Illumina Pre-Gëtt Bibliothéiken
FONTassementer
●Plattformen:Illumina novasq 6000 an novasasq x plus
●Sequencing Mods:PE150 a PE250
●Qualitéitskontroll vu Bibliothéiken ier se
●Sequenzen Daten qc a Liwwerung:Liwwerung vum QC Bericht an rau Daten am FastQ Format nom Demultiplexing a Filterning Q30 Lies
Service Virdeeler
●Gesondheet vu Sequenzing Servicer:De Client kann op Spriecher duerch Spuer ze wielen, fléissendem Zell, oder per Undeel un Daten erfuerderlech (partiell Spuere
●Extensiv Erfarung op Illumina Sequenzing Plattform:mat Dausende vun zoue Projete mat verschiddenen Arten.
●Liwwerung vum Sequencing QC Bericht:Mat Qualitéitsmetresch, Daten Richtegkeet a Gesamt Leeschtung vum Sequenzing Projet.
●Reife seiquencing Prozess:mat kuerzer Turn-Zäit.
●Rigoréis Qualitéitskontroll: Mir begrenzte Vuler QC Finanzement fir d'Liwwerung vu konsequente elegiell Resultater ze garantéieren.
Probe Plattformen
| Plattform | Fléissend Zell | Sequenzing Modus | Eenheet | Geschätzte Ausgab |
| Novasasq x | 10b (8 Bunnen) | PE150 | Eenzeg Spur Partiell Spur | 375GB / Spuer |
| 25b (8 Bunnen) | PE150 | Eenzeg Spur Partiell Spur | 1000 GB / Spuer | |
| Novasasq 6000 | Sproff Zell (2 Bunnen) | PE250 | Fléissend Zell Eenzeg Spur Partiell Spur | 325-400 m Liest / Lane |
| S4 fléien Zell (4 Bunnen) | PE150 | Fléissend Zell Eenzeg Spur Partiell Spur | ~ 800 GB / Lane |
Prouf
| Datebank (x) | Konzentratioun (qpcr / nm) | Vuesso | |
| Partiell Spursquencing
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 NM | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Lane Sequencing | Pro Spur | ≥ 1,5 NM / Bibliothéik Pool | ≥ 25 μl / Bibliothéik Pool |
Zousätzlech zu Konzentratiouns- a Gesamtbetrag, e passende Peakmuster ass och erfuerderlech.
NOTIZ: Spëtzesverzeechnes vun niddrege Diversitéit Bibliothéike erfuerdert Phix Spike-in ze garantéieren datt de Robust Basis urufft.
Mir roden e préinen Bibliothéiken als Proben. Wann Dir BMKGNEne braucht fir d'Bibliothéikstécker ze maachen, kuckt w.e.g.
d'Bibliothéikfuerderunge fir partiell Spur Sequenzing.
Bibliothéik Gréisst (Peak Kaart)
Main Peak sollt bannent 300-450 BP sinn.
Bibliothéiken sollten en eenzege Haaptdecken hunn, mëttlerweileg Kontaminatioun an keng Prime DIMERS.
W.e.g. gitt op eis wann Är Proben net de Startmaterial Ufuerderunge entspriechen.
Service Aarbechtsflow
Bibliothéik Qualitéitskontroll
Sequencing
Datenqualitéit Kontroll
Projet Liwwerung
Bibliothéik QC Bericht
E Rapport op der Qualitéit vun der Bibliothéik gëtt virausgesot ier se berécksiichtegt, bewäerten Bibliothéikbetrag, a Fragmentéierung.
Sequencing qc Bericht
Table 1. Statistike op Sequenzen Daten.
| Probe ID | Bmkid | Réi Liest | Rau Daten (BP) | Propper Liesungen (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | Bmk_01 | 22.870,120 | 6.8611,036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | Bmk_02 | 14.717,867 | 4.415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figur 1. Qualitéit Verdeelung laanscht de Liese an all Probe
Bild 2. Base Inhalt Verdeelung
Figur 3. Verdeelung vun der Liesinhalter a Sequenzen Daten
