Де Ново Фунгал Геном
БМКЖЕНИ Фунталдык геномдор үчүн ар тараптуу геномдор үчүн ар тараптуу чечимдерди сунуштайт, ар түрдүү изилдөө муктаждыктарын жана каалаган геномдун толуктугун сунуштайт. Кыскача окулган иллюминаны колдонуу менен гана, бир гана геномдун муунына мүмкүнчүлүк берет. Нанипоре же пасбио колдонуу менен кыскача окуган жана узак окулган ырааттуулук. Мындан тышкары, HI-C SEQUCENCE интеграциялоо мүмкүнчүлүктөрүн аргасыз кылат, толук хромосома-деңгээлдеги геномдун жетишкендигине мүмкүнчүлүк берет.
Кызмат өзгөчөлүктөрү
Каалаган геномдун толук деңгээлине жараша тандоо үчүн үч мүмкүн болгон вариант менен:
● Генуянын долбоору: Lilumina Novaseq PE150 менен кыскача окуңуз.
● Фуналдык сонун геном опциясы:
Genome Surcies: Иллюмина Новасык П1150.
Геномдун Ассамблеясы: Pacbio Revio (HIFI окуйт) же нанопордун прометиалы 48.
● Хромосома-денгээлдеги гено:
Genome Surcies: Иллюмина Новасык П1150.
Геномдун Ассамблеясы: Pacbio Revio (HIFI окуйт) же нанопордун прометиалы 48.
Contig Hi-C жыйындысы менен белгилөө.
Кызматтын артыкчылыктары
●Бир нече жолу ырааттуулук стратегиялары: Ар кандай изилдөө максаттары жана геномдун толуктугунун талаптары үчүн
●Толук биоинформатикаБуга геномдук жыйын жана бир нече жандуу элементтерди, функционалдык гендин аннотациясын жана коннотациясын камтыйт.
●Кеңири экспертиза: 12,000ден ашык микробдук геном менен чогулганбыз, биз он жылдык тажрыйбаны, жогорку квалификациялуу талдоо командасын, ар тараптуу мазмунун жана сатуудан мыкты колдоого алып келебиз.
●Сатуудан кийинки колдоо:Биздин милдеттенме долбооруңуздун аяктагандан кийин, сатуу кызматынын мөөнөтү 3 айлык кызматы менен аяктайт. Ушул убакыт аралыгында биз долбоорду чечүү үчүн, көйгөйлөрдү чечүү үчүн, көйгөйлөрдү чечүү үчүн жана сессияларын жана жыйынтыктарын чечүү үчүн сессияларды сунуштайбыз.
Кызмат мүнөздөмөлөрү
| Кызмат | Сезүү стратегия | Сапатты көзөмөлдөө |
| Геноманын долбоору | Иллюмина PE150 100x | Q30≥85% |
| Сонун геном | Genome Surcies: Иллюмина PE150 50 x Ассамблея: Pacbio HIFI 30x же nanoropore 100x | contig n50 ≥1MB (Pacbio бирикалык эмес) contig n50 ≥2MB (ЮНИСЕЛЕР) contig n50 ≥500kb (башкалар) |
| Хромосома-денгээлдеги геном | Genome Surcies: Иллюмина PE150 50 x Ассамблея: Pacbio HIFI 30x же nanoropore 100x Hi-C Ассамблея 100x | Конгигринг катышы> 90%
|
Кызмат талаптагыдай
| Концентрация (ng / μl) | Жалпы суммасы (GG) | Көлөмү (μl) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.6 |
| Nanoropore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Иллюмина | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
Юникеллулярдык кычыткы: ≥3.5x1010 клеткалар
Macro Fungus: ≥10 g
Кызматтын агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкана курулушу
Sequencing
Маалыматтарды талдоо
Сатуу кызматтары
Төмөнкү анализди камтыйт:
Геном сурамжылоо:
- Маалыматтын сапатын контролдоо
- Генома Беттешүү: Көлөм, гетерозотиялуулук, кайталануучу элементтер
Жакшы геном жыйын:
- Маалыматтын сапатын контролдоо
- Де НовоАссамблея
- Геномдун компонентин талдоо: CD дисктерин жана бир нече жандыомикалык элементтерди болжолдоо
- Бир нече жалпы маалымат базалары (барыңыз, кегг ж.б.) жана өркүндөтүлгөн маалымат базалары (картасы, vfdb ж.б.)
Hi-C Ассамблеясы:
- Hi-c китепкана баалоо.
- Колготкичтер жана багыт алуу жана багыт алуу
- HI-C Ассамблеясынын баалоосу: шилтеме геному жана жылуулук картасынын негизинде
Геном сурамжылоо: K-Mer бөлүштүрүү
Геном Ассамблеясы: GENE HEMOLOST аннотациясы (NR маалыматтар базасы)
Геном Ассамблеясы: Функционалдык гендин аннотациясы (GO)
БМКЖИНИНИН ГЕНОЗИМДИК КЫЗМАТТАРЫНЫН ПАЙДАЛАНУУЧУЛАРЫНЫН ПАЙДАЛАНУУЧУЛАРЫ аркылуу БЖКИНИН ГЕНОЗИМДИК КЫЗМАТТАРЫНЫН ИНСПОРТУНДУ ИЗИЛДӨӨ.
Хао, Дж. Et al. (2023) "Дары-дармек козу карын мусаусун инонотусунун инонотусунун инонотусунун инонотуска каршы шарттуу шарттарда"BMC Genomics, 24 (1), 1-12-бб. DOI: 10.1186 / S12864-023-09656-Z / цифралар / 3.
Л., Л. (2023) 'Генома ырааттуулугу буудайдын кескин көздөрү козгогон дуушар болгон буудайдын кесилген механизмдерин ачып берет,Crop Journal, 11 (2), 405-416-бб. DOI: 10.1016 / J.CJ.2022.07.024.
Чжан, Х. жана Ал. (2023) "Төрт талриередия түрлөрү үчүн геномдук ресурстар, ар түрдүү чарбаларда доллар жайга алып келет",Өсүмдүк оорусу, 107 (3), 929-934-бб. DOI: 10.1094 / PDI-08-22-1921-A
Чжан, СС жана Ал. (2023) "Козу карындын гриболо фрондусундагы тетраполярдык матч тутумунун генетикалык жана молекулярдык далили",Фунги журналы, 9 (10), б. 959. DOI: 10.3390 / Jof9100959 / S1.
