Heatmap
Жылтыратуу куралы Matrix маалымат файлын киргизүү катары кабыл алат жана колдонуучуларга маалымат чыпкалоого, нормалдаштыруу жана кластердик маалыматтарды берүүгө мүмкүнчүлүк берет. Үнсүздөр үчүн негизги пайдалануу иши - ар кандай үлгүлөрдүн арасында ген гендин деңгээл деңгээлин кластерлөө.
Ген аннотация
Гендин аннотация куралы гендин аннотациясына ар кандай маалымат базаларына каршы кириш файлдарын тизилбестиктин тизилишине таянууга негиз болгон гендин аннотациясын жүргүзөт.
Негизги жергиликтүү тегиздөө Издөө куралы (Blast)
Bmkbi жарылуусунун BMKCLUUD тарабынан BMKCLUD интеграцияланган версиясы болуп саналат жана BMKCLOUD эсебине жүктөлгөн маалыматтарды колдонуп, ошол эле функцияларды аткарууга колдонсо болот.
CD_UTR божомол
CDS_UTR божомолдоо куралы, Белгилүү протеин маалымат базаларына жана ORF деп божомолдонгон натыйжаларга каршы жарылуу натыйжаларын жана божомолдонгон натыйжаларга каршы жарылуудан келип чыккан протеиндик базаларга негизделген коддоо региондорун (UTR) болжолдоо үчүн иштелип чыккан.
Манхэттендин участогу
Манхэттен сюжетинин участогунун куралы жогорку үлгү тажрыйбасынын эксперименттерин көрсөтүүгө мүмкүндүк берет жана жалпысынан геном-кеңдик чөйрөсүндө (Gwas) колдонулат.
Circos диаграммасы
Circos Диаграммасынын куралы Геномдук өзгөчөлүгү Геномдук өзгөчөлүктөрүн натыйжалуу визуализациялоону камсыз кылат. Жалпы функцияларды сандык loci, snps, инделлектик, структуралык жана көчүрүү номерин камтыйт.
Джин Онтология (GO) Байтайыр
Байкоо байытуу куралы функционалдык байытууну иштеп чыгат. Бул куралдагы негизги программа - бул Differial сөз айкашы анализин камтыган Topgo-Biocondactor пакети, анын натыйжаларын байытууну жана натыйжаларды байытууну жүргүзүү.
Салмактагы Gener
WGCNA - бул гендин сөз айкашы модулдарын ачуу үчүн кеңири колдонулган маалыматтарды кен казуу ыкмасы. Ал ар кандай сөз айкашын, анын ичинде микроаррай жана NGS Express Express маалыматы.
Интерпроскан
Интерпроскананын куралы Интерполин интерпорлордун ырааттуулугун жана классификациялоону камсыз кылат.
Go Kegg Berichment
Go Kegg Begrictment куралын байытуу үчүн дизайн болуп саналат, берилген генди орнотулган жана тиешелүү гендин негизинде бергисин байытуучу гистограмма жана кегг байытуу жолдору.