Volllängt MURNA SEQUens -pacbio
FONTassementer
● CDANA Synthese aus Poly-a Mrann gefollegt vu Bibliothéikberäich
● Sëtzt am CCS Modus, generéieren Hifi liest
● säquencing vun der voll Längt Transkripter
● D'Analyse bezitt sech net e Referenz Genom; Wéi och ëmmer, et kann agestallt ginn
● bioinformatesch Analyse erméiglecht Analyse vun Transkripriform lncrna, Gen-Ady-Adylatioun, an déi generational
Service Virdeeler
●Héich Genauegkeet: Hifi liest mat Genauegkeet> 99,9% (Q30), vergläichbar mat NGS
● Alternativ Plack Analyse: Sequenzung vun de ganzen Transkripter erméiglecht isoform Identifikatioun a Charakteriséierung
●Extensiv Expertise: Bei engem Standuert um 1100 PacBBIO ganz jalméiert Iwwerzeegungsprojete stëmmen, Projeten, eis Equipe begeet e Räidstaarbecht fir all Entwéckler.
●Post-Verkaf Ënnerstëtzung: Eise Engagement verlängert iwwer Progrizung mat engem 3 Méint nom Verkafservice Period. Bei dëser Zäitpunkt musse mir eis verfollegen, passen, Spillwandelungen, an Q & setzen op d'Sessioune mat d'Resultater adresséieren.
Probe Ufuerderunge a Liwwerung
| Buergermeeschter | Sequencing Strategie | Daten recommandéieren | Qualitéitskontroll |
| Polya beräicherte Mrna CCs Bibliothéik | Pacbio Sequel II Pacbio Revio | 20/40 GB 5/10 M CCS | Q30,85% |
Probe Ufuerderungen:
Cukleogen:
● Planzen:
Root, stamm oder Bléieblieder: 450 mg
Blat oder Seed: 300 mg
Uebst: 1,2 g
● Déier:
Häerz oder Darm: 300 mg
Viscera oder Gehir: 240 mg
Muskel: 450 mg
Schanken, Hoer oder Haut: 1g
● Arthropizos:
Insekten: 6g
Krustacea: 300 mg
● ganz Blutt: 1 Tube
● Rufft: 106 Zicken
| Conct. (Ng / μl) | Betrag (μg) | Rengheet | Integritéit |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | Od260 / 280 = 1.7-2,5 Od260 / 230 = 0.5-2,5 Limitéiert oder kee Protein oder DNA Contaminatioun op Gel. | Fir Planzen: RIN≥7.5; Fir Déieren: rin≥8.0; 5.0,8:8s / 18s 15.0; limitéiert oder keng Baseline Héicht |
Recommandéiert Probe Liwwerung
Container: 2 ml centrifuge Rouer (Tin Folie ass net recommandéiert)
TELEPLING CABRELATEL: GROUP + REPLICE E1, A2, A3; B1, B2, B3.
Liwwerung:
1. Dréchent-Äis: Echantillon mussen an Taschen gepackt an am dréchenen Äis begruewen.
2
Service Aarbecht fléisst
Experiment Design
Géif Problem Liwwerung
RVA Extraktioun
Bibliothéik Konstruktioun
Sequencing
Daten Analyse
No-Verkaaf Servicer
Enthält déi folgend Analyse:
● Raw Datenqualitéit Kontroll
● Alterlech Polyadenylatiounsanalyse (APA)
● Fusion Transkript Analyse
● Alternativ Plack Analyse
● Benchmarking universell Single-Copy Ortholog (Busco) Analyse
● Nobelhschung Transkriptioun Analyse: Prognose vun der Kodéierungsschätz (CDen) a funktionell Annotatioun
● Lncrna Analyse: Prognose vun der Lncrna an Ziler
● Microskorite Identifikatioun (SSR)
Busco Analyse
Alternativ splatend Analyse
Alternativ Polyadenylatiounsanlag (APA)
Funktionell Annotatioun vu Roman Transkripter
Entdeckt d'Fortschrëtter erliichtert vum BMKGEne Nanooper Vollzäitlängt d'Demissionerservicer Servicer an dëser Critéen.
Ma, y. et al. (2023) 'Comparativ Analyse vu Pacbio an OTT RNA SECRESSCICY MUPPILIMA NEMMUII VUMUI', GROMANCIKATIOUN, 11). 110709. DOI: 10.1016 / J.YGENO.2023.110709.
Chao, Q. et al. (2019) 'd'Entwécklungsdiskik vum Populius Steem Transkriptptome', Planzebezuelungsbiotechnologie Journal, 17 (1) 206-219. doi: 10.1111 / PBI.12958.
Deng, H. et al. (2022) 'dynamesch Ännerungen am Ascorbic Acidentacwëssenen, 2 (10), P. 5808. DOI: 10.3390 / IJms23105808 / S1.
Hua, x. et al. (2022) 'Watproduktent Provetioun vu Biechnenhetetesche De Claude Genons invitéiert sech a babophesch Polyphyllins zu Parstapyllylleria, 522 522 5: 1, 5 (1), 5,22 5: 1, 5 (1) Doi: 10.10338 / S42003-022-03000 Z.
Liu, m. et al. (2023) 'Kombinéiert Pacbio Iso-Seq an Illumina RNA-Seq Analyse vun der Tuta Absa Alexmata (MYRETTE PRKATOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOMOME PRËTTEN PRONCOMES AN 2023)' kombinéiert Pacbi Isq an Illumina RNA-Seq Analyse vun der Tuta Absauta (Megyrick) Transkripte P450 Generelome a 4) 363. DOI: 10.3390 / Insekten14040363 / S1.
Wang, lijun et al. (2019) 'eng Ëmfro vun der Transkriptomie mat Pacbio eenzel-Moleküle wierklech eng Beloununga mat Belminaler vun der RMCONEs, 20,00. Doi: 10.1186 / S12864-019-5832-9.
