Non-Reference based variant Sequencing-NGS
Features
Captura poly variant ante bibliothecam praeparationem
● Independentes genome alicuius referentiae: innixus de novo coetuum transcriptorum, generans album unigenis quae multiplicibus database annotata sunt (NR, Helvetica-Prot, COG, KOG, eggNOG, Pfam, GO, KEGG)
Comprehensive bioinformatic analysis of gene expression and transcript structure .
Servitium Commoda
●Expertise: cum track recordum processus super 600.000 exempla apud BMKGENE, varias formas specimen formans ut cellulas culturas, telas et humores corporis, turma nostra experientiae ad omne project opes adfert. Plus 100,000 mRNA-Seq incepta in variis ditionibus investigationis feliciter claudimus.
●Rigorous Quality Control: medias potestates efficiendi puncta per omnes gradus efficiendi, ex praeparatione exempli ac bibliotheca ad sequencias et bioinformaticas. Haec vigilantia exquisita efficit ut traditionem constanter summus qualitas consequitur.
Comprehensive Annotation: multis databases utimur ad officialiter annotate differentialiter expressas Genes (DEGs) ac debitam analysin perficiendam, perspicientias processuum cellularum et hypotheticarum quae responsionem transumptam afferunt.
●Post-Sales Support: munus nostrum ultra project complementum cum 3-mensibus post venditionis tempus extenditur. Hoc tempore consilium praebemus subsequens, adiumentum fermentum, et sessiones Q&A address quaelibet interrogationes ad eventus relatas.
Sample Requisita et Delivery
| Library | Sequencing strategy | Data commendatae | Qualitas Imperium |
| Poly A locupletatus | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 Gb | Q30≥85% |
Sample Requisita:
Nucleotides:
| Conc. | Moles (μg) | Puritas | Integritas |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Nullam dapibus vel dapibus vel DNA contagione gel ostensum est. | Pro plantis: RIN≥4.0; Pro animalibus: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; limitata vel non collocantur elevatione |
● Plantae:
Radix, Caulis vel Petal: 450 mg
Folium vel Semen: 300 mg
Fructus: 1.2 g
Animal:
Cor vel Intestinum: 300 mg
Viscera vel cerebrum: 240 mg
Musculus: 450 mg
Ossa, capillus vel cutis: 1g
Arthropoda:
Insecta: 6g
Crustacea: 300 mg
totum sanguinem: 1 tube
Cellulae: 106 cellulae
Sample Delivery commendatur
Continens: 2 ml tubum centrifugium (foil plumbi non commendatur)
Sample labeling: Group+replicata eg A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Shipment:
1. Siccum-glacies: Exemplaria in saccis referta necesse est et in glacie siccitate sepulta.
2. RNAstable tube: RNA specimina in RNA stabilizationis tubo exsiccata possunt (eg RNAstable®) et in cella temperatura exsiccata sunt.
Service Opus O
Experimentum design
Sample traditio
RNA extractionem
Library construction
Sequencing
Analysis Data
Post-venditionis officia
Bioinformatics
Transcriptomi collectio et selectio unigene
Unigene annotation
Sample correlationem et taxationem biologicam replicat
Aliter expressit Genes (DEGs)
Eget Annotationes DEGs
Eget eget DEGs
Progressiones explorare faciliores per BMKGene's eukaryotic NGS mRNA sequencing officia per curatam collectionem publicationum.
Shen, F. et al. (2020) 'De novo transcriptome coetum et sexu- bivium generum expressio in gonads Amur silurus (Silurus asotus)', Genomics, 112(3), pp. doi: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
Zhang, C. et al. (2016) 'Transcriptorum analysis metabolismi sucrosi in bulbi tumore et evolutione in cepa (Allium cepa L.)', Fines in Plant Science, 7 (Septembris), p. 212763. doi: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
Zhu, C. et al. (2017) 'De novo conventu, charactere et annotatione ad transcriptum Sarcocheilichthys sinensis', PLoS I, 12 (2). doi: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
Zou, L. et al. (2021) Analysis de novo transcriptome praebet perspectiones salis tolerantiae Podocarpi macrophylli sub salinitate accentus', BMC Plant Biologia, 21 (1), pp. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.
