DNBSEQ pre-made Bibliothéiken
Fonctiounen
●Plattform:MGI-DNBSEQ-T7
●Sequenzéierungsmodi:PE150
●Transfert vun Illumina Bibliothéiken opMGI:Erlaabt d'Sequenzéierung vun héijen Datevolumen zu niddrege Käschten.
●Qualitéitskontroll vu Bibliothéiken virum Sequenzéierung.
●Sequenzéierungsdaten QC a Liwwerung:Liwwerung vun QC Rapport an Matière Daten am fastq Format no demultiplexing an Filter Q30 liesen.
Virdeeler
●Villsäitegkeet vu Sequencing Servicer:de Client kann decidéieren no Spuer oder Betrag vun Daten ze Sequenz.
●Héich Datenausgang:1500 Gb/Streck
●Liwwerung vum Sequenzéierungs QC Bericht:mat Qualitéitsmetriken, Datengenauegkeet an allgemeng Leeschtung vum Sequenzéierungsprojet.
●Mature Sequenzéierungsprozess:mat kuerzer Wendung Zäit.
●Richteg Qualitéitskontroll: Mir implementéieren strikt QC Ufuerderunge fir d'Liwwerung vu konsequent héichqualitativen Resultater ze garantéieren.
Prouf Ufuerderunge
| Datebetrag (X) | Konzentratioun (qPCR/nM) | Volumen | |
| Deelweis Lane
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Single Lane | Per Lane | ≥ 1,5 nM / Bibliothéik Pool | ≥ 25 μl / Bibliothéik Pool |
Zousätzlech zu der Konzentratioun an der Gesamtbetrag ass och e passende Peakmuster erfuerderlech.
Bemierkung: Lane Sequenzéierung vun niddereg Diversitéit Bibliothéiken erfuerdert PhiX Spike-in fir robust Basis Uruff ze garantéieren.
Mir recommandéieren Pre-pooled Bibliothéiken als Echantillon ofzeginn. Wann Dir BMKGENE braucht fir Bibliothéikpooling ze maachen, kuckt w.e.g. op de
Bibliothéik Ufuerderunge fir deelweis Lane Sequenzen.
Bibliothéik Gréisst (Peak Kaart)
Main Peak soll bannent 300-450 bp sinn.
Bibliothéike sollen een eenzegen Haaptpeak hunn, keng Adapterkontaminatioun a keng Primerdimer.
Service Workflow
Bibliothéik QC Rapport
E Bericht iwwer d'Qualitéit vun der Bibliothéik gëtt virum Sequenzéierung geliwwert, d'Bibliothéiksbetrag beurteelt a Fragmentatioun.
Sequenzéierung QC Bericht
Dësch 1. Statistiken op sequencing Donnéeën.
| Beispill ID | BMKID | Raw liest | Raw Daten (bp) | Propper Liesungen (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figur 1. Qualitéit Verdeelung laanscht liest an all Prouf
Figur 2. Basis Inhalt Verdeelung
Figur 3. Verdeelung vun liesen Inhalt am Sequenz Donnéeën
