-
Hi-C secundum Chromatin Commercium
Hi-C modus destinatus est ad figuram genomicam capiendam componendo perscrutando interationes propinquitatis fundatae et per modum sequendi. Methodus in chromatin transversalis cum formaldehyde fundatur, digestio et re- ligatio sequitur in eo quod solum fragmenta, quae covalenter conectuntur, producta ligationem formant. Per has ligationem productorum sequendo, potest investigare 3D ordo genome. Hi-C perscrutatur distributionem portionum genome leviter refertae (A loculamenta, euchromatin) et magis verisimile esse transcriptionem activam et regiones arctius refertas (compartationes B, Heterochromatin). Hi-C etiam adhiberi potest ad Topologically Associatas Domains (TADs), regiones genome, quae structuras complicatas habent et similes expressiones habere exemplaria verisimile habent, et ansas chromatinas, DNA regiones quae a servo ancoris sunt et quae sunt, cognoscere. saepe ditatur in elementa regulatory. BMKGene Hi-C sequendo ministerium efficit inquisitores ad explorandum dimensiones genomicas spatiales, novas aditus aperiendi ad cognoscendam regulam genome eiusque effectus sanitatis et morbi.
-
Chromatin Immunoprecipitatio Sequencing (ChIP-seq)
Chromatin Immunoprecipitatio (CAPIO) ars est quae elementorum pressionibus selective ditat DNA ligationem servo eorumque genomica scuta respondentia. Integratio eius cum NGS dat profi- latam DNA scutorum profi- genome cum factoribus histonicis modificationis, transcriptionis et aliis servo DNA ligandi. Hic accessus dynamicus efficit comparationes situs ligandi per diversas cellulas rationes, textuum, vel condiciones. ChiP-Seq applicationes spatio ab investigationibus transcriptionalibus ordinandis et evolutionis meatibus ad mechanismos morbos elucidandos, id efficiunt necessarium instrumentum ad intelligendas regiones genomicas ordinandas et progressus therapeuticas pervestigationes.
Platform: Illumina NovaSeq
-
Totum genome bisulte sequencing(WGBS)
Totum Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) consistit ut methodologia aurea vexillum pro methylatione DNA altissimam explorationem, specie quintam positionis in cytosine (5-mC), moderatrix cardo expressionis genee et actionis cellulosae. Principium, quod WGBS subsit, tractationem bisulfitam implicat, inducens conversionem cytosinorum inmethylated ad uracil (C ad U), dum methylatos cytosinos immutato relinquens. Haec ars solutionem unicam basim praebet, investigatoribus permittit ut methyloma comprehendat et methylationis abnormes exemplaria cum variis condicionibus notabiliter cancer coniuncta detegat. Utendo WGBS, scientiarum scientias singulares in methylationis landscapes-latos pervestigationes consequi possunt, cum nihili praebet intellectum machinarum epigeneticorum quae diversos processus biologicos et morbos subsunt.
-
Chromatin Transposase accessible per High Throughput Sequencing (ATAC-seq)
ATAC-seq summus est pervestigationis ars sequendi usus ad chromatin analyseos accessibilitas genome latae. Usus profundiorem praebet cognitionem complexarum machinarum epigeneticae globalis potestatis super gene expressionis. Methodus transposisae hyperactivae Tn5 utitur ad simul fragmentum et regiones chromatinas apertas, inserendo adaptatores sequendo. Subsequens PCR amplificatio consequitur creationem bibliothecae sequentis, quae permittit ut comprehensive identificatio regionum apertarum chromatinorum sub certis temporis spatii conditionibus. ATAC-seq visum holistic praebet chromatin landscapes accessibiles, modi dissimiles, quae unice focus in transcriptione factoris ligandi sites vel regiones histon-moditas specificas. Sequens has regiones apertas chromatin, ATAC-seq regiones magis verisimile est ad regulatory sequentias activas et potentiale transcriptionem factoris situs ligandi, praebens pervestigationes pretiosas in dynamicam modulationem gene expressionis trans genome.
-
Repraesentatio Bisulfite Reducitur Sequencing (RRBS)
Repraesentatio Bisulfitae Reducta Sequencing (RRBS) emersit ut jocus sumptus efficax et efficax ad Integrum Genome Bisulfitum Sequencing (WGBS) in DNA methylation investigationis. Dum WGBS perceptiones comprehensivas praebet, totum genoma in uno basi resolutionis inspiciendo, summus sumptus factor eius limitans esse potest. RRBS opportuna hanc provocationem mitigat, selective dividendo partem repraesentativam genome. Haec methodus methodo CpG insularum opulentarum regionum locupletata nititur MspI bipertito, quam sequitur amplitudo lectionis 200-500/600 bps fragmentorum. Secuntur ergo solae regiones ad insulas CpG proximales, dum insulae CpG distantes ab analysi excluduntur. Hic processus, cum discursu bisulfite coniunctus, permittit ut summus resolutio detectionis methylationis DNA, et accessus sequens PE150, speciatim in fines insertorum potius quam medium intendit, augens methylationis efficientiam proflificationis. RRBS instrumentum inaestimabile est quo methylationi methylationi cost-efectiva dat et cognitioni mechanismi epigeneticae promovetur.
