Микробдук экология
Айыл чарба интенсификациясы микробдук тармактын татаалдыгын жана тамырлардагы ачкычтын салыгын тамырларга азайтат
Толук узундугу Pacbio Hifi
Урунттуу ойлор
AКароосуздуктун кесепеттерин, анын ичинде азык-түлүк натыйжалуулугун, гезитинин сапатынын начар натыйжалуулугун, топурактын сапатынын деградациясы, анын ичинде зыянды азайтуу үчүн, анын ичинде жок кылынмайынча, органикалык дыйканчылык жана органикалык дыйканчылык Агроекосистеманын өндүрүмдүүлүгүнүн жана туруктуулугунун микробдук коомчулугу төмөн ролду ойнойт. Бирок, башка дыйканчылык тутумдары тамырлуу микробиотага канчалык таасир эткенин түшүнүксүз.
Эксперименталдык дизайн
Эксперименттер
SМунай жана тамыр (ДНК) үлгүлөрү 60 айыл чарба чарбасынан (20 ар бири 20)
GРупинг: 1. Конвенция (айдоо менен); 2. Конвенция (куруу); 3. Органикалык айыл
SЭкспектиз стратегиясы: толук узундуктагы ампликон ырааттуулугу (анын)
PRimers: IN1F-IN4 (бүт аймакты толугу менен бутага алуу ~ 630 BP)
SЭкспербук платформа: Pacbio RS II
Биоинформатикалык анализ
Натыйжалар
On Сайт бир сайтка 357 отос аныкталган жана жалпысынан 837 отду түзөт. Тамыр күмбөз жамааттарынын альфа ар түрдүүлүгү үч дыйканчылык тутумунун ортосунда олуттуу айырмачылыкты көрсөткөн жок. Бирок, БЕБАнын ар түрдүүлүгүнүн анализинде үч айырмаланган үч класс пайда болгон, дыйканчылык тутумунун жамаатынын түзүмүн түп-тамыры менен таасир этүү тутумунун таасири.
1-сүрөт. Альфа ар түрдүүлүгү (Шеннон индекси жана жамааттык курамы) жана Бета Ар түрдүүлүктү анализдөө (негизги координаттарын талдоо)
TEn Keystone Такса үч дыйканчылык тутуму боюнча үч дыйканчылык тутумунун жалпы тармагынын тармагынын негизинде аныкталды: эң жогорку даражадагы эң жогорку 10 түйүндүк жана ортоңку борбордук Алардын жетөө микорррий буйруктарына таандык болчу.
2-сүрөт. Үч чарбалык тутумдун фунглиялык жамааттарга тамырлуу жамааттарга жалпы тармак
FКурал-жартылай тутумдун конкреттүү тармактары органикалык тармакта эки эселенген жана кадимки жана кадимки тармакка караганда эки эселенген түйүндөр менен биригип, бычак менен байланышкан бир кыйла жогору болгон. Андан тышкары, органикалык дыйканчылык тармагы калганга салыштырмалуу көбүрөөк ачкычты (Алмаз) көп колдонулуп, анын татаалдыгын жана байланышын колдогон
3-сүрөт. Дыйканчылык тутуму-конкреттүү тамыр кычыткы тармактары
AАйыл чарба интенсивдүүлүгүнүн ортосунда күчтүү терс ассоциациясы жана тамырдын кычыткы тармагынын туташуусу байкалган. Токойду кокусунан талдоо Кейстонг Такса айдоочуларынын негизги айдоочулары аныкталды: топурак фосфор, жапырт тыгыздык, тин жана mycorrhizal колонизация.
4-сүрөт. Айыл чарба интенсивдүүлүгү жана тармак туташуусу (A жана B) боюнча тармак туташуусу; Токойду талдоо (c) жана айыл чарба интенсивдүүлүгүнүн жана AMF колонизациясынын (D)
Технология
Толук узундуктагы умкон
A"Үчүнчү муундун катышуусу" сахнага келе жаткан "Сахнага келип, ДЭ НОВО жыйындары боюнча максаттуу аймактарда жана көйгөйлөрдүн чектелиши жеңилди. Тынч океан бионтиялыгы (Пасбио) ондуктарды ондогон килобялдарга окууну ийгиликтүү аяктады, ал 16-Rrna (1000 BP-1500 BP) жана 18-RRNA (1,500 BP-20,000 BP) Еукариоттуктагы региондор (400 BP-900 BP). Генетикалык талаанын кеңейиши түрлөрдүн жана функционалдык гендердин чечимин кеңейтет. Базалык тактык боюнча узак маселелерде ПАБIO CCS өзүн-өзү коррекция чечилди, ал HIFIден 99% дан ашуун тактыкты окуган.
OTU аннотациясында аткаруу
TКөптөн бери окуунун жана жогорку өткөрүмдүүлүктүн абагынан арылтуучу артыкчылыктары, аннотациянын тактыгы кескин көбөйүп, микробдук идентификациялоодо "түр деңгээл-деңгээл" токтомуна жетишүүгө болот.
Маалымдама
Банержи, Самиран жана Ал. "Айыл чарбасын активдештирүү микробдук тармактын татаалдыгын жана тамырдын тамырларындагы ачкычтын салыгын азайтат." The Isme Journal (2019).
Тех жана баса белгилөө Ар кандай көтөрүлүп жаткан аренада аренада аренада аренада аренада аркан аренада арканын, ошондой эле тажрыйбалык дизайн жана маалыматтарды казып алууда ар кандай жогорку деңгээлдеги максаттардын ийгиликтүү колдонулушун бөлүштүрүү.
Пост убактысы: январь-0822