16s / 18s / анын ofmlicon Sequencing-NGS
Кызмат өзгөчөлүктөрү
● Секент платформасы: Иллюмина Новас.
● 16 жашка чейинки кыска аймактардын, 18 жаштан 18 жашка чейинки, ал эми анын, башка амплификациялык максаттардын арасында.
● Амфликондун ийкемдүүлүгү.
● Бир нече амплификациялык максаттар менен мурунку долбоордун тажрыйбасы.
Кызматтын артыкчылыктары
●Операция акысыз:Айлана-чөйрөнүн үлгүлөрүндө микробдук курамды тез аныктоо.
●Жогорку чечимКурчап турган чөйрөнүн үлгүлөрүндөгү аз компоненттерден.
●Кеңири колдонулат: Ар түрдүү микробдук коомчулук таануу.
●Биоинформатикалык анализ: Акыркы Qiime2 топтому (микробдук экологияны сандык түшүнүк), аннотация, OTU / ASV шарттарында ар тараптуу анализдер менен ар тараптуу анализдер менен.
●Кеңири экспертизаЗакурдалган 150 миң ампликон менен жүргүзүлүп жаткан 150 миң ампликон менен жүргүзүлүп, Бменжен он жылдык тажрыйбаны, жогорку квалификациялуу талдоо командасын, ар тараптуу мазмунун жана сатуудан кийинки ар тараптуу колдоо көрсөтөт.
Кызмат мүнөздөмөлөрү
| Китепкана | Сезүү стратегия | Берилген маалыматтар |
| Amplicon | Illumina pe250 | 50/100 / 300K Тегдер (Окуяны окуу) |
Кызматтын талаптары
| Концентрация (ng / μl) | Жалпы суммасы (ng) | Көлөмү (μl) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Топурак / Шлайт: 1-2G
● Ичеги-карын мазмуну: 0.5-2G
● Ичеги-карын мазмунунт: үтүктүрүү: 0.1-0,25г
● ӨСҮМҮНҮН БӨЛҮМҮ (Чөкмө чөкмө): 0.1-0.5g
● Ферментация сорпосу байытылган чөкмө: 0.1-0.5g
● Faechs (Чоң жаныбарлар): 0.5-2G
● Faech (чычкан): 3-5graine
● Өпкө алвеолярдык суюктук суюктук: Фильтр кагаз
● кындын SPAB: 5-6
● Терини / жыныс / шилекей / оозеки жумшак ткандардын / фаринжеал SPAB / Rectal SPAB: 2-3
● Бөлүмдүн микроорганизмдери: чыпка кагаз
● суу / аба / biofilm: фильтр кагаз
● Эндофитес: 1-2г
● Тиш планы: 0.5-1g
Кызматтын агымы
Үлгү жеткирүү
Китепкана курулушу
Sequencing
Маалыматтарды талдоо
Сатуу кызматтары
Төмөнкү анализди камтыйт:
- Маалыматтын сапатын контролдоо
- Otu Clustering / de-ызы-чуу (ASV)
- OTU аннотациясы
- Альфа түрүн анализ: Шеннон, Симпсон жана Ace, анын ичинде бир нече индекстер.
- BETAнын ар түрдүүлүгүн анализдөө
- Топтардык анализ
- Корреляциялык анализ: Экологиялык факторлордун ортосунда жана курамы менен ар түрдүүлүгү ортосунда
- 16s функционалдык жин божомолу
Таксономикалык бөлүштүрүүнүн гистограммасы
Таксономикалык молчулук Clustering жылуулук картасы
Альфа түрүн анализ: Сейрек ийри
BETAнын ар түрдүүлүгүн анализдөө: nmds
Интергроплинг анализи: Lefse Biorker ачылышы
БМКЖЕНДУН АМПЛОНОНУН ОРУМИНАСЫ ЖОЛУГУШУУЧУЛАРЫ ЖОЛУГУШУУЧУЛАРЫ ЖОЛУГУШУУЧУЛАРЫНЫН ИЛИМИНАСЫ ЖОЛУГУШУУЧУЛАРЫ ЖОЛУГУШУУЧУЛАРЫНЫН ИЛИМИНАСЫ
Донг, С. (2022) "Микробиологиядагы чек ара" Микробиология боюнча чейректери ", микоммиялыктардын чыр-чатактары жана үрөн санап, микробиота, 13. DOI: 10.3389 / FMICB.2022.855317 / Full.
Ли, Ю. (2023) "Гардерелла Вагиналисттик Вагиналисттик Вагинозду дарылоо үчүн" синтетикалык бактериялык консорциация "Микробиому, 11 (1), 1-14-бб. DOI: 10.1186 / S40168-023-01497-y
Ян, Дж., Дж., Дж., Фу, Ю. (202). 1-20. DOI: 10.1186 / S40793-022-00399-0 / цифралар / 8.
Иин, С. жана башкалар. (2022) "Азотка трансформациясына байланышкан азоттун өзгөрүүсүнө байланыштуу функционалдык гендердин көп молчулугу", биоресурсия технологиясы, 361, б. 127678. DOI: 10.1016 / j.biortech.2022.127678.
