Салыштырма геномика
Кызматтын артыкчылыктары
●Кеңири экспертиза жана жарыялоо: Топтолгон, БМКЖЕНИ БКЖЖЕНИ ТҮШҮНҮШҮНҮН КООПТОРУ 900дөн 90 жаштан ашып түштү.
●Биоинформатика талдоо: Талдоос пакетинде эң көп талап кылынган сегиз талап кылынган сегиз анализди камтыйт, натыйжаларды оңой чечмелөөгө мүмкүнчүлүк берет
●Жогорку квалификациялуу биоинформатика командасы жана кыска анализ циклиТөмөнкү тажрыйба менен бул тажрыйбалуу тажрыйба менен BMKGENEдин командасы ар кандай жекелештирилген анализдин талаптарын кыскача айлантуу боюнча талаптарды аткарат
●Сатуудан кийинки колдоо:Биздин милдеттенме долбооруңуздун аяктагандан кийин, сатуу кызматынын мөөнөтү 3 айлык кызматы менен аяктайт. Ушул убакыт аралыгында биз долбоорду чечүү үчүн, көйгөйлөрдү чечүү үчүн, көйгөйлөрдү чечүү үчүн жана сессияларын жана жыйынтыктарын чечүү үчүн сессияларды сунуштайбыз.
Кызмат мүнөздөмөлөрү
| Болжолдуу кезек | Түрлөрдүн саны | Анализ |
| 30 жумушчу күн | 6 - 12 | Джин үй-бүлөлүк кластердик Джин үй-бүлөлүк кеңейүү жана кысылуу Филогенетикалык дарактын курулушу Divergence Time эсептөөсү (Фоссил калибрлөө талап кылынат) Ltr inted time (өсүмдүктөр үчүн) Бүт геномдун кайталанышы (өсүмдүктөр үчүн) Тандалма басым Синтини анализи |
Биоинформатика анализдөө
● ген үй-бүлөсү
● Фимогенетика
● Divergence Time
● Selecive басымы
● Синти
Үлгү талаптары жана жеткирүү
Үлгү талаптары:
Геномумду ырааттуу жана чогулуштар үчүн ткань же ДНК
Кыртыш үчүн
| Түр | Ткань | Сурамжылоо | Pacbio CCS |
| Жаныбар | Висцералдык ткандар | 0.5 ~ 1 г | ≥ 3.5 г |
| Булчуң ткандары | |||
| ≥ 5,0 г | |||
| ≥ 5,0 мл | |||
| Маммалиан каны | |||
| ≥ 0.5 мл | |||
| Канаттуулар / балык кан | |||
| Өсүмдүк | Жаңы жалбырак | 1 ~ 2 г | ≥ 5,0 г |
| Петр / Суб | 1 ~ 2 г | ≥ 10,0 г | |
| Тамыр / тукум | 1 ~ 2 г | ≥ 20,0 г | |
| Клеткалар | Маданият клеткасы | - | ≥ 1 x 108 |
Маалыматтар
Геномендик ырааттуулук файлдары (по маршруту
Кызматтын агымы
Эксперимент дизайны
Үлгү жеткирүү
Китепкана курулушу
Sequencing
Маалыматтарды талдоо
Сатуу кызматтары
*Демо натыйжалары Бул жерде Биомаркерлер Технологиясы менен жарыяланган геномдордун бардыгы
1.LTR Time эсептөөнү киргизүү: Бул көрсөткүч башка түрлөргө салыштырмалуу Пааляга салыштырмалуу With-RTSке чейин уникалдуу бимодалдык бөлүштүрүү, кара буудай геномундагы кыстаруу убактысында, кара буудай геномду кыстаруу мезгилинде буудай геномуна салынган. Эң акыркы чокусу 0,5 миллион жыл мурун пайда болгон.
Li Guang Et al.,Жаратылыш генетикасы, 2021
Чаптамдык (сехиялык эдюла) гендерлуулук анализи (сехиялык эдуюлдук): гендердеги 13 тектүү 13 тектүү 13 тыкан түрлөрүн талдоо менен, жылан дарбазасы менен тыгыз байланышкан (трахоцантес атунина) менен тыгыз байланышкан. Cukoibitacee'деги 25 ± 4 MYAGE CHAYOTH CAYOTH CHAYOTH CAYOTE CHAYOTHET CHAYAYTOR-ЖАШТАРГА КОРКУНУЧТУУЛУКТАН ЧЫГАРЫЛДЫ.
Fu a et al.,Horticulture Research, 2021
3.Синдини анализ: Питормондорго Фитормондорго байланышкан кээ бир гендер табылган, жылан, жылан дарбазасында жана кабачок табылган. Таяктап менен сквош ортосундагы байланыш багып, жылан дарбазасынын ортосундагы бир аз жогору.
Fu a et al.,Horticulture Research, 2021
4.Ген үй-бүлөлүк анализ: Г.Турбейри жана Г.Двидсониу жана Г.Давидсонидагы кеңейүү жана жыйрылуу Г.Турбэд Г.Домидалар геномдорун жана Brassinosteroid биосинтезге тиешелүү гендер кеңейди.
Ян et et al.,BMC биологиясы, 2021
5.Whole Genome кайталоонун анализи: 4dtv жана KS бөлүштүрүү анализи бир геномдун кайталануучу окуя болду. Ийгиликтин чокулары кайталанма окуялар көрсөтүлгөн. Ийнемелердин чокулары спецификациялары көрсөтүлгөн. Анализдин айтымында, тыгыз байланышкан башка үч түргө салыштырмалуу, o.opaea акыркы масштабдуу гендин көчүрмөсүн баштан кечирди.
Рао G ж.б.Horticulture Research, 2021
BMK Case
Роза приклесиз: нымдуулукту адаптациялоо менен байланышкан геномикалык түшүнүктөр
Жарыяланган: Улуттук илим, 2021
Секенттик стратегия:
'BasyeТор'(Р.Wichurainan) Genome:
Болжол менен. 93 x pacbio + Болжол менен. 90 x nanopore + 267 x Ильюмина
Негизги жыйынтыктар
1.High Quality R.Wichuraiana геному 530,07 МБ жыйынга жетип, геномдун болжол менен 525,9 МБ түзүлгөн, геном сурамжылоо боюнча болжол менен 525,9 МБ; Гетерозоготика 1,03% түзгөн. Busco эсептелген упай 93,9% түзгөн. "Эски кызгылт" (Haploub) менен салыштырганда, бул геномдун сапаты жана толуктугу бир базалык тактык жана LTR emply индекси (LAI = 20.03) тарабынан тастыкталды. R.Wichuraiana Genome 32,674 Протеин коддоо гендери бар.
2.Мули-Омликтердик талдоо, тегиздөө, транскриптомторлордун, генетикалык калкты QTL талдоо, Р. Вичуриана менен Розанын Роза Чининсисинин ортосундагы чечүүчү мүнөздөмөлөрдү аныктады. Ошондой эле, QTLдеги тиешелүү гендердин өзгөрүлүшү, сыягы, катуу приклдүү оймо-чийме менен байланышкан болушу мүмкүн.
Салыштырма Геномика Анайсис NAC жана FAR1 / FAR1 / FAR1 / FRS гендин үй-бүлөсүндөгү уникалдуу кеңейиши кара жерге каршылык көрсөтүү менен байланышкан болушу мүмкүн.
BT жана Haploob геномдорунун ортосундагы салыштырма геномикалык анализ.
Zhong, М., М., М. "Питрсуз роза: нымдуулукка ылайыкташтырылган геномдук түшүнүктөр"Улуттук илим, 2021 ;, nwab092.
