Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Продукциялар

Адамдын бүтүндөй экзомасын ырааттуулугу

Адамдын бүтүндөй экзома секвенциясы (hWES) ооруну пайда кылуучу мутацияларды аныктоо үчүн үнөмдүү жана күчтүү секвенирлөө ыкмасы катары кеңири таанылган. Бүткүл геномдун болжол менен 1,7% гана түзгөнүнө карабастан, экзондор жалпы белок функцияларынын профилин түздөн-түз чагылдыруу менен чечүүчү ролду ойнойт. Белгилей кетчү нерсе, адамдын геномунда, ооруларга байланыштуу мутациялардын 85% дан ашыгы белок коддоо аймактарында көрүнөт. BMKGENE ар кандай изилдөө максаттарына жетүү үчүн жеткиликтүү эки түрдүү экзон басып алуу стратегиялары менен комплекстүү жана ийкемдүү адамдын бүтүндөй экзомасын секвенирлөө кызматын сунуштайт.


Кызматтын чоо-жайы

Демо натыйжалары

Кызмат өзгөчөлүктөрү

● Зонддор менен максаттуу байытуунун негизинде эки экзома панели жеткиликтүү: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) жана xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Illumina NovaSeq боюнча секвенирлөө.

● Оорунун анализине же шишик анализине багытталган биоинформатикалык түтүк.

Кызматтын артыкчылыктары

Протеинди коддоо аймагын максат кылат: Белок коддоо аймактарын басып жана секвенирлөө менен, hWES белоктун түзүлүшү менен байланышкан варианттарды ачуу үчүн колдонулат.

Эффективдүү чыгымдар:hWES адам геномунун 1% адам оорусу менен байланышкан мутациялардын болжол менен 85% берет.

Жогорку тактык: Жогорку секвенирлөө тереңдиги менен hWES жалпы варианттарды да, жыштыгы 1% дан төмөн болгон сейрек варианттарды да табууга көмөктөшөт.

Катуу сапатты көзөмөлдөө: Биз үлгүлөрдү жана китепкананы даярдоодон секвенирлөө жана биоинформатикага чейинки бардык этаптарда беш негизги контролдук пункттарды ишке ашырабыз. Бул кылдат мониторинг ырааттуу жогорку сапаттагы натыйжаларды берүүнү камсыз кылат.

Комплекстүү биоинформатика анализи: биздин түтүк референт геномунун вариацияларын аныктоо менен чектелбейт, анткени ал оорулардын генетикалык аспектилерине же шишик анализине байланыштуу изилдөө суроолорун чечүү үчүн иштелип чыккан өркүндөтүлгөн анализди камтыйт.

Сатуудан кийинки колдоо:Биздин милдеттенмебиз 3 айлык сатуудан кийинки тейлөө мөөнөтү менен долбоордун аяктоосунан ашат. Бул убакыттын ичинде биз натыйжаларга байланыштуу суроолорду чечүү үчүн долбоордун артынан, көйгөйлөрдү аныктоо боюнча жардамды жана суроо-жооп сессияларын сунуштайбыз.

Үлгү спецификациялары

Exon Capture Strategy

Секвенирлөө стратегиясы

Сунушталган маалымат чыгаруу

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

же xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5 -10 Гб

Менделиялык оорулар/сейрек кездешүүчү оорулар үчүн: > 50x

шишик үлгүлөрү үчүн: ≥ 100x

Үлгү талаптары

Үлгү түрү

 

 Суммасы(Qubit®)

 

Концентрация 

Көлөм

 

 

 Тазалык(NanoDrop™)

 

Геномдук ДНК

 

≥ 50 нг
≥ 6 нг/мкл
≥ 15 мкл
 
OD260/280=1,8-2,0
 
деградация, булгануу жок

 

Биоинформатика

WES_BI иш агымы_Disease-01

hWES-оорунун үлгүлөрүн биоинформатикалык талдоо төмөнкүлөрдү камтыйт:

● Берилиштерди иреттөө QC

● Геномду тегиздөө

● SNP жана InDels идентификациясы

● SNP жана InDels функционалдык аннотациясы

WES_BI иш агымы_Tumor-01

Шишик үлгүлөрүнүн биоинформатикалык анализи төмөнкүлөрдү камтыйт:

● Берилиштерди иреттөө QC

● Геномду тегиздөө

● SNPs, InDels жана соматикалык вариацияларды аныктоо

● урук линиясынын варианттарын аныктоо

● Мутация колтамгаларын талдоо

● Функцияга ээ болгон мутациялардын негизинде жетектөөчү гендерди идентификациялоо

● Дарыга сезгичтик деңгээлиндеги мутация аннотациясы

● Гетерогендүүлүк анализи – тазалыкты жана плоиддүүлүктү эсептөө

Кызматтын иш агымы

үлгү жеткирүү

Үлгү жеткирүү

Пилоттук эксперимент

ДНК экстракциясы

Китепкана даярдоо

Китепкананын курулушу

Секвенциялоо

Секвенциялоо

Маалыматтарды талдоо

Маалыматтарды талдоо

数据上传-01

Маалымат жеткирүү

Сатуудан кийинки кызматтар

Сатуудан кийинки кызматтар


  • Мурунку:
  • Кийинки:

  • Маалымат QC - Exome басып алуу статистикасы

     

    wps_doc_22

     

    Варианттын идентификациясы – InDels

    图片36

    Өркүндөтүлгөн анализ: зыяндуу SNP/InDels аныктоо жана бөлүштүрүү - Circos сюжет

     

    图片37

    Шишик анализи: соматикалык мутацияларды аныктоо жана бөлүштүрүү - Circos сюжети

     

    图片38

     

    Шишик анализи: клондук тукумдар

     

    图片39

     

    цитата алуу

    Бул жерге билдирүүңүздү жазып, бизге жөнөтүңүз

    Бизге билдирүүңүздү жөнөтүңүз: