Hi-C Ex Genome Conventus
Hi-C methodus destinata est ad chromosomatum conformationem capiendam coniungendo perscrutando interationes propinquitatis fundatae et per modum sequendi. Intensio harum interactionum negatione cum distantia physica in chromosomatum connecti creditur. Propterea Hi-C notitia adhibita est ad ordinandas racemos, ordinandas, et ordinandas series coactas in genome haustu et ancoras illas ad certum numerum chromoso- matis. Haec technologia praestat conventum genome chromosomatum in absentia tabulae geneticae multitudinis fundatae. Omne unum genome indiget Hi-C.
Features Service
● Sequentia in Illumina Nova Seq cum PE150.
● Munus requirit textus exempla, pro acida nucleica extracta, ut nexus cum formaldehyde et DNA interdum interactiones conservet.
● Experimentum Hi-C restrictionem et finem involvit reparationem fines viscosi cum biotino, sequitur circularisatio extremitatum obtusarum consequentium servato interactiones. DNA deinde globulis streptavidinis diruitur et ad praeparationem bibliothecae subsequentis purificatur.
Servitium Commoda
Overview of Hi-C
(Lieberman-Aiden E et al.Scientia, 2009)
●Excludit opus Geneticae incolarum data:Hi-C substituit essentiales informationes ad contigua ancoras requisitas.
●Altus titulus densitatis;ducens ad altum contiguum proportionem ancorarum supra 90%.
●Expertiae et publicationes amplissimae:BMKGene magnam experientiam habet cum plusquam 2000 casibus Conventus Hi-C Genome ex 1000 diversis speciebus et patentibus variis. Plus 200 casibus editis factorem super 2000 ictum accumulativum habent.
●Bigas peritissimus bioinformatics:cum in-domus diplomatis ac programmatibus per experimenta et analysi Hi-C data, programmatio visualisationis auto-evoluta dat impedimentum manualem movendi, convertendi, revocandi et redeundi.
●Post-Sales Support:Munus nostrum ultra project complementum cum 3-mensibus post venditionem tempus servitutis extenditur. Hoc tempore consilium praebemus subsequens, adiumentum fermentum, et sessiones Q&A address quaelibet interrogationes ad eventus relatas.
●Comprehensive Annotation: pluribus databases utimur ut officiatorie gena cum variationibus identificatis annotate et debitam analysi locupletationem perficiamus, perspicientia multiplicium investigationum incepta praebentes.
Service Specifications
| Bibliotheca praeparatoria | Sequencing strategy | Commendatur data output | Qualitas imperium |
| Hi-C bibliotheca | Illumina NovaSeq PE150 | 100x | Q30 ≥ 85% |
Sample Requisita
| TEXTUS | Requiritur moles |
| Animal Viscera | ≥ 2 g |
| Musculus animalis | |
| Mammalia Sanguis | ≥ 2 mL |
| GALLINA / Piscis Sanguinis | |
| Plant- Fresh Folium | ≥ 3 g |
| Cellulae cultae | ≥ 1x107 |
| Insect | ≥ 2 g |
Service Opus O
Experimentum design
Sample traditio
Library construction
Sequencing
Analysis Data
Post-venditionis officia
1) Rudis notitia QC
2) Hi-C bibliotheca QC: Hi-C valorem validum interactiones
3) Hi-C conventus: glomeratio contiguum in coetibus, quam sequitur contiguum ordinatio intra unumquemque coetum ac contiguum orientationem assignans.
IV) Hi-C iudicium
Hi-C Library QC - aestimatio Hi-C verum commercium pairs
Hi-C Conventus - statistics
Post-conventus iudicium - heatmap signorum intensio inter bins
Progressiones explorare faciliores per officia conventus BMKGene Hi-C per curatam collectionem publicationum.
Tian, T. et al. (2023) 'Conventus Genome et genetica dissectione siccitatis eminentis spelte repugnantis germplasmi', Natura Genetics 2023 55:3, 55(3), pp. doi: 10.1038/s41588-023-01297-y.
Wang, ZL et al. (2020) 'Conventus chromoso-Scale Asiae Honeybee Apis cerana Genome', Fines in Genetics, 11, p. 524140. doi: 10.3389/FGENE.2020.00279/BIBTEX.
Zhang, F. et al. (2023) 'Evolutionem tropani alkaloidei biosynthesis revelans duo genomata in familiae Solanaceae', Natura Communicationis 2023 14:1, 14(1), pp. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
Zhang, X. et al. (2020) 'Genomes Arboris Banianae et Pollinatoris Wasp Provide Insights in Fig-Wasp Coevolutionis', Cell, 183(4), pp. doi: 10.1016/J.CELL.2020.09.043
