Illumina алдын ала жасалган китепканалар
Өзгөчөлүктөрү
●Платформалар:Illumina NovaSeq 6000 жана NovaSeq X Plus
●Режимдер:PE150 жана PE250
●секвенирлөө алдында китепканалардын сапатын контролдоо
●Берилиштерди иреттөө QC жана жеткирүү:QC отчетун жана чийки маалыматтарды fastq форматында жеткирүү Q30 окууларын демультиплекстөө жана чыпкалоодон кийин
Кызматтын артыкчылыктары
●Секвенирование кызматтарынын ар тараптуулугу:кардар тилке, агым уячасы же талап кылынган маалыматтардын саны боюнча ырааттуулукту тандай алат (жарым-жартылай тилке ырааттуулугу).
●Illumina секвенирлөө платформасында чоң тажрыйба:ар кандай түрлөрү менен жабык долбоорлор ми менен.
●QC отчетун ырааттуулук менен жеткирүү:сапат көрсөткүчтөрү, маалыматтардын тактыгы жана секвенирлөө долбоорунун жалпы көрсөткүчтөрү менен.
●Жетилген секвенирлөө процесси:кыска айлануу убактысы менен.
●Катуу сапатты көзөмөлдөө: Биз ырааттуу жогорку сапаттагы натыйжаларды жеткирүүгө кепилдик берүү үчүн катуу QC талаптарын ишке ашырабыз.
Үлгү платформалары
| Платформа | Агым клеткасы | Секвенирлөө режими | бирдиги | Болжолдуу өндүрүш |
| NovaSeq X | 10B (8 тилкелүү) | PE150 | Sing Lane Жарым-жартылай тилке | 375 Гб / Lane |
| 25B (8 тилкелүү) | PE150 | Sing Lane Жарым-жартылай тилке | 1000 Гб/жол | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow клеткасы (2 тилкелүү) | PE250 | Агым клеткасы Sing Lane Жарым-жартылай тилке | 325-400 M окуу / Lane |
| S4 Flow уячасы (4 тилкелүү) | PE150 | Агым клеткасы Sing Lane Жарым-жартылай тилке | ~800 Гб / Lane |
Үлгү талаптары
| Дайындардын суммасы (X) | Концентрация (qPCR/nM) | Көлөм | |
| Жарым-жартылай тилкенин ырааттуулугу
| X ≤ 10 Гб | ≥ 1 nM | ≥ 25 мкл |
| 10 Гб < X ≤ 50 Гб | ≥ 2 nM | ≥ 25 мкл | |
| 50 Гб < X ≤ 100 Гб | ≥ 3 nM | ≥ 25 мкл | |
| X > 100 Гб | ≥ 4 nM | ≥ 25 мкл | |
| Lane Sequencing | Per Lane | ≥ 1,5 нМ / Китепкана бассейни | ≥ 25 мкл / Китепкана бассейни |
Концентрациядан жана жалпы суммадан тышкары, ылайыктуу чоку үлгүсү да талап кылынат.
Эскертүү: Ар түрдүүлүк аз китепканалардын тилкелүү ырааттуулугу базалык чалууларды камсыз кылуу үчүн PhiX спикеин талап кылат.
Алдын ала топтолгон китепканаларды үлгү катары тапшырууну сунуштайбыз. Эгерде сиз BMKGENEге китепкананы бириктирүүнү ишке ашырууну талап кылсаңыз, анда караңыз
жарым-жартылай тилкелер үчүн китепкана талаптары.
Китепкананын өлчөмү (карта чокусу)
Негизги чокусу 300-450 bp чегинде болушу керек.
Китепканалар бир негизги чокусу, адаптер булганышы жана эч кандай праймер димерлери болушу керек.
Сураныч, үлгүлөрүңүз баштапкы материалдын талаптарына жооп бербесе, бизге кайрылыңыз.
Кызматтын иш процесси
Китепкананын сапатын көзөмөлдөө
Секвенциялоо
Маалыматтын сапатын көзөмөлдөө
Долбоорду жеткирүү
Китепкананын QC отчету
Китепкананын сапаты жөнүндө отчет ырааттуулук, китепкананын көлөмүн баалоо жана фрагментациядан мурун берилет.
QC отчетун иреттөө
Таблица 1. Маалыматтарды секвенирлөө боюнча статистика.
| Үлгү ID | BMKID | Чийки окуйт | Чийки дайындар (bp) | Таза окуулар (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Сүрөт 1. Ар бир үлгүдөгү окуулар боюнча сапаттын бөлүштүрүлүшү
2-сүрөт. Негизги мазмундун бөлүштүрүлүшү
3-сүрөт. Окулган мазмундун секвенирлөө маалыматтарында бөлүштүрүлүшү
