Толук узундуктагы мырза
Өзгөчөлүктөр
● Поли-бир МРННАдан кийин CDNA синтези, андан кийин китепкана даярдоо
Hif CCS режиминде SCS режиминде отурукташуу, HIFI окуйт
● толук узундуктагы транскрипттерди ыраатташтыруу
● Талдоо шилтеме геномун талап кылбайт; Бирок, ал жумушка орношсо болот
● Биоинформатикалык анализ ЛнКрна, Гин-Фузни, Поли-Адения жана Генди-Адения жана Гендин структурасы
Кызматтын артыкчылыктары
●Жогорку тактык: HIFI Тактык менен, 99,9% (q30) NGSке салыштырмалуу окуйт
● Альтернативдүү анализ: Бардык транскрипттердин ырааттуулугу ISOFORFORM'ти идентификациялоого жана мүнөздөмөсүнө мүмкүнчүлүк берет
●Кеңири экспертиза: 1100дөн ашкан 1100дөн ашуун пакетин аяктаган транскриптомлорду толтуруу жана 2300 үлгүлөрүн иштеп чыгуу менен, биздин команда ар бир долбоорго бай тажрыйбаны алып келет.
●Сатуудан кийинки колдоо: Биздин милдеттенме сатуу кызматынын 3 айдан кийин долбоордун аяктагандан тышкары, биздин милдеттенме узартылат. Ушул убакыт аралыгында биз долбоорду чечүү үчүн, көйгөйлөрдү чечүү үчүн, көйгөйлөрдү чечүү үчүн жана сессияларын жана жыйынтыктарын чечүү үчүн сессияларды сунуштайбыз.
Үлгү талаптары жана жеткирүү
| Китепкана | Сезүү стратегия | Берилген маалыматтар | Сапатты көзөмөлдөө |
| Поля MRNA CCS китепканасын байыткан | Pacbio Sequel II Pacbio Revio | 20/40 ГБ 5/10 м CCS | Q30≥85% |
Үлгү талаптары:
Нуклеотиддер:
● Өсүмдүктөр:
Тамыр, сабак же петрал: 450 мг
Жалбырак же урук: 300 мг
Мөмө-жемиш: 1.2 g
● Animal:
Жүрөк же ичеги: 300 мг
Viscera же мээ: 240 мг
Булчуң: 450 мг
Сөөктөр, чач же тери: 1g
● Артроподдор:
Курт-кумурскалар: 6г
Crustacea: 300 мг
● Бүт кан: 1 Tube
● Клеткалар: 106 клеткалар
| Col. (Ng / μl) | Суммасы (ъг) | Тазалык | Бүтүндүгү |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Чектелген же гельде көрсөтүлгөн белок же DNA булганышы жок. | Өсүмдүктөр үчүн: rin≥7.5; Жаныбарлар үчүн: rin≥8.0; 5.0 28s / 18s≥1.0; чектелген же баштапкы бийиктик жок |
Сунушталган үлгү жеткирүү
Контейнер: 2 мл центрифуга түтүк (калай фольга сунушталбайт)
Таанышуу этикетинин үлгүлүү энбелги: Топ + репликация, мисалы, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Жөнөтүү:
1. Кургак муз: үлгүлөр сумкаларга салынып, кургак-музга көмүлүшү керек.
2. Ранастикалык түтүктөр: РНК үлгүлөрү РНКнын стабилдештирүү түтүгүндө кургатылышы мүмкүн (мисалы, рантабелдик) жана бөлмө температурасына жөнөтүлөт.
Кызматтын агымы
Эксперимент дизайны
Үлгү жеткирүү
RNA казып алуу
Китепкана курулушу
Sequencing
Маалыматтарды талдоо
Сатуу кызматтары
Төмөнкү анализди камтыйт:
● Маалыматтын сапатын контролдоо
● Альтернативдүү полиинеляция анализи (апа)
● Fusion стенограмманы талдоо
● Альтернативдүү анализ
● Универсалдуу бир нуска Orthologs (Busco) анализдөө
● Роман транскрипциясын анализдөө: коддоо ырааттуулугун болжолдоо (CDS) жана функционалдык аннотация
● LNCRNA анализи: lncrna жана максаттарга божомолдоо
● Микросателит идентификациясы (SSR)
Busco Analy
Альтернативдүү анализ
Альтернативдүү полииниляция анализи (апа)
Роман транскрипттердин функционалдык аннотациясы
БМКЖЕНДИН ЖАҢЫ УЗАКТУУ МРНА мырза мрам-мезгилди көздөгөн аймактар менен тааныштырылган ийгиликтерди изилдөө.
Ма, Ю. (2023) "Пасбионун жана РНКнын" Немурай уусу үчүн "Пасифо жана РНКнын чогултуу ыкмаларын салыштырмалуу талдоо", геномика, 115 (6), б. 110709. DOI: 10.1016 / J.YGENO.2023.110709.
Чао, Q. et al. (2019) "Популус транскриптомунун өнүгүү динамикасы, өсүмдүктүн биотехнология журналы, 17 (1), 206-219-бб. DOI: 10.1111 / PBI.12958.
Дэн, Х. жана Ал. (2022) "Мөмө-жемиш өнүгүүсү жана молекционалдык мелдештин (аскердик-бай жемиш өсүмдүктөрү) жана байланышкан молекулалык механизмдер" 5808. DOI: 10.3390 / IJMS23105808 / S1.
Хуа, X. ж.б. (2022) "Парифилилла шаарындагы биоактивдик жолдоштуктарды эффективдүү божомолдоо", байланыш биологиясы. 2022 5: 1, 5 (1), 1-10. DOI: 10.1038 / S42003-022-03000-Z.
Лю, М. жана Ал. (2023) "Паслум П450" ПРОГРАММАСЫ "ПРОГРАММЕЛЬ (МЕЙРИК) (Мейирик) (Мейирик) Тапшырма Анализдөө, Китехром, 14-курт-кумурскалар, 14 (4), б. 363. DOI: 10.3390 / Курт-кумурскалар14040363 / S1.
Wang, Lijun et al. (2019) "Пасбата" Транскомдун татаалдыгын сурамжылоо DOI: 10.1186 / S12864-019-5832-9.
