Nanopore негизделген Толук узундуктагы Транскриптомдун ырааттуулугу
Nanopore секвенциясы башка секвенирлөө платформаларынан айырмаланат, мында нуклеотиддер түздөн-түз ДНК синтезисиз окулат жана ондогон килобазаларда узак окууларды жаратат. Бул толук метраждуу стенограммаларды түз окууга жана транскриптомиялык изилдөөлөрдөгү кыйынчылыктарды чечүүгө мүмкүнчүлүк берет.
√ Төмөнкү ырааттуулуктун өзгөчөлүгү
√ Ген структурасын изилдөө үчүн cDNAнын толук узундуктагы окуусу
√ Бир эле сандагы стенограммаларды жабуу үчүн азыраак маалымат талап кылынат
√ Бир генге бир нече изоформаларды аныктоо
√ Изоформа деңгээлинде туюнтмаларды сандаштыруу
Типтүү биоинформатика түтүгү
Biomarker Technologies менен акыркы ийгиликтүү учурлар
1. Толук узундуктагы транскриптомдордун салыштырма анализи Gnetum luofuense сабагынын өнүгүү динамикасын аныктайт.
Журнал: Генетикадагы чек аралар
Жарыяланганы: 2021-жылдын марты
Keywords: MinION | Альтернативалык бириктирүү | APA | lncRNA | Дифференциалдык түрдө чагылдырылган транскрипттер
Толук текстти окуу
2. Түр аралык гетерогранспланттарда кичинекей РНКлардын бүчүрлөрдөн тамырларга бир багыттуу кыймылы
Журнал: Табигый өсүмдүктөр
Жарыяланганы: январь, 2021
Keywords: Nanopore | Illumina | толук узундуктагы мобилдик mRNA аныктоо
3. Аспаржа тамырларынын толук узундуктагы транскриптомдук анализи арбускулярдуу микоризалык козу карындар тарабынан пайда болгон тузга толеранттуулуктун молекулярдык механизмин ачып берет.
Журнал: Экологиялык жана эксперименталдык ботаника
Жарыяланганы: январь, 2021
Keywords: MinION | Дифференциалдуу туюнтулган транскрипттер | Транскрипция факторлору | Альтернативалык бириктирүү
4. Кургакчылык стрессине жооп катары роза (Rosa chinensis) тамыры менен жалбырактарынын физиологиялык мүнөздөмөлөрүнүн өзгөрүүсү жана толук узундуктагы транскриптому
Журнал: Өсүмдүктөрдүн жана клеткалардын физиологиясы
Жарыяланганы: 2020-жылдын октябры
Keywords: PromethION | Дифференциалдуу туюнтулган транскрипттер | Функционалдык болжолдоо | Spliced isoforms | TF жана lncRNA
5. PacBio жана Арабидопсис транскриптомунун нанопора негизиндеги РНК тизмегин талдоо жана комплекстүү салыштыруу
Журнал: Өсүмдүк методу
Жарыяланганы: апрель 2020
Keywords: GridION | PromethION | PacBio уландысы | Illumina NovaSeq | Геномду тегиздөө | Транскрипт идентификация | Альтернативалык бириктирүү | ССР | LncRNA | Изоформанын квантификациясы
Жаңылыктар жана кызыктуу окуялар акыркы ийгиликтүү учурларды Biomarker Technologies менен бөлүшүүнү, жаңы илимий жетишкендиктерди, ошондой эле изилдөө учурунда колдонулган көрүнүктүү ыкмаларды тартууну көздөйт.
Посттун убактысы: Январь-08-2022