16s / 18s / säin Amplicon Sequenzing-Pacbio
Service Verwaltung
● Särigéiere Plattform: PacBio Revio
● Säquencing Modus: CCS (Hifi liest)
● Vermeidung vun Zielregioun gefollegt vun der Tandemverbindung vun Amplikons ier Hifi Schuel Bibliothéik virbereeden
Service Virdeeler
●Méi héichsteierer Opléisung: Than Short-Amplicon Sequencing,Iwwerschätzt méi héich Otu Klassifikatiounsraten op der Speziesniveau.
●Héich korrekt Basis uruffen: Pacbio CCS Modus Sequenzing (Hifi liest).
●Isolationfräi: Séier Identifikatioun vu mikrobler Zesummesetzung an Ëmwelt.
●Wäit applicabel: Divers Mikrobial Gemeinschaftsstudien.
●Ëmfaassend biostformatesch Analyse: De leschten qiime2 Package (quantitativ Abléck a Mikobologie Ökologie) mat dichter Analysen, an der Datebank, Annotatioun, ONU / ASV / ASV.
●Extensiv Expertise: Mat Dausende vun Amplicon hunn Projeten jeewelt, BMUKENUE Am Erfarung bréngt eng héich geschäffeg Analysequipe, expsivéiert Inhalt.
Service Spezifikatioune
| Buergermeeschter | Sequencing Strategie | Daten recommandéieren |
| Amplicon | Pacbio Revio | 10/30/50 K Tags (CCS) |
Prouf
| Konzentratioun (ng / μl) | Gesamtbetrag (μg) | Volumen (μl) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥ -0 |
Recommandéiert Probe Liwwerung
Freeze d'Echantillon a flëssege Stickstoff fir 3-4 Stonnen a späichert a flëssege Stickstoff oder -80 Grad op laangfristeg Reservatioun. Probe Versand mat Dry-Äis ass erfuerderlech.
Service Aarbecht fléisst
Géif Problem Liwwerung
Bibliothéik Konstruktioun
Sequencing
Daten Analyse
No-Verkaaf Servicer
Enthält déi folgend Analyse:
● Raw Datenqualitéit Kontroll
● Otu Clustering / Deeis (ASV)
● OTU Annotatioun
Maacht d'Diversitéit vun Alkoisten, Verbréck, de Snannon, Simps an Acece.
● Beta diversitéit Analyse
● Inter-Grupp Analyse
● Korldatioun Analys: tëscht Ëmweltdoorsors an Erklärungskornfeheechter
● 16s funktionell Gen Prognose
Histogramm vun Taxonomesch Verdeelung
Communautéit Verdeelung phylontetesche Bam
Alpha Diversitéit Analyse: Ace
nis
Beta Diversitéit Analyse: PCOA
Intergrupp Analyse: Anoa
D'Virauslungzäit entstinn auswkleNen d'Aplicon säi Ampboon lersanessioninger Servicer duerch de kcobbounencessiounen duerch de kiwwierten Servicer ze entdecken.
Gao, X. a Wang, H. (2023) 'Comparativ Analyse vun Renmen Bakterformen a Funktiounen am Aplazion 1), p. 16. DOI: 10.3390 / Fermentatioun9010016 / S1.
Li, S. et al. (2023) huet de Mikro biniell Saachen an der Wüsteschstoe mat Kultukdeeler vun der Kulturcieur huelen oder Mikrobiome 2023. 1, 9-1493 9 (1). Doi: 10.10338 / S45522-023-00439-8.
Mu, l. et al. (202.22) 'Effekter vun der Fettsauersätz, 102 (4), PP. 1475- 1487. doi: 10.1002 / JSFA.11482.
Yang, J. et al. (2023) 'D'Interaktioun tëscht oxidative Stress Bibmarker an Darm Mikrobiota an der eigertanter Effekter vun der Extraiten Brackyotus DC. Am Oxazolon-induzéiert intestinal oxidativ Stress an Erwuessene Zebrafish ', Antioxidants 2023, Vol. 12, Säit 192, 12 (1), P. 192. DOI: 10.3390 / Antiox15010192.
