Amplicon Sequencing (16S/18S/ITS)

Amplicon (16S / 18S / ITS) Sequenzéierung mat Illumina ass eng Method fir mikrobiell Diversitéit ze analyséieren andeems mikrobiell Profiler no hire Sequenzen z'identifizéieren an duerno probéiert d'Gemeinschaftsreich an Diversitéit bannent all Probe an tëscht Proben ze entzifferen. D'BMKCloud Amplicon (NGS) Pipeline erlaabt d'Analyse vun 16S, 18S, ITS a verschidde funktionell Genen. Et fänkt un mat Liesen Trimmen, gepaart-Enn Liesversammlung a Qualitéitsbewäertung, gefollegt vu Clustering vun ähnlechen Liesungen fir Operational Taxonomic Units (OTUs) ze generéieren déi a sechs verschidden Analysesektiounen benotzt ginn. Taxonomesch Annotatioun liwwert Informatioun iwwer de relativen Heefegkeet an d'Zesummesetzung vun all Probe, während Alpha- a Beta Diversitéitsanalysen sech op mikrobieller Diversitéit bannent an tëscht Proben konzentréieren. Differential Analyse tëscht Gruppen fënnt OTUs déi ënnerscheeden souwuel mat parametreschen wéi och net-parametreschen Tester, wärend Korrelatiounsanalyse dës Differenzen op Ëmweltfaktoren bezitt. Schlussendlech gëtt funktionell Gen Heefegkeet virausgesot baséiert op Marker Gen Heefegkeet, déi Abléck an d'Funktioun an d'Ökologie an all Probe ubitt.