DNBSEQ алдын ала жасалган китепканалар
Өзгөчөлүктөрү
●Платформа:MGI-DNBSEQ-T7
●Режимдер:PE150
●Illumina китепканаларын которууMGI:төмөн баада жогорку маалымат көлөмүн ырааттуулугун камсыз кылуу.
●секвенирлөө алдында китепканалардын сапатын контролдоо.
●Берилиштерди иреттөө QC жана жеткирүү:Q30 окуусун демультиплекстөө жана чыпкалоодон кийин QC отчетун жана чийки маалыматтарды fastq форматында жеткирүү.
Артыкчылыктары
●Секвенирование кызматтарынын ар тараптуулугу:кардар тилке же маалымат көлөмү боюнча ырааттуулукту тандай алат.
●Жогорку маалымат чыгаруу:1500 Гб/жол
●QC отчетун ырааттуулук менен жеткирүү:сапат көрсөткүчтөрү, маалыматтардын тактыгы жана секвенирлөө долбоорунун жалпы көрсөткүчтөрү менен.
●Жетилген секвенирлөө процесси:кыска айлануу убактысы менен.
●Катуу сапатты көзөмөлдөө: Биз ырааттуу жогорку сапаттагы натыйжаларды жеткирүүгө кепилдик берүү үчүн катуу QC талаптарын ишке ашырабыз.
Үлгү талаптары
| Дайындардын суммасы (X) | Концентрация (qPCR/nM) | Көлөм | |
| Жарым-жартылай тилке
| X ≤ 10 Гб | ≥ 1nM | ≥ 25 мкл |
| 10 Гб < X ≤ 50 Гб | ≥ 2 nM | ≥ 25 мкл | |
| 50 Гб < X ≤ 100 Гб | ≥ 3 nM | ≥ 25 мкл | |
| X > 100 Гб | ≥ 4 nM | ||
| Sing Lane | Per Lane | ≥ 1,5 нМ / Китепкана бассейни | ≥ 25 мкл / Китепкана бассейни |
Концентрациядан жана жалпы суммадан тышкары, ылайыктуу чоку үлгүсү да талап кылынат.
Эскертүү: Ар түрдүүлүк аз китепканалардын тилкелүү ырааттуулугу базалык чалууларды камсыз кылуу үчүн PhiX спикеин талап кылат.
Алдын ала топтолгон китепканаларды үлгү катары тапшырууну сунуштайбыз. Эгер сиз BMKGENEге китепкананын топтомун жүргүзүүсүн талап кылсаңыз, сураныч, караңыз
жарым-жартылай тилкелер үчүн китепкана талаптары.
Китепкананын өлчөмү (карта чокусу)
Негизги чокусу 300-450 bp чегинде болушу керек.
Китепканалар бир негизги чокусу, адаптер булганышы жана эч кандай праймер димерлери болушу керек.
Кызматтын иш процесси
Китепкананын QC отчету
Китепкананын сапаты жөнүндө отчет ырааттуулук, китепкананын көлөмүн баалоо жана фрагментациядан мурун берилет.
QC отчетун иреттөө
Таблица 1. Маалыматтарды секвенирлөө боюнча статистика.
| Үлгү ID | BMKID | Чийки окуйт | Чийки дайындар (bp) | Таза окуулар (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Сүрөт 1. Ар бир үлгүдөгү окуулар боюнча сапаттын бөлүштүрүлүшү
2-сүрөт. Негизги мазмундун бөлүштүрүлүшү
3-сүрөт. Окулган мазмундун секвенирлөө маалыматтарында бөлүштүрүлүшү
