GENOME EVOLUTIO, PANGENOME
Quid est Pan-genome?
Exaggerata argumenta ostendunt discrepantiam inter diversos speciei modos immanem esse posse. Unum genus unum tantum abest ut totam picturam geneticae unius speciei notitias consequi possit. Propositum studii Pan-genome est graphum genomicum latiorem speciei obtinere ac relationes inter lineamenta et codicem geneticum detexere, gerendo genome de novo coetu plurium modorum, qui profundiorem et latiorem metalla variationum permittit.
Trends of Pan-genome Study
Figure 1 De inclinationibus investigationis editorum chartarum Pan-genome.
Nota: Figura ostendit exitum sumendi "pan-genome" sicut verbum clavis ad investigandum titulos articulorum in Natura, Cell et Scientiarum diariorum seriei editorum.
a. Leges ex pluribus exemplis perpenduntur ad comparationem et unaaligned ones in nova contigua congregantur. His novis contiguis additis ad seriem referentiae originalis, pangenoma referentia construi potest. Regiones dispensabiles sunt secundum determinatas tabulas omnes perleget ad pangenome.
b. De novo conventus genomarum multiplicium accessionum permittit totam genome noctis accessionem ad cognoscendas regiones genomicas dispensabiles.
c. grapha pan-genome construi potest ex toto genome noctis vel de novo graphi conventu, quod varias informationes regionum dispensabilium ut singulares semitas per graphum efficaciter reponit.
Quomodo construere Pan-genome?
Figura 2 Comparatio pan-genome appropinquat1
a. Leges ex pluribus exemplis perpenduntur ad comparationem et unaaligned ones in nova contigua congregantur. His novis contiguis additis ad seriem referentiae originalis, pangenoma referentia construi potest. Regiones dispensabiles sunt secundum determinatas tabulas omnes perleget ad pangenome.
b. De novo conventus genomarum multiplicium accessionum permittit totam genome noctis accessionem ad cognoscendas regiones genomicas dispensabiles.
c. grapha pan-genome construi potest ex toto genome noctis vel de novo graphi conventu, quod varias informationes regionum dispensabilium ut singulares semitas per graphum efficaciter reponit.
Nuper edidit Pan-genomes
Rapta pan-genomes2
LycopersiciSusceptibility pan-genomes 3
Rice Pan -genome4
HELIANTHUS Pan-genome5
Soybean Pan-genome 6
Rice Pan-genome7
Hordeum Pan-genome8
Triticum Pan-genome9
Sorghum Pan-genome10
Phytoplankton Pan-genome11
Reference
1. Bayer PE, Golicz AA, Scheben A, Batley J, Edwards D. Pan-genomes plantae novae referuntur. Nat Plantarum. 2020, 6 (8): 914-920. doi:10.1038/s41477-020-0733-0
2. Song JM, Guan Z, Hu J, et al. Octo genomes summus qualitas patefacit architecturae pan-genomae et differentiatio oecotyporum napi Brassicae. Nat Plantarum. 2020, 6 (1): 34-45. doi:10.1038/s41477-019-0577-7
3. Gao L, Gonda I, Sun H, et al. Pan-genome lycopersicum aperit novas geneses et allelam rarum saporem fructuum ordinans. Nat Genet. 2019; 51 (6): 1044-1051. doi:10.1038/s41588-019-0410-2
Zhao Q, Feng Q, Lu H, et al. Analysis Pan-genome elucidat quatenus variationis genomicae in culta et silvestri oryza [edita correctio apparet in Nat Genet. 2018 Aug; Nat Genet. 2018;50(2):278-284. doi:10.1038/s41588-018-0041-z
5. Hübner S, Bercovich N, Todesco M, et al. Analysis HELIANTHUS pan-genome ostendit hybridizationem gene contentum alterari et morbo resistente. Nat Plantarum. 2019; 5(1): 54-62. doi:10.1038/s41477-018-0329-0
6. Liu Y, Du H, Li P, et al. Pan-Genome of Wild and Coltivated Soybeans. CELLAE. 2020; 182 (1):162-176.e13. doi:10.1016/j.cell.2020.05.023
7. Qin P, Lu H, Du H, et al. Pan-genome analysis 33 genetice diversarum accessionum oryzae occultas varietates genomicas revelat [ante typis impressi, 2021 Maii 25 editae]. CELLAE. 2021; S0092-8674(21)00581-X. doi:10.1016/j.cell.2021.04.046
8. Jayakodi M, Padmarasu S, Haberer G, et al. Pan-genome hordeum absconditum legatum mutationis feturae aperit. Naturae. 2020; 588(7837): 284-289. doi:10.1038/s41586-020-2947-8
9. Walkowiak S, Gao L, Monat C, et al. Tritici genomes multiplices produnt variationem globalem in recenti fetura. Naturae. 2020; 588(7837): 277-283. doi:10.1038/s41586-020-2961-x
10. Tao Y, Luo H, Xu J, et al. Variatio extensa in pan-genoma sorghum cultum et silvestre [antequam typis impressum, 2021 Maii 20 editum]. Nat Plantarum. 2021, 10.1038/ s41477-021-00925-x. doi:10.1038/s41477-021-00925-x
11. Fan X, Qiu H, Han W, et al. Phytoplankton pangenoma amplum prokaryoticum gene horizontalis translatio diversarum functionum indicat. Sci Adv. 2020; 6 (18): eaba0111. Published 2020 Apr 29. doi:10.1126/sciadv.aba0111
Post tempus: Jan-04-2022