an d'Molekéierps iwwer d'Transkikattarme vun den Transkripter empfänken, fir Iddien voll iwwerquesséieren.
●Post-Verkaf Ënnerstëtzung: Eise Engagement verlängert iwwer Progrizung mat engem 3 Méint nom Verkafservice Period. Bei dëser Zäitpunkt musse mir eis verfollegen, passen, Spillwandelungen, an Q & setzen op d'Sessioune mat d'Resultater adresséieren.
Probe Ufuerderunge a Liwwerung
| Buergermeeschter | Sequencing Strategie | Daten recommandéieren | Qualitéitskontroll |
| Poly eng beräichert | Illumina Pe150 DNNBSEQ-T7 | 6 -10 GB | Q30,85% |
Probe Ufuerderungen:
Cukleogen:
| Conct. (Ng / μl) | Betrag (μg) | Rengheet | Integritéit | |
| Baséierthanddeg | ≥ 10 | ≥ 0.2 | Od260 / 280 = 1.7-2,5 Od260 / 230 = 0.5-2,5 Limitéiert oder kee Protein oder DNA Contaminatioun op Gel. | Fir Planzen: RIN≥4.0; Fir Déieren: rin≥4.5; 5.0,228s / 18s 15.0; limitéiert oder keng Baseline Héicht |
| Dichierwescht | ≥ 10 | ≥ 0.2 | Od260 / 280 = 1.7-2,5 Od260 / 230 = 0.5-2,5 Limitéiert oder kee Protein oder DNA Contaminatioun op Gel. | Fir Planzen: RIN≥4.0; Fir Déieren: rin≥4.5; 5.0,228s / 18s 15.0; limitéiert oder keng Baseline Héicht |
● Planzen:
Root, stamm oder Bléieblieder: 450 mg
Blat oder Seed: 300 mg
Uebst: 1,2 g
●En Déier:
Häerz oder Darm: 300 mg
Viscera oder Gehir: 240 mg
Muskel: 450 mg
Schanken, Hoer oder Haut: 1g
● Arthropizos:
Insekten: 6g
Krustacea: 300 mg
● ganz Blutt: 1 Tube
● Renkellen: 106 Zicken
Recommandéiert Probe Liwwerung
Container: 2 ml Centrifuge Rouer (Tin Folie ass net recommandéiert)
TELEPLING CABRELATEL: GROUP + REPLICE E1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Liwwerung:
1. Dréchent-Äis: Echantillon mussen an Taschen gepackt an am dréchenen Äis begruewen.
2
Service Aarbecht fléisst
Experiment Design
Géif Problem Liwwerung
RVA Extraktioun
Bibliothéik Konstruktioun
Sequencing
Daten Analyse
No-Verkaaf Servicer
Biinformatatics
Eukaryotesch MrNA Sevencing Analyse Workflow
Biinformatatics
ØRéi Datenqualitéit Kontroll
ØReferenz Genomeniveau
ØTranskript Struktur Analyse
ØAusdrock Quantitéit
ØDifferenzial Ausdrock Analyse
ØFunktioun Annotatioun an Beräicherung
Referenz Genomeniveau
Daten Saturatioun
Sample Korrelatioun a Bewäertung vu biologeschen Repliken
Differenziell ausgedréckt Genen (Degs)
Funktionell Annotatioun vum Degs
Funktionell Beräicherung vum Degs
Excléiert d'Funiounen déi déi elektervolutioun vum Spärhularesch nsaryotesch NRSIALS d'Mönzlängt vu Lëtzebuerg säeren.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan an den Tricarararbuber hunn d'Omfactory Kapazitéit vu Goldfëschung duerch d'Unerkennung, gestéiert ORFLATIOUN ORIBLATIOUN ORIGHTIVTATIOUN, ORDELLT ORDER ORDER ONLINE ORDER ONGERHALT ONLINE ORDER ONLINE ONGERHALT ORDERT ORDER ORDER ONLINE ORDER ORDER ONLINE ONGERION ORDER ORDER ORDERS ORDER ONLEMENT ONLINE ONLEMENT ONLEMENT ONLINE ONGERION ORDER ONLINE ONGERHALS 119736. DOI: 10.1016 / J.Watres.2023.119736.
JIA, LJ et al. (2023) 'Aspergillus Fumigatus hijacks mënschlech P.1Traction fir Pitgal-mat PHAGOOS ze redigen an net-degradative Pathway', Cell & Microbe Host, 37388, Doi: 10.1016 / J.CHOM.2023.02,002.
Jin, K. et al. (2022) 'TCP Transkriptiounsfaktoren involvéiert an der Schéisser Entwécklung vu Ma Bambus (Dendrocallicicus Latiforus Munro)', Grenzwëssen, 13, 884443. DOI: 10.3389 / FPLS.2022.884443 / BIBTEX.
Wen, x. et al. (2022) 'de Chrysanthemhemhemhemholinifhole genomen
Zhang, Yujie et al. (2023) 'e Cascade Nanorator fir de Sonodynamic Therapie op Colorectal Kriibs iwwer Synergistic Ros an Autoragagy Blockéierung', Pano Blockéierung ",. 101798. DOI: 10.1016 / J.NANTOD.2023.101798.
