16s / 18s / asmmlicon Sequencing-pacbio
Кызмат өзгөчөлүктөрү
Section Squencing Platform: Pacbio Revio
● Секент режими: CCS (HIFI окуйт)
● Максаттуу аймакты күчөтүү HIFI SMRT Bell китепкананын даярдагандыгы
Кызматтын артыкчылыктары
●Жогорудагы таксономиялык токтом: tHAN кыска ампликон ырааттуулугу,Түрлөр деңгээлинде OTU классификациясынын жогорку деңгээлин иштетүү.
●Жогорку базалык чалуу: Pacbio CCS режими SEQUENCH (HIFI окулат).
●Изоляциясыз: Айлана-чөйрөнүн үлгүлөрүндө микробдук курамын тез аныктоо.
●Кеңири колдонулат: Ар түрдүү микробдук коомчулук таануу.
●Биоинформатикалык анализ: Акыркы Qiime2 топтому (микробдук экологияны сандык түшүнүк), аннотация, OTU / ASV шарттарында ар тараптуу анализдер менен ар тараптуу анализдер менен.
●Кеңири экспертизаЖыл сайын миңдеген ампликон менен жүргүзүлгөн миңдеген жетишкендиктер менен, Бменжен он жылдык тажрыйбаны, жогорку квалификациялуу талдоо командасын, ар тараптуу мазмунун жана сатуудан мыкты колдоо көрсөтөт.
Кызмат мүнөздөмөлөрү
| Китепкана | Сезүү стратегия | Берилген маалыматтар |
| Amplicon | Pacbio Revio | 10/30/50 K Тегдер (CCS) |
Үлгү талаптары
| Концентрация (ng / μl) | Жалпы суммасы (GG) | Көлөмү (μl) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
Сунушталган үлгү жеткирүү
Үлгүлөрдү суюк азотко 3-4 саатка тоңдуруп, 3-4 саатка чейин, суюктук азото же -80 даражасын узак мөөнөткө чейин сактаңыз. Кургак муз менен жеткирүү талап кылынат.
Кызматтын агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкана курулушу
Sequencing
Маалыматтарды талдоо
Сатуу кызматтары
Төмөнкү анализди камтыйт:
● Маалыматтын сапатын контролдоо
● Otu Clustering / de-ызы-чуу (ASV)
● Оту аннотациясы
● Альфа түрүн анализ: Шеннон, Симпсон жана Ace, анын ичинде бир нече индекстер, анын ичинде бир нече индекстер.
● BETAнын ар түрдүүлүгүн анализдөө
● Топтардык талдоо
● Корреляциялык анализ: Экологиялык факторлордун ортосунда жана курамы жана ар түрдүүлүгү ортосунда
● 16s Функционалдык ген
Таксономикалык бөлүштүрүүнүн гистограммасы
Коомдук бөлүштүрүү филогенетикалык дарак
Альфа түрүн анализ: ace
индекс
BETAнын ар түрдүүлүгүн анализдөө: pcoa
Интергропинг анализи: ANOVA
БМКЖИНИН ӨТКӨРҮШҮ БКМБЛИКОНУН ПАВБИО менен Пасбио менен коштолот
Гао, X. жана Ванг, Х. 1), б. 16. DOI: 10.3390 / fermentation9010016 / s1.
Li, S. et al. (2023) «Чөлдөгү чөлдөгү микробдорду чөлдөгү караңгы заттарды), чөлдөгү микробдорду тартуу", NPJ Biofilmilms жана Microbilms жана Microbilms 2023 9: 1, 9 (1), 1-14-бб. Дой: 10.1038 / S41522-023-00439-8.
Му, Л. жана Ал. (2022) "Майлуу кислотанын туздарынын ачыктыгы мүнөздөмөлөрүнө, бактериялык ар түрдүүлүктүн жана аэробдук силозду жана аэробдук стабилдүүлүктүн деңгээли, бактерия, күрүч саман жана буудай кебинин" 1487-ж. Дой: 10.1002 / JSFA.11482.
Ян, Дж. Et al. (2023). Оказолон-нефталдык окуучулук окурман зебрафишинде, антиоксиданттар 2023, том. 12, 192, 12 (1), б. 192. DOI: 10.3390 / Антиокс12010192.
