Genom Evolution
ПНА
Голдфиштин эволюциялык байланышы жана үй-бүлөлүк тарыхы (Carassius Auratus)
Pacbio | Иллюмина | Bionano Genome Map | Хи-С Генозум Ассамблея | Генетикалык карта | Gwas | RNA-SEQ
Урунттуу ойлор
1.Goldfish Genome сапаттуу резервдик версиясы менен, 95,75% 95,75% детчеткелди, 50 псевоцкомосомаларга (Scaffold n50 = 31.84 MB) жаңыртылды. Эки субгенома байкалды.
1.Жокалай мезгилинде тандалма шыпыргычтардын 2. КИРИВИГИ РЕГИЗДЕРИ ТҮШҮНГӨНДӨӨ 201 АДАМДАР 201-ЖЫЛДЫН ТӨМӨНҮНДӨГҮНҮН ПАЙДАЛАНУУНУН ТӨМӨНҮНДӨГҮ ОРГАНДАРЫНЫН ЗАКАЛУУЛУКТАРЫНЫН ПРОГРАММАСЫТЫН ТҮШҮНГӨНДӨГҮ ТҮШҮНГӨНДӨГҮ КАНДАЙ КАНДАЙ БОЛГОНДУКТУУ КАНДАЙ БОЛГОНУН АЛЫП КАЛДЫ.
3.Жаңалардагы Голдфиштин Дорсалдык финалына 3GWAS 378 талапкер генди пайда болгону аныкталды. Торозин-протеин Киназалык кабарчысы ачык-айкындуулук менен байланышкан талапкер каардал гени катары аныкталды
Фон
Голдфиш (Калассиус Ауратус) байыркы Кытайда багылган балык уулдарынын бири. Алар Чарльз Дарвиндин айткандары "" Дээрлик чексиз ар түрдүүлүктүн ар түрдүүлүгүн өтпөй, биз түзүлүштү эң сонун өзгөртүүлөр менен жолуктурабыз "деп түшүндүрүштү. Абдан ар түрдүү өзгөчөлүктөр жана жашоонун жана асыл тукум түйшүктүү тарыхы Голдбиликт балыктарды физиология жана эволюция үчүн мыкты генетикалык моделдик тутумун жаратат.
Жетишкендиктер
Goldfish Genome
JПасбио жана Илимина жуптарын талдоо, 2013-жылдын алгачкы 1,657 G долбоорун (contig n50 = 474 КБ) түшүм берет. Бионанонун оптикалык картасы түзүлгөн жана чогулушту 1,73 ГБга 1,73 ГБга (болжолдуу геном өлчөмү: 1.8 ГБ) түздү. Hi-C негизиндеги Ассамблея 606 КБ чейин 606 КБ чейинки SCAFFOLD SCAFFOLD SCAFFOLD 31,84 MBга чейин (1,65% га чейин) (1,65 ГБ) багытталган жана бухгалтердик эсепти буюртмацияга жетишти. Генуя 56 251 коддоо генин жана 10 098 узун коддоо транскрипциясын түзөт. Андан тышкары, 50 хромосомадан 50гө чейин
Gold Fig.1 Gold Fish геному
TБайыркы гибридизация иш-чарасына алып келген 50 алтын балык хромосомосунда субгеномдордун так белгилери аныкталган. Голдфиш менен Барбинадагы окууларынын үлүшү бар хромосомалардын топтому (CHRA01 ~ A25), б.а. Барбинадагы субгеномация катары аныкталган, б.а. барбина жана субгеномдук б (chrb01 ~ b25);
Тандалма шыпыруу
AБардыгы болуп 16 жапайы типтеги Крудань жана 185 өкүлчүлүк алтын балык варианттары орто эсеп менен 12,5x, болжол менен 4,5 фунт маалыматтарды түзүп, 4,3 терабазды түзүшөт. Филогенетикалык реконструкциялоо жана PCA талдоосу жалпы алтын балык жана крудан карп менен бирге бөлүнгөн башка алтын балыкка салыштырмалуу бир топ эки бурмакка бөлүнөт.
LD Жогорудагы төрт субполяцияларда талдоодо калктын генетикалык боттлетенектин үй-бүлөдөгү голдфиште жасалма тандоо учурунда колдоого алынган. Крудиан карб-урп-круданын (π) ири алтын алтын балык жана жумуртка алтын балыкчылыгына чейин, генетикалык ар түрдүүлүктөн (π) жогорулоо. 25,2 МБ жана 946 генди камтыган 50 МБ жана 946 генди жабуу (33 алтын балык жана 16 круданлык Crap). 201 Жеке адамдарга талдоону кеңейтүү, 393 Гендер аяктаган Тандалган шыпыруу аймак. Бул гендер аз ар кандай ар түрдүүлүктүн төмөндөшү байкалган, алар алтын балык актыларындагы ири жайларга байланыштуу фенотиптерге салым кошушкан.
Genom-геном-кенен-центүүлүктү анализдөө
Голдфишке байланыштуу Gwas
Dorsal fin - бул негизги өзгөчөлүк - BEN GOLDFISHтин жумуртка алтын балыкынан айырмаланат. 96 Вен Голдфишке жана 87 жумуртка Голдфиш Голдфиш Голдфиш 138 кандидаттык Голдфиш ачылды 13 хромосома жана субгеномиздердин ортосундагы бул гендердин тегиз эмес бөлүштүрүлүшү байкалган. Бул талапкер гендерге функционалдык анализ, анын ичинде "клетка бетинин кабылдагычка сигналы", "трансмумброн", "скелеттык системаны өнүктүрүү" ж.б.
Голдфиште Дорсалдык Финдин Dorsal Fin
In ачык шкала менен байланышкан сапаттардын гвалары, бир күчтүү бирикменин чокусу аныкталды. Кандин-протеин киназинцторун коддоочу гендер талапкерлердин аймактарынын биринде аныкталган.
Транспорттук шкала жөнүндө анжир
Маалымдама
CHen D et al. Голдфиштин эволюциялык байланышы жана үй-бүлөлүк тарыхы (Carassius Auratus). (2020)
Жаңылыктар Ийгиликке жеткен илимий жетишкендиктерди, ошондой эле изилдөө учурунда колдонулган көрүнүктүү ыкмаларды жана белгилүү бир ыкмаларды тарткан акыркы ийгиликтүү иштерди бөлүштүрүүдө.
Пост убактысы: 04-20-2022-жыл