16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Service Fonctiounen
● Sequenzéierungsplattform: Illumina NovaSeq.
● Amplifikatioun vu kuerze Regiounen vun 16S, 18S an ITS, ënner anerem Verstäerkungsziler.
● Flexibel Choixen vun Amplicon.
● Virdrun Projet Erfahrung mat multiple Verstäerkung Ziler.
Service Virdeeler
●Isolatioun-gratis:Rapid Identifikatioun vun der mikrobieller Zesummesetzung an Ëmweltproben.
●Héich Opléisung: A wéineg reichend Komponenten an Ëmweltproben.
●Breet applicabel: Verschidde mikrobielle Gemeinschaftsstudien.
●Iwwergräifend Bioinformatesch Analyse: Déi lescht QIIME2 Package (quantitativ Abléck an mikrobieller Ökologie) mat diversen Analysen a punkto Datebank, Annotatioun, OTU / ASV.
●Extensiv Expertise: Mat 150 Tausend Amplicon Sequenzéierungsprojeten, déi jäerlech duerchgefouert ginn, bréngt BMKGENE iwwer e Jorzéngt Erfahrung, en héichqualifizéierten Analyseteam, ëmfaassenden Inhalt, an exzellente Post-Verkaf Support.
Service Spezifikatioune
| Bibliothéik | Sequenzéierungsstrategie | Daten recommandéiert |
| Amplicon | Illumina PE250 | 50/100/300K Tags (Read Pairs) |
Service Ufuerderunge
| Konzentratioun (ng/µL) | Gesamtbetrag (ng) | Volumen (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Buedem / Schlamm: 1-2g
● Intestinal Inhalt-Déier: 0,5-2g
● Intestinal Inhalt-Insekt: 0,1-0,25g
● Planzefläch (beräichert Sediment): 0,1-0,5g
● Fermentatioun Bouillon beräichert Sediment): 0,1-0,5g
● Faeces (grouss Déieren): 0,5-2g
● Faeces (Maus): 3-5grains
● Pulmonal alveolar Lavage Flëssegkeet: Filterpabeier
● Vaginale Schwämm: 5-6 Schwämm
● Haut / Genital Swab / Spaut / Oral Weichgewebe / Pharyngeal Swab / Rektal Swab: 2-3 Swabs
● Surface Mikroorganismen: Filterpabeier
● Waasserkierper / Loft / Biofilm: Filterpabeier
● Endophyten: 1-2g
● Dental Plaque: 0,5-1g
Service Work Flow
Echantillon Liwwerung
Bibliothéik Bau
Sequenzéieren
Donnéeën Analyse
No-Verkaf Servicer
Ëmfaasst déi folgend Analyse:
- Matière Daten Qualitéitskontroll
- OTU Clustering / De-Noise (ASV)
- OTU Annotatioun
- Alpha Diversitéit Analyse: Multiple Indizes, dorënner Shannon, Simpson an ACE.
- Beta Diversitéit Analyse
- Inter-Grupp Analyse
- Korrelatiounsanalyse: tëscht Ëmweltfaktoren an OUT Zesummesetzung an Diversitéit
- 16S funktionell Genprediktioun
Histogramm vun der taxonomescher Verdeelung
taxonomesch Heefegkeet Clustering Hëtzt Kaart
Alpha Diversitéit Analyse: Rarfaktiounskurve
Beta Diversitéit Analyse: NMDS
Intergroup Analyse: LEFSE Biomarker Entdeckung
Entdeckt d'Fortschrëtter erliichtert vum BMKGene's Amplicon Sequenzéierungsservicer mat Illumina duerch eng curéiert Sammlung vu Publikatiounen.
Dong, C. et al. (2022) 'Assemblée, Core Microbiota, and Function of the Rhizosphere Soil and Bark Microbiota in Eucommia ulmoides', Frontiers in Microbiology, 13. doi: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
Li, Y. et al. (2023) 'Synthetesch bakteriell Konsortia Transplantatioun fir d'Behandlung vu Gardnerella vaginalis-induzéierter bakterieller Vaginose bei Mais', Microbiome, 11(1), S. 1-14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. a Liu, H. (2022) 'Mikrobiome vu Loftstëbs gesammelt während dem Buedem-baséiert zouenen bioregenerative Liewensunterstëtzungsexperiment "Lunar Palace 365"', Environmental Microbiomes, 17(1), pp. 1–20. doi: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGUER/8.
Yin, S. et al. (2022) 'Feedstock-ofhängeg Iwwerfloss vu funktionnelle Genen am Zesummenhang mat Stickstofftransformatioun kontrolléierte Stickstoffverloscht am Kompostéieren', Bioresource Technology, 361, p. 127678. doi: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
