T2T Геном Ассамблея, Gap акысыз геном
1stЭки күрүч геном1
Аталышы: Xian / Indica Rice үчүн эки бош маалымдама геномдорунун ассамблеясы жана текшерүү центромере архитектурасы
DOI:https://doi.org/0.1101/2020.12.24.424073
Жарыяланган убакыт: 01-январь, 2021-жыл.
Институт: Хуахонг айыл чарба университети, Кытай
Материалдар
O. Sativa Xian / IndicaРайсхан 97 (ZS97) 'жана' Minghui 63 (MH63)
Сезүү стратегия
NGS HIFI окуйт + Клри + Бионано + салам + Хи-С окуйт +
Маалыматтар:
Zs97: 8.34 ГБ (~ 23x) Хифи + 48,39 ГБ (~ 131x) CLR + 25 ГБ (~ 69x) NGS + 2 Бионано Ирис клеткалары
MH63: 37.88 ГБ (~ 103x) Хифи + 48.97 ГБ (~ 132x) CLR + 28 ГБ (~ 76x) NGS + 2 Бионано Ирис клеткалары
1-сүрөт. Райстин (MH63 жана Zs97) 1-сүрөт.
2ndБанан геном2
Title: Теломере-Теломер-Газарассадагы Банананын Хромосомалары
DOI:https://doi.org/0.1101/2021.04.16.440017
Постулду: 17-апрель 2021-жыл.
Институт: Университет Париж-Саклай, Франция
Материалдар
Кош haploidМуса АкуминатаSPPМалакшенсис(Дх-Паханг)
Секенттик стратегия жана маалыматтар:
HISEQ2500 PE150 MODE + Мини / Промит (93гБ, ~ 200x) + оптикалык карта (DLE-1 + BSPQ1)
1-таблица, Муса Акумината (Дх-Паханг) Геном Жыйындарды салыштыруу
2-сүрөт Муса геномдор архитектурасын салыштыруу
3rdPhaeOdactylum Tricornutum enome3
Аталышы: Теломере-telomere геном умтыP
HaeOdEashtylum Tricornutum
DOI:https://doi.org/0.1101/2021.05.04.442596
Жарыяланган убакыт: 04-май, 2021-жыл
Институт: Батыш университети, Канада
Материалдар
PhaeOdactylum Tricornutum(Алгаи жана Протозоа CCAP 1055/1)
Секенттик стратегия жана маалыматтар:
1 оксфорд нанопорь
3-сүрөт telomere-telomere геном жыйынына үч жумуш
4thАдам chm13 геном4
Аталышы: Адам геномунун толук ырааттуулугу
DOI:https://doi.org/0.1101/2021.05.26.445798
Постулду: 27-май, 2021-жыл
Институт: Улуттук саламаттыкты сактоо институттары (NIH), АКШ
Материалдар: CHELL LINE CHM13
Секенттик стратегия жана маалыматтар:
30 × Pacbio Circular Консенсусунун ырааттуулугу (HIFI), 120 × Оксфорд Наноре жана SEQ
2-таблица, Grch38 жана T2T-Chm13 Адам геном жыйындары
Маалымдама
1.Сергей Нурк ж.б. Адамдын геномунун толук ырааттуулугу. Biorxiv 2021.05.26.445798; DOI:https://doi.org/0.1101/2021.05.26.445798
2. Belser et al. Теломере-Теломере Газан Хромосомалары нанопордун ырааттуулугун колдонуп, банандын хромосомалары. biorxiv 2021.04.16.440017; DOI:https://doi.org/0.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Giguere et al. PHaEnactylum Tricornutum теломере-telomere генимдик жыйын. biorxiv 2021.05.04.442596; DOI:https://doi.org/0.1101/2021.05.04.442596
4.jia-ming song et al. Сиан / индика күрүч үчүн эки бош шилтеме геномдорунун жыйын жана текшерүү центромере архитектурасына кирген түшүнүктөрдү ачып берүү. Biorxiv 2020.12.24.424073; DOI:https://doi.org/0.1101/2020.12.24.424073
Пост убактысы: январь-06-2022