Genome Evolution, Pangenome
Pan-геном деген эмне?
Топтолгон далилдер бир түрдүн ар кандай штаммдарынын ортосундагы дисперсия чоң болушу мүмкүн экендигин көрсөтүп турат. Бир бир түрдүн генетикалык маалыматтарын алуу үчүн бир гана геному жетишсиз. Пан-геномдун изилдөөсүнүн максаты - бир түрдүн ар тараптуу глагикалык графигин алуу жана вариациялардын тереңирээк жана кеңири жайылышына жол ачкан көптөгөн штаммдарды өткөрүү жана генетикалык коддордун ортосундагы мамилелерди жана генетикалык коддордун ортосундагы мамилелерди чечүү.
Пан-Геномдун изилдөөсүнүн тенденциялары
1-сүрөт. Пан-геномдун жарыяланган илимий-изилдөө документтеринин тенденциялары.
ЭСКЕРТҮҮ: Табияттагы макалалардын аталыштарын, клетка жана илим тармагынын журналдарынын журналдар
а. Бир нече үлгүлөрдөн окуйт, маалымдама жана белгиленген тартпаган роман коштоолоруна чогултулат. Түпнуска маалымдама ырааттуулугуна ушул роман коштошуу менен, Пангеном шилтемеси курууга болот. Дайындылар аралык региондордун бардыгы картага түшүрүүнүн негизинде Таненомага кайтып баргандыгы аныкталат.
б. Де Ново-Ново ышкысы, бир нече жолдун геномдорунун геномдорунун геномдук мамилелерине ар кандай геномиялык женномикалык аймактарды аныктоо.
с. Пан-геномдун графиги Графтагы уникалдуу жолдор катары ар тараптуу аймактардын варианттык эмес маалыматтарын натыйжалуу сактоого мүмкүндүк берүүчү геномдук тегиздиктен же ДЭК графикасы менен курулган.
Пан-Геномду кантип курууга болот?
2-сүрөт. Пан-геном мамилелерин салыштыруу1
а. Бир нече үлгүлөрдөн окуйт, маалымдама жана белгиленген тартпаган роман коштоолоруна чогултулат. Түпнуска маалымдама ырааттуулугуна ушул роман коштошуу менен, Пангеном шилтемеси курууга болот. Дайындылар аралык региондордун бардыгы картага түшүрүүнүн негизинде Таненомага кайтып баргандыгы аныкталат.
б. Де Ново-Ново ышкысы, бир нече жолдун геномдорунун геномдорунун геномдук мамилелерине ар кандай геномиялык женномикалык аймактарды аныктоо.
с. Пан-геномдун графиги Графтагы уникалдуу жолдор катары ар тараптуу аймактардын варианттык эмес маалыматтарын натыйжалуу сактоого мүмкүндүк берүүчү геномдук тегиздиктен же ДЭК графикасы менен курулган.
Жакында Пан-геномдор жарыяланган
● Зордуктоо геномдору2
● Помидор Пан-геном 3
● Rice Pan -Женом4
● Күн карама Pan-Genome5
● Seybean Pan-Genome 6
● Rice Pan-Genome7
● Барли Пан-Геном8
● буудай пан-геном9
● Sorghum Pan-Genome10
Pan-геном фитопланктон11
Маалымдама
1. Байер-Пе, Голикц А.А., Шебен А, Батли Дж, Эдвардс Д. Пан-геному - бул жаңы маалымдама. Нат өсүмдүктөрү. 2020; 6 (8): 914-920. DOI: 10.1038 / S41477-020-0733-0
2. JM, Guan Z, Hu J ж.б. Сегиз жогорку сапаттагы геномдар Пан-Генома архитектурасын жана brassica напусун эикотип дифференциялоосун ачып берет. Нат өсүмдүктөрү. 2020; 6 (1): 34-45. DOI: 10.1038 / S41477-019-0577-7
3. Gao L, Gonda I, Sun H жана al. Помидор Паномень-Геном жаңы гендерди ачып, сейрек кездешүүчү аллелди жөнгө салуучу жемиш даамы. Nat Genet. 2019; 51 (6): 1044-1051. DOI: 10.1038 / S41588-019-0410-2
4. Чжао С, Фэн Ц, Лу Ч. Паноро-геном талдоо өстүрүлгөн жана жапайы күрүчкө геномикалык өзгөрүүлөрдүн деңгээлин баса белгилейт [Басылып чыккан оңдоо NAZ генетунда пайда болот. 2018 август; 50 (8): 1196]. Nat Genet. 2018; 50 (2): 278-284. DOI: 10.1038 / S41588-018-0041-Z
5. Hüobner S, bercovich n, tododesco m жана al. Күн карама-каржылоо Pan-геном талдоо көрсөткөндөй, гибридизация ген мазмунун жана илдеттерди каршылык көрсөтөт. Нат өсүмдүктөрү. 2019; 5 (1): 54-62. DOI: 10.1038 / S41477-018-0329-0
6. LIU Y, du h, l, l, et al. Жапайы жана өстүрүлгөн соянын казына геному. Клетка. 2020; 182 (1): 162-176.e13. DOI: 10.1016 / J.Cell.2020.05.023
7. Qin P, Lu H, du h ж.б. 33 Генетикалык жактан ар кандай күрүчкө жетүү үчүн PAN-геномдук анализи Жашырылган геномикалык өзгөрүүлөрдү ачып [online алдыда, 2021-жылдын 25-майында жарыяланган 10-май]. Клетка. 2021; S0092-8674 (21) 00581-x. Дой: 10.1016 / J.Cell.2021.04.046
8. Jayakodi M, Padmarasu s, haberer g ж.б. Арпа Пан-Гэном Мутацияны багуунун жашыруун мурасын ачып берет. Жаратылыш. 2020; 588 (7837): 284-289. DOI: 10.1038 / S41586-020-2947-8
9. Walkowiak s, гао л, монат с жана башкалар. Бир нече буудай геному заманбап асыл тукумдагы глобалдык өзгөрүүлөрдү ачып берет. Жаратылыш. 2020; 588 (7837): 277-283. DOI: 10.1038 / S41586-020-2961-X
10. Тао Y, Luo H, Xu J ж.б. Айдоо жана жапайы соргумдун бактысынын алкагында кеңири вариацияда [онлайн режиминде жарыяланган 2021-жылдын 20-майында жарыяланган. Нат өсүмдүктөрү. 2021; 10.1038 / S41477-021-00925-x. DOI: 10.1038 / S41477-021-00925-X
11. Күйөрман х, qiu h, han w ж.б. Фитопланктон Пангенома Поакенотикалык горизонталдуу горизонталдуу генди ар түрдүү функцияларды өткөрүп берет. SCI ADV. 2020; 6 (18): eaba0111. 29-апрелде жарыяланган 2020-апр. DOI: 10.1126 / Sciadv.aba0111
Пост убактысы: 04-20-2022-жыл