Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Продукциялар

  • Геном боюнча ассоциациянын анализи

    Геном боюнча ассоциациянын анализи

    Genome-Wide Association Studies (GWAS) максаты белгилүү бир белгилерге (фенотиптерге) байланышкан генетикалык варианттарды (генотиптерди) аныктоо болуп саналат. Көптөгөн адамдардын бүт геному боюнча генетикалык маркерлерди текшерүү менен, GWAS популяция деңгээлиндеги статистикалык анализдер аркылуу генотип-фенотип бирикмелерин экстраполяциялайт. Бул методология адамдын ооруларын изилдөөдө жана жаныбарлардын же өсүмдүктөрдүн татаал белгилери менен байланышкан функционалдык гендерди изилдөөдө кеңири колдонууну табат.

    BMKGENEде биз чоң популяцияларда GWAS жүргүзүүнүн эки жолун сунуштайбыз: бүтүндөй геномдук ырааттуулукту (WGS) колдонуу же кыскартылган өкүлчүлүк геномунун секвенирлөө ыкмасын, үй ичинде иштелип чыккан Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) . WGS кичине геномдорго ылайыктуу болсо да, SLAF узунураак геномдору бар чоң популяцияларды изилдөө үчүн үнөмдүү альтернатива катары пайда болуп, секвенирлөө чыгымдарын эффективдүү азайтат, ошол эле учурда генетикалык маркерди ачуунун жогорку натыйжалуулугун кепилдейт.

  • Бир ядролуу РНКнын тизилиши

    Бир ядролуу РНКнын тизилиши

    Бир клетканы басып алуу жана жеке китепкана куруу ыкмаларын иштеп чыгуу, жогорку ылдамдыктагы секвенирлөө менен бирге, клетка деңгээлинде ген экспрессиясын изилдөөдө төңкөрүш жасады. Бул ачылыш комплекстүү клетка популяцияларын тереңирээк жана ар тараптуу анализдөөгө, бардык клеткалардагы ген экспрессиясын орточолоо менен байланышкан чектөөлөрдү жеңүүгө жана бул популяциялардын ичиндеги чыныгы гетерогендүүлүктү сактоого мүмкүндүк берет. Бир клеткалуу РНК тизмегинин (scRNA-seq) талашсыз артыкчылыктары бар, бирок ал бир клеткалуу суспензияны түзүү кыйынга турган жана жаңы үлгүлөрдү талап кылган кээ бир кыртыштарда кыйынчылыктарга туш болот. BMKGeneде биз заманбап 10X Genomics Chromium технологиясын колдонуу менен бир ядролуу РНК тизмегин (snRNA-seq) сунуштоо менен бул тоскоолдукту чечебиз. Бул ыкма бир клетка деңгээлинде транскриптомдук анализге ылайыктуу үлгүлөрдүн спектрин кеңейтет.

    Ядролорду изоляциялоо новатордук 10X Genomics Chromium чипинин жардамы менен ишке ашат, ал сегиз каналдуу микрофлюидикалык тутумду кош кайчылаштары бар. Бул системанын ичинде штрих-коддорду, праймерлерди, ферменттерди жана бир ядрону камтыган гель мончоктору нанолитр өлчөмүндөгү мунай тамчыларына капсулдалып, Гель Bead-in-Emulsion (GEM) пайда болот. GEM пайда болгондон кийин, клетка лизиси жана штрих-кодду чыгаруу ар бир GEM ичинде болот. Кийинчерээк, мРНК молекулалары 10X штрих-коддорун жана Уникалдуу Молекулярдык Идентификаторлорду (UMIs) камтыган cDNAларга тескери транскрипциядан өтүшөт. Андан кийин бул cDNA'лар стандарттуу секвенирлөө китепканасынын курулушуна дуушар болушат, бул бир клеткалык деңгээлде ген экспрессия профилдерин бекем жана ар тараптуу изилдөөгө көмөктөшөт.

    Платформа: 10 × Genomics Chromium жана Illumina NovaSeq платформасы

  • Өсүмдүктөрдүн/жаныбарлардын бүтүндөй геномунун тизилиши

    Өсүмдүктөрдүн/жаныбарлардын бүтүндөй геномунун тизилиши

    Бүтүндөй геномдун ырааттуулугу (WGS), ошондой эле секвенирлөө катары белгилүү, белгилүү шилтеме геномдору бар түрлөрдүн ар кандай индивиддеринин бүт геномунун секвенирлөөсүн билдирет. Мунун негизинде индивиддердин же популяциялардын геномдук айырмачылыктарын андан ары аныктоого болот. WGS бир нуклеотиддик полиморфизмди (SNP), киргизүүнү жок кылууну (InDel), структуранын вариациясын (SV) жана көчүрмө санынын вариациясын (CNV) аныктоого мүмкүндүк берет. SVs SNPs караганда вариация базасынын көбүрөөк бөлүгүн түзөт жана геномго көбүрөөк таасир этет, тирүү организмдерге олуттуу таасир этет. Кыска окуу ырааттуулугу SNP жана InDelsди аныктоодо эффективдүү болсо да, көпкө окулуучу секвенирлөө чоң фрагменттерди жана татаал вариацияларды так аныктоого мүмкүндүк берет.

  • 10x Genomics Visium Spatial Transcriptome

    10x Genomics Visium Spatial Transcriptome

    Мейкиндик транскриптомикасы изилдөөчүлөргө мейкиндик контекстти сактап, кыртыштардагы ген экспрессияларын изилдөөгө мүмкүндүк берген алдыңкы технология. Бул домендеги бир күчтүү платформа Illumina секвенциясы менен бирге 10x Genomics Visium болуп саналат. 10X Visium принциби кыртыш бөлүмдөрү жайгаштырылган атайын кармоо аймагы бар адистештирилген чипте жатат. Бул басып алуу аймагы кыртыштын ичиндеги уникалдуу мейкиндикке туура келген штрих коддуу тактарды камтыйт. Андан кийин кыртыштан алынган РНК молекулалары тескери транскрипция процессинде уникалдуу молекулярдык идентификаторлор (UMIs) менен белгиленет. Бул штрих-коддуу тактар ​​жана UMIs так мейкиндик картасын түзүүгө жана бир клеткалык резолюцияда ген экспрессиясын сандык аныктоого мүмкүндүк берет. мейкиндик штрих-код үлгүлөрү жана UMIs айкалышы түзүлгөн маалыматтардын тактыгын жана өзгөчөлүгүн камсыз кылат. Бул мейкиндиктик транскриптомика технологиясын колдонуу менен изилдөөчүлөр клеткалардын мейкиндик уюмун жана кыртыштарда болуп жаткан татаал молекулярдык өз ара аракеттенишүүнү тереңирээк түшүнүп, бир нече тармактарда, анын ичинде онкология, неврология, өнүгүү биологиясы, иммунологиядагы биологиялык процесстердин негизинде жаткан механизмдер жөнүндө баа жеткис түшүнүктөрдү сунуштай алышат. , жана ботаникалык изилдөөлөр.

    Платформа: 10X Genomics Visium жана Illumina NovaSeq

  • Толук узундуктагы мРНК ырааттуулугу-нанопур

    Толук узундуктагы мРНК ырааттуулугу-нанопур

    NGS негизинде мРНК секвенирлөө ген экспрессиясын сандык аныктоо үчүн ар тараптуу курал болуп саналат, ал эми анын кыска окууга таянуу татаал транскриптомиялык анализдер анын натыйжалуулугун чектейт. Башка жагынан алганда, nanopore секвенирлөө толук узундуктагы мРНК транскрипттерин ырааттуулугун камсыз кылуу, узак окуу технологиясын колдонот. Бул ыкма альтернативдик сплайсингди, гендердин синтезин, поли-аденилденүүнү жана мРНК изоформаларынын сандык көрсөткүчтөрүн комплекстүү изилдөөгө көмөктөшөт.

    Nanopore секвенсировкасы, нанопоралуу бир молекуладан турган реалдуу убакыттагы электрдик сигналдарга таянган ыкма, реалдуу убакытта жыйынтыктарды берет. Кыймылдаткыч белокторду жетектеген кош саптуу ДНК чыңалуунун айырмасы астында нанопор каналы аркылуу өтүп жатканда, биоплёнкага камтылган нанопороктук белоктор менен байланышат. ДНК тилкесиндеги ар кандай негиздер тарабынан түзүлгөн айырмаланган электрдик сигналдар реалдуу убакыт режиминде аныкталып, классификацияланып, так жана үзгүлтүксүз нуклеотиддердин тизилишине көмөктөшөт. Бул новатордук ыкма кыска окуу чектөөлөрдү жеңет жана татаал геномдук анализ үчүн динамикалык платформаны камсыз кылат, анын ичинде татаал транскриптомиялык изилдөөлөр, дароо жыйынтыктар менен.

    Платформа: Nanopore PromethION 48

  • Толук узундуктагы мРНК секвенирлөө -PacBio

    Толук узундуктагы мРНК секвенирлөө -PacBio

    NGS негизинде mRNA секвенциясы ген экспрессиясын сандык аныктоо үчүн ар тараптуу курал болуп саналат, ал эми анын кыска окууга көз карандылыгы татаал транскриптомиялык анализдерде колдонууну чектейт. Башка жагынан алганда, PacBio секвенирлөө (Исо-Seq) толук узундуктагы мРНК транскрипттеринин секвенирлөөсүнө мүмкүндүк берүүчү узак окуу технологиясын колдонот. Бул ыкма альтернативдик сплайсингди, гендердин синтезин жана поли-аденилденүүнү комплекстүү изилдөөгө көмөктөшөт. Бирок, талап кылынган маалыматтардын жогорку көлөмүнө байланыштуу ген экспрессиясын сандык аныктоо үчүн башка тандоолор бар. PacBio секвенирлөө технологиясы толук узундуктагы мРНК транскрипттерин басып алууда өзгөчө артыкчылыкты камсыз кылуучу бир молекулалуу, реалдуу убакыт (SMRT) секвенирлөөсүнө таянат. Бул инновациялык ыкма секвенирлөө учурунда ДНК полимераза активдүүлүгүнө реалдуу убакыт режиминде байкоо жүргүзүүгө мүмкүндүк берген нөл режиминдеги толкун өткөргүчтөрдү (ZMWs) жана микрофабрикалуу скважиналарды колдонууну камтыйт. Бул ZMWдердин ичинде PacBio'нун ДНК полимеразасы ДНКнын толуктоочу тилкесин синтездейт, мРНК транскрипттеринин бардыгын камтыган узун окууларды жаратат. Circular Consensus Sequencing (CCS) режиминде PacBio иштеши бир эле молекуланы кайра-кайра секвенирлөө аркылуу тактыкты жогорулатат. Түзүлгөн HiFi окуулары NGS менен салыштырууга боло турган тактыкка ээ, андан ары татаал транскриптомиялык өзгөчөлүктөргө ар тараптуу жана ишенимдүү талдоо жүргүзүүгө көмөктөшөт.

    Платформа: PacBio Sequel II; PacBio Revio

  • Эукариоттук мРНК ырааттуулугу-NGS

    Эукариоттук мРНК ырааттуулугу-NGS

    mRNA секвенциясы, ар тараптуу технология, белгилүү бир шарттарда клеткалардын ичиндеги бардык мРНК транскрипттерин комплекстүү профилдештирүү мүмкүнчүлүгүн берет. Кеңири колдонулушу менен бул алдыңкы курал гендердин татаал экспрессия профилдерин, ген структураларын жана ар түрдүү биологиялык процесстер менен байланышкан молекулярдык механизмдерди ачып берет. Фундаменталдык изилдөөдө, клиникалык диагностикада жана дары-дармектерди иштеп чыгууда кеңири колдонулган mRNA секвенциясы клеткалык динамика жана генетикалык жөнгө салуунун татаалдыктары жөнүндө түшүнүктөрдү сунуштайт, бул анын ар түрдүү тармактардагы потенциалына кызыгууну жаратат.

    Платформа: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7

  • Шилтеме эмес негизделген mRNA Sequencing-NGS

    Шилтеме эмес негизделген mRNA Sequencing-NGS

    mRNA секвенциясы белгилүү бир шарттарда клеткалардын ичиндеги бардык мРНК транскрипттеринин комплекстүү профилин түзүүгө мүмкүнчүлүк берет. Бул алдыңкы технология күчтүү курал катары кызмат кылат, татаал ген экспрессия профилдерин, ген структураларын жана ар түрдүү биологиялык процесстер менен байланышкан молекулярдык механизмдерди ачат. Фундаменталдык изилдөөдө, клиникалык диагностикада жана дары-дармектерди иштеп чыгууда кеңири колдонулган mRNA секвенциясы уюлдук динамика жана генетикалык жөнгө салуунун татаалдыктары жөнүндө түшүнүктөрдү сунуш кылат.

    Платформа: Illumina NovaSeq X; DNBSEQ-T7

  • Long Non-coding Sequencing-Illumina

    Long Non-coding Sequencing-Illumina

    Узун коддолбогон РНКлар (lncRNAs) минималдуу коддоо потенциалына ээ жана коддолбогон РНКнын негизги элементтери болуп саналган 200 нуклеотидден узунураак. Ядродо жана цитоплазмада табылган бул РНКлар эпигенетикалык, транскрипциялык жана посттранскрипциялык жөнгө салууда маанилүү ролду ойноп, алардын клеткалык жана молекулярдык процесстерди калыптандыруудагы маанисин баса белгилейт. LncRNA секвенциясы Клетканын дифференциациясында, Онтогенезде жана Адамдын ооруларында күчтүү курал болуп саналат.

    Платформа: Illumina NovaSeq

  • Small RNA Sequencing-Illumina

    Small RNA Sequencing-Illumina

    Чакан РНК (sRNA) молекулаларына микроРНКлар (миРНКлар), кичинекей интерференцияланган РНКлар (siRNAs) жана piwi-өз ара аракеттенүүчү РНКлар (piRNAs) кирет. Булардын арасында 18-25 нуклеотидге жакын миРНКлар ар кандай клеткалык процесстердеги негизги жөнгө салуучу ролдору үчүн өзгөчө көңүл бурат. кыртыш-спецификалык жана этап-спецификалык экспрессия үлгүлөрү менен, miRNAs ар кандай түрлөрү боюнча жогорку сактоону көрсөтөт.

    Платформа: Illumina NovaSeq

  • CircRNA Sequencing-Illumina

    CircRNA Sequencing-Illumina

    Тегерек РНК секвенциясы (circRNA-seq) бул РНКнын туруктуулугун жогорулатуу менен камсыз кылуучу, канондук эмес сплайсинг окуяларынан улам жабык циклдерди түзгөн РНК молекулаларынын классы болгон тегерек РНКларды профилдештирүү жана талдоо. Кээ бир circRNAs микроРНК губка катары иш-аракет кылып, микроРНКларды секвестрлеп, алардын максаттуу mRNAs жөнгө салууга жол бербестен, башка circRNAs белоктор менен өз ара аракеттениши мүмкүн, ген экспрессиясын модуляциялайт же клеткалык процесстерде роль ойношу мүмкүн. circRNA экспрессия анализи бул молекулалардын жөнгө салуучу ролдору жана алардын ар кандай клеткалык процесстердеги, өнүгүү этаптарында жана оорунун шарттарында мааниси жөнүндө түшүнүктөрдү берет, бул ген экспрессиясынын контекстинде РНКны жөнгө салуунун татаалдыгын тереңирээк түшүнүүгө өбөлгө түзөт.

  • Бүтүндөй транскриптомдук ырааттуулук – Иллюмина

    Бүтүндөй транскриптомдук ырааттуулук – Иллюмина

    Бүтүндөй транскриптомдук секвенирлөө коддоону (mRNA) жана коддолбогон РНКларды (lncRNA, circRNA жана miRNA) камтыган түрдүү РНК молекулаларын профилдештирүү үчүн комплекстүү мамилени сунуштайт. Бул ыкма белгилүү бир көз ирмемде белгилүү бир клеткалардын бүт транскриптомдорун басып алат, бул клетка процесстерин толук түшүнүүгө мүмкүндүк берет. Ошондой эле "жалпы РНК секвенциясы" деп аталат, ал транскриптомдун деңгээлинде татаал жөнгө салуучу тармактарды ачууга багытталган, бул атаандаш эндогендик РНК (ceRNA) жана биргелешкен РНК анализи сыяктуу терең талдоо жүргүзүүгө мүмкүндүк берет. Бул өзгөчө circRNA-miRNA-mRNA-негизделген ceRNA өз ара аракеттенүүсүн камтыган жөнгө салуучу тармактарды ачууда, функциялык мүнөздөмөнүн алгачкы кадамын белгилейт.

  • Хроматиндин иммунопреципитациясынын секвенциясы (ChIP-seq)

    Хроматиндин иммунопреципитациясынын секвенциясы (ChIP-seq)

    Хроматин иммунопреципитациясы (CHIP) бул ДНКны байланыштырган белокторду жана аларга тиешелүү геномикалык максаттарды тандап байытуу үчүн антителолорду колдонгон ыкма. Анын NGS менен интеграциясы гистондун модификациясы, транскрипция факторлору жана башка ДНКны байланыштыруучу белоктор менен байланышкан ДНК максаттарынын геномдук профилин түзүүгө мүмкүндүк берет. Бул динамикалык ыкма ар кандай клетка типтери, кыртыштар же шарттар боюнча байланыш сайттарды салыштырууга мүмкүндүк берет. ChIP-Seq тиркемелери транскрипциялык жөнгө салуу жана өнүгүү жолдорун изилдөөдөн оору механизмдерин түшүндүрүүгө чейин, аны геномдук жөнгө салуу пейзаждарын түшүнүү жана терапиялык түшүнүктөрдү өркүндөтүү үчүн алмаштырылгыс куралга айлантат.

    Платформа: Illumina NovaSeq

Бизге билдирүүңүздү жөнөтүңүз: