mRNA-seq (NGS) – De novo

mRNA секвенциясы белгилүү шарттарда клеткалардагы бардык мРНК транскрипттеринин профилин түзүүгө мүмкүндүк берет жана ар кандай изилдөө аймактарында кеңири колдонулган технология. BMKCloud De novo mRNA-seq конвейери эч кандай шилтеме геному жок болгондо поли-А байытылган секвенирлөө китепканаларын талдоо үчүн иштелип чыккан. Түтүк сапатты көзөмөлдөөдөн башталат, андан кийинde novoстенограмманы чогултуу жана униген топтомун тандоо. Юнигендик структуралык анализ коддоо ырааттуулугун (CDS) жана жөнөкөй ырааттуулуктун кайталанышын (SSR) болжолдойт. Кийинчерээк дифференциалдык экспрессияны талдоо тесттен өткөн шарттардын арасынан дифференциалдуу экспрессияланган гендерди (DEGs) табат, андан кийин биологиялык түшүнүктөрдү алуу үчүн DEG функционалдык аннотациясын жана байытууну камтыйт.