-
BMKMANU S3000_Transkriptoma Cihanî
Transkriptomîka mekanî li pêşiya nûjeniya zanistî radiweste, û lêkolîneran hêz dide ku di nav tevnehev de şêwazên vegotina genê yên tevlihev bişopînin dema ku çarçoweya cîhê xwe biparêzin. Di nav platformên cihêreng de, BMKGene Çîpa Transcriptome ya Cihanî ya BMKManu S3000 pêşve xistiye, ku xwedan çareseriyek pêşkeftî ya 3,5 μm ye, digihîje rêza binehucreyî, û mîhengên çareseriya pir-astî dike. Çîpa S3000, ku bi qasî 4 mîlyon deqan vedihewîne, mîkrobeşên ku bi bejên ku bi sondayên girtina barkodkirî yên cihî hatine barkirin, bikar tîne. Pirtûkxaneyek cDNA, ku bi barkodên cîhê ve hatî dewlemend kirin, ji çîpa S3000 tê amadekirin û dûv re li ser platforma Illumina NovaSeq tê rêz kirin. Kombûna nimûneyên barkodkirî yên cîh û UMI rastbûn û taybetmendiya daneya hatî çêkirin piştrast dike. Çîpa BMKManu S3000 zehf pirreng e, mîhengên çareseriyê yên pir-astî pêşkêşî dike ku dikarin bi hûrgulî li tevnheviyên cihêreng û astên hûrgulî yên xwestinê werin guheztin. Vê adaptebûnê çîpê wekî vebijarkek berbiçav ji bo lêkolînên cihêreng ên transkriptomîk ên cîhê cîh digire, komkirina cîhê ya rastîn bi dengek hindiktirîn misoger dike. Bikaranîna teknolojiya dabeşkirina hucreyê bi BMKManu S3000 veqetandina daneyên veguheztinê li ser sînorên hucreyan pêk tîne, di encamê de analîzek ku xwedan wateya rasterast a biyolojîk e. Digel vê yekê, çareseriya pêşkeftî ya S3000 encam dide ku hejmareke zêde ya gen û UMI-yên ku li ser hucreyê têne tespît kirin, analîzek pir rasttir a şêwazên veguheztina cîh û komkirina hucreyan dike.
-
Rêzkirina ARNyê ya yek-nokî
Pêşkeftina girtina yek-hucreyê û teknîkên avakirina pirtûkxaneyên xwerû, digel rêzgirtina berbi bilind, lêkolînên derbirrîna genê di asta hucreyê de şoreş kir. Ev serkeftin rê dide analîzên kûr û berfirehtir ên nifûsa hucreyên tevlihev, derbaskirina tixûbên ku bi navgîniya vegotina genê li ser hemî hucreyan ve girêdayî ne û heterojeniya rastîn di nav van nifûsan de biparêze. Digel ku rêzgirtina RNA-ya yek-hucreyê (scRNA-seq) xwedan avantajên nayên înkar kirin, ew di hin tevnvîsan de bi dijwariyan re rû bi rû dimîne ku çêkirina suspensionek yek-hucreyê dijwar xuya dike û nimûneyên nû hewce dike. Li BMKGene, em vê astengiyê bi pêşkêşkirina rêziknameya RNA-ya yek-nukleus (snRNA-seq) bi karanîna teknolojiya pêşkeftî ya 10X Genomics Chromium re çareser dikin. Ev nêzîkatî di asta yek-hucreyê de spektora nimûneyên ku ji analîza transkrîptomê re têkildar in berfireh dike.
Veqetandina navokan bi çîpa nûjen a 10X Genomics Chromium, ku bi pergalek mîkrofluîdîk a heşt-kanal ve bi derbasbûna ducar ve tê de, pêk tê. Di hundurê vê pergalê de, berikên gêlê ku barkod, primmer, enzîm û yek nucleus vedigirin di nav dilopên rûnê yên bi mezinahiya nanolîterê de têne qewirandin, û Gel Bead-in-Emulsion (GEM) ava dikin. Piştî avakirina GEM, lîza hucreyê û berdana barkodê di nav her GEM de pêk tê. Dûv re, molekulên mRNA di cDNA-yê de veguherînek berevajî derbas dibin, barkodên 10X û Nasnameyên Molekulî yên Yekta (UMI) vedigirin. Dûv re van cDNA di bin avakirina pirtûkxaneya rêziknameya standard de têne kirin, ku di asta yek-hucreyê de vekolînek zexm û berfireh a profîlên vegotina genê hêsan dike.
Platform: 10× Platforma Genomics Chromium û Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Transkriptomîka mekanî teknolojiyek pêşkeftî ye ku destûrê dide lêkolîneran ku li ser şêwazên vegotina genê di nav tevnan de lêkolîn bikin di heman demê de ku çarçoweya cîhê xwe diparêzin. Yek platformek hêzdar a di vê domanê de 10x Genomics Visium e ku bi rêzgirtina Illumina re têkildar e. Prensîba 10X Visium li ser çîpek pispor a bi deverek girtina destnîşankirî ye ku li wir beşên tevnvîsê têne danîn. Ev qada girtinê deqên barkodkirî dihewîne, ku her yek bi cîhek cîhek bêhempa ya di nav tevnê de têkildar e. Dûv re molekulên RNA yên ku ji tevneyê hatine girtin, di pêvajoya veguheztina berevajî de bi nasnameyên molekulî yên yekta (UMI) têne nîşankirin. Van deqên barkodkirî û UMI-ê nexşeya cîhê ya rastîn û pîvandina vegotina genê di çareseriyek yek-hucreyê de dihêle. Kombûna nimûneyên barkodkirî yên cîh û UMI rastbûn û taybetmendiya daneya hatî çêkirin piştrast dike. Bi karanîna vê teknolojiya Transcriptomics Spatial, lêkolîner dikarin têgihîştinek kûr a rêxistina cîhê ya hucreyan û danûstendinên molekulî yên tevlihev ên ku di hundurê tevneyan de çêdibin, peyda bikin, li ser mekanîzmayên ku di binê pêvajoyên biyolojîkî de di gelek waran de, di nav de onkolojî, neuroscience, biyolojiya pêşkeftinê, immunolojî de têgihiştinek bêqîmet peyda dikin. , û lêkolînên botanîkî.
Platform: 10X Genomics Visium û Illumina NovaSeq
