Прокариот РНК ырааттуулугу
Өзгөчөлүктөр
● RNA үлгүсүн кайра иштетүү RRNA Depletion менен, андан кийин RNA китепканасын даярдоо менен жүрдү.
● Биоинформатикалык талдоо шилтеме геномуна тегиздөө
● анализ генди жана degs камтыйт, ошондой эле протоколдун түзүмү жана Srna анализи кирет
Кызматтын артыкчылыктары
●Сапатты катуу контролдоо: Биз ар кандай баскычтар, чогултуу жана китепкананын ырааттуулугуна жана биоинформатикага даярдануусунун бардык баскычтарын аткарабыз. Бул кылдаттык менен мониторинг ырааттуу сапаттуу натыйжаларды жеткирүүнү камсыз кылат.
●Странд-конкреттүү ырааттуу маалыматтар: РНК китепкананын даярдалышына байланыштуу, көзгө көрүнбөгөн стенограмманы идентификациялоого мүмкүнчүлүк берет.
●Прокариотко ылайыкташтырылган талдоо: Биоинформатикалык түтүктү гендин сөзүн талдоо гана, ошондой эле операцияларды, үрөнүн жана көмөкчү жактарды идентификациялоо. Ошондой эле ал Srnas талдоосу, тактап айтканда, аннотацияны жана орто түзүмдүн жана максаттардын болжолдоолорун камтыйт.
●Сатуудан кийинки колдоо: Биздин милдеттенме сатуу кызматынын 3 айдан кийин долбоордун аяктагандан тышкары, биздин милдеттенме узартылат. Ушул убакыт аралыгында биз долбоорду чечүү үчүн, көйгөйлөрдү чечүү үчүн, көйгөйлөрдү чечүү үчүн жана сессияларын жана жыйынтыктарын чечүү үчүн сессияларды сунуштайбыз.
Үлгү талаптары жана жеткирүү
| Китепкана | Сезүү стратегия | Берилген маалыматтар | Сапатты көзөмөлдөө |
| rrna reglese багытталган китепкана | Illumina pe150 | 1-2 ГБ | Q30≥85% |
Үлгү талаптары:
| Col. (Ng / μl) | Суммасы (ъг) | Тазалык | Бүтүндүгү |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260 / 280 = 1.8-2.0 OD260 / 230 = 1.0-2.5 Чектелген же гельде көрсөтүлгөн белок же DNA булганышы жок. | Rin≥6.5 |
Сунушталган үлгү жеткирүү
Контейнер: 2 мл центрифуга түтүк (калай фольга сунушталбайт)
Таанышуу этикетинин үлгүлүү энбелги: Топ + репликация, мисалы, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Жөнөтүү:
1. Кургак муз: үлгүлөр сумкаларга салынып, кургак-музга көмүлүшү керек.
2. Ранастикалык түтүктөр: РНК үлгүлөрү РНКнын стабилдештирүү түтүгүндө кургатылышы мүмкүн (мисалы, рантабелдик) жана бөлмө температурасына жөнөтүлөт.
Кызматтын агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкана курулушу
Sequencing
Маалыматтарды талдоо
Сатуу кызматтары
Биоинформатикалык анализ
Төмөнкү анализди камтыйт:
● Маалыматтын сапатын контролдоо
● шилтеме геномуна тегиздөө
● Китепкананын сапатын баалоо: rna фрегментациясы кокустук, көлөмүн жана ырааттуулугун кыстаруу
Fidented Моддинг генинин болжолдуу аннотациясы
● Үйрөнө билүү: Корреляция жана негизги компоненттин компонентин талдоо (PCA)
● Дифференциалдык Гендин сөзү (Degs)
Degs функционалдык аннотация жана байытуу
● Srna анализи: божомол, аннотация, максаттуу жана экинчи түзүлүш
Гранццоктун структурасын анализдөө: позициялар, позицияларды баштоо жана аяктоо жана аяктоо жана аяктоо
Сезим менен каныкуу
Суудун генинин функционалдык аннотациясы
Үлгүлөрдүн ортосундагы корреляция
Дифференциалдык билдирилген гендер (DEGS) талдоо
Функционалдык байытууну талдоо
Srna аннотация
БМКЖЕНДИН ЖАҢЫ УЗАКТУУ МРНА мырза мрам-мезгилди көздөгөн аймактар менен тааныштырылган ийгиликтерди изилдөө.
Гуан, КП жана Ал. (2018) "Биоофильм" глобалдык транскриптома софорея алоккуроиддеринин жалпы алкалеиддерине жооп берген биофильок формадагы глобалдык транскриптома,Поляк журналы микробиология, 67 (2), б. 223. DOI: 10.21307 / PJM-2018-024.
